Niepowodzenie podwiązania jajowodów jest dość rzadkim zjawiskiem, ale kiedy już się zdarzy, jest to zwykle spowodowane jedną z kilku powszechnych przyczyn. Zabieg może zostać wykonany nieprawidłowo, pozostawiając przejście dla komórki jajowej i nasienia. W niektórych przypadkach końce rurek mogą zrosnąć się z powrotem. Gdy jajowody są zamykane za pomocą zacisków lub pierścieni, urządzenia te mogą się poluzować lub wyślizgnąć, ponownie otwierając jajowody. Kobiety mogą również nie być w stanie normalnie zajść w ciążę, ale są bardziej podatne na ciąże pozamaciczne po podwiązaniu jajowodów.
Jedną z najczęstszych przyczyn niepowodzenia tej procedury jest jej nieprawidłowe wykonanie. Jeśli chirurg nie ma wystarczających umiejętności, aby prawidłowo wykonać podwiązanie lub napotka problemy z niezbędnym instrumentem, takim jak laparoskop, rurki mogą nie zostać całkowicie zamknięte. Mogą być pozostawione częściowo odblokowane lub urządzenia służące do ich zamykania mogą być umieszczone w niewłaściwym miejscu. Kobiety z pewnymi schorzeniami fizycznymi, takimi jak otyłość lub zrosty miednicy, mogą również być trudniejsze do prawidłowego wykonania zabiegu. Czasami chirurg może nieprawidłowo związać więzadła okrągłe w pobliżu macicy, ponieważ są one mylone z jajowodami.
Kolejną kwestią, która często powoduje awarię, jest ponowne założenie rurek. Ten proces, zwany samoistnym ponownym zespoleniem, może wystąpić, jeśli końce odciętej rurki nie są wystarczająco od siebie oddalone. Mogą również wystąpić problemy ze szwami używanymi w zabiegu, które umożliwiają ponowne zrastanie się końcówek. W niektórych przypadkach w miejscu przecięcia rurek może powstać przetoka lub endometrioza, tworząc między nimi przejście.
Kobiety, które mają pewne rodzaje zabiegów, częściej doświadczają niepowodzenia podwiązania jajowodów niż inne. Urządzenia takie jak pierścienie, pętle lub zaciski, które utrzymują rurki zamknięte, ale w rzeczywistości ich nie uszkadzają, mogą być nieprawidłowo umieszczone lub mogą się ześlizgnąć, aby nie blokowały już całkowicie przepływu plemników lub komórek jajowych. Procedury, które w większym stopniu uszkadzają rurki poprzez ich cięcie, bliznowacenie lub spalanie, są znacznie mniej podatne na niepowodzenie.
Chociaż procedura podwiązania jajowodów może zatrzymać przejście komórki jajowej, jeśli pozostanie nawet mały kanał otwarty, mniejsze plemniki mogą się przez niego przedostać. Może to spowodować ciążę pozamaciczną. Jest to nie tylko niepowodzenie zabiegu, ale może również zagrażać życiu kobiety.