Leki na bakteryjne zapalenie pochwy zazwyczaj mają postać antybiotyków. Czasami bakteryjne zapalenie pochwy ustępuje samoistnie bez żadnego leczenia. Osobom, które wymagają leczenia bakteryjnego zapalenia pochwy, przepisuje się zwykle metronidazol lub klindamycynę, które są dwoma rodzajami antybiotyków. Oba te antybiotyki występują w postaci tabletek lub kremów umieszczanych w pochwie. Większość bakteryjnych infekcji pochwy zwykle ustępuje w ciągu dwóch lub trzech dni po rozpoczęciu leczenia antybiotykami, ale lekarze zwykle zalecają kobietom przyjmowanie antybiotyków przez co najmniej tydzień, nawet jeśli objawy ustąpią.
Wiele kobiet z bakteryjnym zapaleniem pochwy nie odczuwa żadnych objawów iz tego powodu mogą nie zdawać sobie sprawy, że mają infekcję. Fakt, że bakteryjne zapalenie pochwy czasami ustępuje samoistnie, oznacza, że niektóre kobiety mogą nie być świadome, że kiedykolwiek ją miały, zwłaszcza jeśli objawy nie występowały. Kobieta nie powinna odkładać leczenia bakteryjnego zapalenia pochwy, ponieważ wierzy, że jej infekcja zniknie bez leczenia. Mimo że bakteryjne zapalenie pochwy czasami ustępuje bez leczenia, może się znacznie pogorszyć, zanim stanie się lepsze. Zazwyczaj uważa się, że najlepiej udać się do lekarza lub ginekologa, gdy tylko pojawią się objawy bakteryjnego zapalenia pochwy, aby problem się nie pogorszył.
Lekarz zazwyczaj ocenia objawy kobiety, a także przeprowadza badanie miednicy przed przepisaniem leków na bakteryjne zapalenie pochwy. Objawy bakteryjnego zapalenia pochwy są często podobne do objawów infekcji drożdżakowej iz tego powodu wiele kobiet może sądzić, że ma infekcję drożdżakową. Często dopiero, gdy kobieta próbuje leczyć bakteryjne zapalenie pochwy za pomocą dostępnego bez recepty kremu na drożdżaki, zdaje sobie sprawę, że ma inny problem, ponieważ lek na zakażenie drożdżakami jest nieskuteczny w walce z bakteryjnym zapaleniem pochwy. Lekarze mogą zwykle przeprowadzić badanie miednicy i pobrać próbkę wydzieliny z pochwy, aby sprawdzić oznaki bakteryjnego zapalenia pochwy. Próbka, którą otrzyma lekarz, pokaże bakterie obecne w wydzielinie, jeśli kobieta ma bakteryjne zapalenie pochwy, a nie infekcję drożdżakową.
Leki antybiotykowe na bakteryjne zapalenie pochwy są często skuteczne natychmiast. Objawy zwykle ustępują po pierwszym lub dwóch dniach przyjmowania antybiotyków. Antybiotyki są zwykle podawane w postaci kremów lub żeli do wprowadzenia do pochwy. Kobietom w ciąży z bakteryjnym zapaleniem pochwy zazwyczaj przepisuje się antybiotyki w postaci tabletek, ponieważ wprowadzenie leku do pochwy podczas ciąży może nie być bezpieczne dla płodu. Jeśli antybiotyki nie będą przyjmowane przez cały okres, w którym zostały przepisane, istnieje szansa, że infekcja powróci.