Na produkcję prostaglandyn wpływa wiele czynników, w tym naturalne procesy organizmu, dieta i leki. Organizm wytwarza prostaglandyny w odpowiedzi na uszkodzenie tkanek lub naczyń krwionośnych. Spożywanie różnych rodzajów tłuszczów w diecie stymuluje organizm do produkcji prostaglandyn, niektórych korzystnych, a innych potencjalnie szkodliwych. Wreszcie, produkcję prostaglandyn można kontrolować za pomocą niesteroidowych leków przeciwzapalnych (NLPZ), takich jak aspiryna.
Wytwarzanie przez organizm pochodnej kwasu tłuszczowego prostaglandyny ma wpływ na prawie każdy narząd ciała. Niektóre prostaglandyny powodują stan zapalny, gorączkę i ból w odpowiedzi na chorobę lub uraz, podczas gdy inne typy hamują reakcję zapalną. Prostaglandyny powodują również skurcze macicy podczas ciąży. Działają w sposób podobny do hormonów, ponieważ powodują zmiany w procesach zachodzących w organizmie, ale są wytwarzane w komórkach organizmu w obszarze, w którym ich działanie jest wymagane.
Aspiryna i inne NLPZ działają w celu zmniejszenia produkcji prostaglandyn oraz zmniejszenia bólu i stanu zapalnego, ale także hamują wytwarzanie korzystnych prostaglandyn. Inna klasa leków, zwana selektywnymi inhibitorami COX-2, działa w celu zmniejszenia jedynie prozapalnej produkcji prostaglandyn, pozostawiając same korzystne prostaglandyny.
Produkcja prostaglandyn odgrywa ważną rolę w wywoływaniu skurczów macicy, które prowadzą do porodu. W celu wywołania porodu prostaglandyny można aplikować na szyjkę macicy lub przyjmować doustnie. Co ciekawe, płyn nasienny zawiera również prostaglandyny, co prowadzi do obalonej naukowo teorii, że stosunek płciowy stymuluje poród.
Ponieważ prostaglandyny są otrzymywane i syntetyzowane z kwasów tłuszczowych, dieta może być stosowana albo do tłumienia antagonistycznych prostaglandyn, które powodują ból i stan zapalny, albo do stymulowania korzystnej produkcji prostaglandyn w celu zmniejszenia stanu zapalnego. Pokarmy bogate w nasycone tłuszcze zwierzęce, takie jak czerwone mięso i nabiał, zawierają kwas arachidonowy (AA). Ten kwas tłuszczowy jest prekursorem antagonistycznego wytwarzania prostaglandyn, które powodują stan zapalny w organizmie, w tym rodzaj prostaglandyny, która nasila skurcze macicy.
Pokarmy zawierające oleje roślinne i witaminy z grupy B, takie jak orzechy i nasiona, zawierają kwas linolowy (LA), który w organizmie jest przekształcany w kwas gamma-linolowy (GLA). LA i GLA stymulują przeciwzapalną produkcję prostaglandyn. Oleje rybie zawierające kwas eikozapentaenowy (EPA), olej z wiesiołka i suplementy oleju z ogórecznika również zawierają duże ilości GLA.
Inne substancje mogą zwiększać korzystną produkcję prostaglandyn, jednocześnie hamując zapalne prostaglandyny. Bromelaina jest substancją enzymatyczną pochodzącą z ananasa, która była historycznie stosowana w leczeniu stanów zapalnych. Chociaż wyniki były mieszane, niektóre badania pokazują, że hamuje on zapalne prostaglandyny wytwarzane w wyniku choroby zwyrodnieniowej stawów, zaburzeń trawienia i zapalenia zatok. Kurkuma, mangostan i granat również wykazały właściwości hamujące prostaglandyny i powinny być dalej badane pod kątem ich wpływu na produkcję prostaglandyn.