Mocznik jest stosowany w kilku nowych modelach pojazdów z silnikami wysokoprężnymi jako tłumik emisji po spalaniu. Uzasadnieniem tej technologii jest kontrola stężenia tlenku azotu (NOx) w spalinach silników o zapłonie samoczynnym (CI). NOx to naturalny produkt uboczny systemów CI i główny czynnik przyczyniający się do zanieczyszczenia powietrza. Wartość stosowania mocznika w układach wydechowych pojazdów napędzanych olejem napędowym wynika ze zdolności substancji chemicznej do przekształcania większości składników NOx zawartych w gazach w nieszkodliwy azot i wodę. To zastosowanie mocznika w pojazdach z silnikami wysokoprężnymi jest zazwyczaj osiągane przez wtryskiwanie drobnego rozpylonego mocznika do katalizatora spalin, tym samym skutecznie neutralizując znaczny procent szkodliwej zawartości NOx w spalinach.
Układy z zapłonem sprężonym wytwarzają temperatury i ciśnienia znacznie wyższe niż w silnikach benzynowych z zapłonem iskrowym. W tych warunkach w spalinach silników wysokoprężnych występuje wysoki poziom tlenku azotu. Globalne obawy dotyczące rosnącego negatywnego wpływu emisji NOx, ponieważ zanieczyszczenia powietrza skłoniły wiele krajów do wprowadzenia rygorystycznych środków kontroli NOx dotyczących nowych pojazdów napędzanych silnikami wysokoprężnymi. Kontrole te wykazały rosnące wykorzystanie mocznika w układach silników wysokoprężnych; kilku czołowych producentów samochodów wprowadza wtrysk mocznika do standardowego wyposażenia swoich nowych modeli z silnikiem Diesla.
Stosowanie mocznika w silnikach Diesla koncentruje się wokół naturalnego rozkładu niebezpiecznych NOx na nieszkodliwą wodę i azot. Większość nowych samochodów z silnikiem Diesla jest wyposażonych w wielostopniowe systemy zarządzania emisją spalin, które stopniowo oddzielają sadzę i NOx od spalin, a faza wtrysku mocznika jest jednym z ostatnich etapów. Wprowadzenie mocznika odbywa się w sekcji selektywnego katalizatora katalitycznego (SCR), gdzie cienki strumień połączony z oddzielnym zbiornikiem mocznika rozpyla drobną mgiełkę cieczy w spalinach bogatych w NOx. Spaliny uwalniane następnie do atmosfery są prawie całkowicie wolne od sadzy i NOx.
Obecnie kilku producentów samochodów twierdzi, że współczynniki konwersji NOx wynoszą 80% lub więcej, stosując mocznik w pojazdach z silnikami wysokoprężnymi. Redukcje te z pewnością będą miały pozytywny wpływ na środowisko, ale mogą znacznie zwiększyć koszty prowadzenia pojazdu z silnikiem Diesla. Systemy te mogą również powodować niedogodności podczas jazdy z silnikiem Diesla, ponieważ wiele nowych pojazdów z silnikiem Diesla pozwala na ograniczoną liczbę rozruchów tylko wtedy, gdy zbiornik mocznika zostanie wyczerpany przed całkowitym wyłączeniem i pozostawieniem kierowcy na mieliźnie. Na szczęście większość nowych modeli silników Diesla z wtryskiem mocznika jest wyposażona w systemy powiadamiania i ostrzegania, które sygnalizują kierowcy niski poziom mocznika.