Najlepszym lekarstwem na bakteryjne zapalenie pochwy jest zwykle lek na receptę. Antybiotyki, przyjmowane doustnie lub wprowadzane do pochwy, zwykle skutecznie pozbywają się bakterii odpowiedzialnych za bakteryjne zapalenie pochwy. Dla większości kobiet antybiotyki doustne są najlepszym sposobem leczenia bakteryjnego zapalenia pochwy, ponieważ te, które są wprowadzane do pochwy, są często nieco mniej skuteczne. Czasami kobieta może również rozważyć domowe lekarstwo na bakteryjne zapalenie pochwy, ale domowe środki zaradcze zwykle nie są skuteczne w leczeniu tej konkretnej infekcji bakteryjnej.
W większości przypadków najlepszym lekarstwem na bakteryjne zapalenie pochwy jest antybiotyk zwany metronidazolem, który jest często sprzedawany pod marką Flagyl®. Metronidazol jest zwykle przepisywany w postaci tabletek, ale można go również podawać przez pochwę. Forma żelu, która jest wprowadzana do pochwy w celu leczenia bakteryjnego zapalenia pochwy, jest określana jako Metrogel®. Kobieta może również użyć żelu o nazwie klindamycyna jako alternatywy dla Metrogel®. Warto jednak zauważyć, że niektóre przypadki bakteryjnego zapalenia pochwy ustępują samoistnie.
Ogólnie rzecz biorąc, doustny metronidazol jest skuteczniejszy w leczeniu bakteryjnego zapalenia pochwy niż aplikacje dopochwowe. Jednak w niektórych przypadkach kobieta może preferować lek podawany dopochwowo, mimo że jest on nieco mniej skuteczny niż lek doustny. Wynika to z faktu, że niektórzy ludzie zgłaszali nieprzyjemne skutki uboczne podczas przyjmowania metronidazolu. Efekty uboczne mogą również wystąpić w przypadku żeli dopochwowych, ale zwykle są one niewielkie i mniej podatne na rozwój.
Chociaż metronidazol jest zwykle uważany za najlepszy lek na bakteryjne zapalenie pochwy, istnieją inne antybiotyki, które również mogą okazać się skuteczne. Jedną z alternatywnych metod leczenia bakteryjnego zapalenia pochwy jest tinidazol. Chociaż może nie być tak skuteczny w leczeniu bakteryjnego zapalenia pochwy jak metronidazol, jest uważany za niezawodne leczenie. Wiąże się to również z mniejszą liczbą skutków ubocznych niż metronidazol.
Kobieta może również odczuwać pokusę wypróbowania domowego środka na bakteryjne zapalenie pochwy. Zwykle jednak domowe środki zawodzą, a kobieta może nadal potrzebować leczenia po ich wypróbowaniu. Lekarze zazwyczaj zalecają jednak leczenie, ponieważ infekcja bakteryjna może powodować komplikacje. Na przykład bakteryjne zapalenie pochwy może prowadzić do poronienia, przedwczesnego porodu i poporodowej infekcji macicy. Nieleczona bakteryjna zapalenie pochwy może również przyczyniać się do rozwoju zapalenia narządów miednicy mniejszej, co może prowadzić do ciężkiej choroby i trwałej bezpłodności.