Działanie prostaglandyn na mięśnie gładkie umożliwia wykorzystanie hormonu w leczeniu jaskry i niektórych chorób niedokrwiennych. Składające się z nienasyconych kwasów tłuszczowych prostaglandyny regulują przepływ jonów na poziomie komórkowym i mogą być stosowane jako środek wywołujący poród. Niesteroidowe leki przeciwzapalne (NLPZ) zazwyczaj działają jako antagoniści prostaglandyn, zmniejszając gorączkę, stan zapalny i ból. Działania te często powodują również zaburzenia żołądkowo-jelitowe. Stosowanie prostaglandyn jednocześnie z NLPZ zmniejsza możliwe reakcje niepożądane ze strony żołądka.
Travaprost należy do grupy leków znanych jako analogi prostaglandyn, które naśladują działanie związków lipidowych. Lek jest na ogół przepisywany w celu przeciwdziałania ciśnieniu wewnątrzgałkowemu, zwykle towarzyszącemu jaskrze otwartego kąta. Zawarte w preparacie analogi prostaglandyny skutecznie zwiększają odpływ naczyniówkowo-twardówkowy, zmniejszając ciśnienie. Przy podawaniu dożylnym osoby cierpiące na zaburzenia niedokrwienne, do których należy zespół Reynauda, doświadczają coraz rzadszych ataków. Efekt rozszerzenia naczyń spowodowany rozluźnieniem mięśni gładkich prostaglandyn zwiększa przepływ krwi i zmniejsza objawy związane z niedokrwieniem.
Lekarze mogą stosować PGE1 lub alprostadyl do utrzymania otwarcia przewodu tętniczego u niemowląt z rozpoznaniem tych chorób związanych z sercem do czasu interwencji chirurgicznej. Przewód zwykle umożliwia przepływ krwi z tętnicy płucnej w celu ominięcia płuc i powrotu do aorty u nienarodzonych niemowląt. Ta zastawka zwykle zamyka się wkrótce po urodzeniu, ale może powodować stres u niemowląt cierpiących na anomalie serca lub płuc. Utrzymanie tego otworu zmniejsza obciążenie serca i omija uszkodzone naczynia.
Mężczyźni z zaburzeniami erekcji mogą również otrzymywać recepty na Alprostadil. Ponieważ lek zazwyczaj rozluźnia mięśnie gładkie tętnic, zwiększa się przepływ krwi do prącia. Przy odpowiednim lub zwiększonym przepływie krwi mężczyźni zazwyczaj osiągają erekcję. Lek można wstrzykiwać bezpośrednio do jamy jamistej prącia lub wprowadzać w postaci granulek do otworu cewki moczowej.
Lek dinoproston podawany dopochwowo w postaci żelu lub czopka zazwyczaj wywołuje poród. Hormony prostaglandynowe, znane jako PGE2, rozluźniają włókna mięśni gładkich macicy, które dojrzewają szyjkę macicy, powodując rozszerzenie i przerzedzenie. Preparat zazwyczaj również inicjuje skurcze macicy. Lekarze położnicy mogą również stosować PGE2 po porodzie w celu utrzymania napięcia macicy. Kiedy macica traci napięcie lub zdolność do prawidłowego skurczu, zwiększa się przepływ krwi, co może powodować krwotok.
NLPZ na ogół hamują działanie prostaglandyn. Niektóre z tych efektów zwykle chronią wrażliwą wyściółkę przewodu pokarmowego. Bez tych właściwości ochronnych może wystąpić owrzodzenie. Mizoprostol jest analogiem prostaglandyny, który zwiększa produkcję wodorowęglanów i śluzu. Zwiększona ochrona błon śluzowych zmniejsza prawdopodobieństwo urazu wewnętrznego spowodowanego przez NLPZ.