Wytwarzanie zielonej flegmy jest zwykle wynikiem walki organizmu z infekcją zatok lub dróg oddechowych. W rzeczywistości często wskazuje to, że organizm skutecznie pozbywa się inwazyjnego wirusa lub bakterii; zielony kolor pochodzi od enzymów w komórkach odpornościowych, które reagują na chorobę. Rodzaje infekcji, które powodują zielonkawą flegmę, mogą powstać z różnych powodów. Choroby płuc, takie jak zapalenie oskrzeli lub zapalenie płuc, mogą być powodowane przez bakterie, wirusy lub grzyby. Podrażnienie zatok suchym powietrzem lub alergenami może sprawić, że będą one podatne na atak różnych infekcji. Osoby z astmą są często podatne na infekcje płuc z powodu podrażnienia dróg oddechowych, podobnie jak osoby palące.
Osoby cierpiące na infekcje dróg oddechowych często odkrztuszają flegmę, ponieważ ich ciała pracują nad zwalczaniem i usuwaniem zarazków. Jest to bardzo powszechne w przypadku infekcji górnych dróg oddechowych, które często są wywoływane przez wirusy. Jest również często obserwowany w przypadku cięższych infekcji, takich jak zapalenie płuc i zapalenie oskrzeli. Ludzie z rakiem płuc czasami produkują i wydalają zielonkawą flegmę.
Zielona flegma może również wytwarzać się w zatokach i być wydalana z nosa. Kiedy zatoki ulegają podrażnieniu, a powietrze i śluz nie mogą się przez nie swobodnie przemieszczać, stają się pożywką dla wirusów lub bakterii, co często prowadzi do infekcji zatok. Osoby z infekcjami zatok często zauważą zielony śluz wydobywający się z nosa, a także spływający do gardła; nie należy go jednak połykać, jeśli to w ogóle możliwe, ponieważ zawiera wysoki poziom czynników zakaźnych. Podrażnienie zatok jest często wynikiem czynników środowiskowych; Wszystkiemu winne może być nadmierne narażenie na suche powietrze lub czynniki drażniące lub alergeny, takie jak dym, kurz lub pyłki.
Pacjenci z astmą są często podatni na rodzaje problemów, które prowadzą do zielonej flegmy. Choroba często podrażnia i rozpala drogi oddechowe w płucach, otwierając je na atak patogenów. Ponieważ astma jest problemem ciągłym, osoby cierpiące na tę chorobę często muszą radzić sobie z powtarzającymi się przypadkami tego typu infekcji.
Inną częstą przyczyną rodzajów infekcji, które tworzą zieloną flegmę, jest palenie. Wdychanie dymu papierosowego podrażnia drogi oddechowe w płucach i pozostawia w płucach małe cząsteczki. Ten rodzaj uszkodzeń i nagromadzenia osłabia je i ułatwia infekcję.