Nasiona orkiszu to rodzaj ziarna podobny do zbóż takich jak pszenica czy żyto. Wybierając najlepsze nasiona orkiszu, należy przede wszystkim wziąć pod uwagę sposób, w jaki są one fizycznie przechowywane, ponieważ wilgoć może spowodować utratę składników odżywczych przez nasiona, a także powolne uszkodzenie nasion. W zależności od sposobu przygotowania nasion orkiszu do sprzedaży, niektóre rodzaje mogą być lepsze do niektórych celów, takie jak całe nasiona na mąkę lub zapieczętowane, świeże nasiona do kiełkowania. Jeśli to możliwe, najlepsze nasiona orkiszu nie będą pakowane więcej niż kilka miesięcy przed zakupem i użyciem, ponieważ czas zmniejszy zawartość składników odżywczych w nasionach i skuteczność zawartych w nich krótkich glutenów. Niektóre nasiona, takie jak ziarna pszenicy i żyta, mogą być specjalnie przetwarzane, zmniejszając niektóre witaminy zawarte w nasionach, ale ułatwiając ich stosowanie podczas gotowania i pieczenia.
Po zebraniu nasion orkiszu oddziela się je od łodygi i suszy, aby starczyło na dłużej. Suszone nasiona są zwykle bardzo wrażliwe na wilgoć w środowisku, co oznacza, że będą wchłaniać nadmiar wilgoci z powietrza. Z biegiem czasu niewłaściwie przechowywane nasiona mogą wchłonąć wystarczającą ilość wilgoci, aby na ich powierzchni pojawiła się pleśń lub grzyb, albo zaczęły się rozkładać od wewnątrz. Wybierając nasiona orkiszu, ważne jest, aby spojrzeć na nasiona lub mieć pewność, że są one przechowywane w środowisku o niskiej wilgotności, aby uzyskać najlepszy produkt.
Podobnie jak inne produkty pełnoziarniste, nasiona orkiszu można przygotować na wiele sposobów. Zewnętrzna łuska nasion jest bardzo trudna do usunięcia, dlatego wiele nasion sprzedawanych jest w całości z dołączonymi łuskami. Całe nasiona najlepiej używać po zamienieniu na mąkę lub gdy są przygotowywane powoli, z długim czasem namaczania lub duszenia. Nasiona mogą być również popękane lub łuszczone, dzięki czemu wewnętrzna część nasion jest odsłonięta, a orkisz gotuje się szybciej, chociaż usunięcie całej łuski usuwa niektóre składniki odżywcze.
Do kiełkowania orkiszu stosuje się jeden odrębny rodzaj nasion orkiszu. Można je sprzedawać, gdy są bardzo świeże i generalnie nie są poddawane procesom żywieniowym, takim jak napromienianie, które mogłoby zmniejszyć ryzyko kiełkowania. Chociaż istnieje niewielka szansa, że jakikolwiek rodzaj nasion orkiszu wykiełkuje, szczególnie pakowane nasiona kiełkujące będą miały znacznie wyższy wskaźnik sukcesu. Alternatywnie, niektóre nasiona są sprzedawane już porośnięte i będą miały inne wartości odżywcze oraz nieco inny, mniej orzechowy smak.