Iwermektyna dla koni to jedna z najskuteczniejszych metod leczenia i profilaktyki pasożytów. Lek zwalcza 35 różnych organizmów pasożytniczych, w tym słupkowce, wiele rodzajów robaków i boty. Robaki, które może leczyć i kontrolować, obejmują owsiki, nicienie płucne i robaki jelitowe. Uważany jest za bezpieczny do stosowania u wszystkich koni, chociaż producenci odradzają stosowanie go u zwierząt przeznaczonych do spożycia. Iwermektyna paraliżuje neuroprzekaźnik kwasu gamma-aminomasłowego (GABA) u pasożytów. Kwas ten jest unikalny dla organizmów pasożytniczych, dlatego typowa dawka iwermektyny nie będzie miała wpływu na kręgowce, takie jak konie. Może zapobiegać nowym infekcjom pasożytniczym, a także niszczy aktywne infekcje.
Właściciele mogą kupić iwermektynę dla koni w postaci pasty. Jest często sprzedawany w plastikowej strzykawce, która zawiera wystarczającą ilość leku dla jednego lub więcej dorosłych koni. W celu podania leku końcówkę strzykawki należy włożyć do pyska konia. Pasta jest następnie wstrzykiwana na tylną część języka zwierzęcia. Właścicielom często radzi się, aby trzymali głowę konia w górze, aby nie mógł wypluć leku. Uważa się, że bardzo trudno jest spowodować przedawkowanie podczas stosowania iwermektyny dla koni. Wiadomo, że zwierzęta połykają do dziewięciu razy więcej niż zalecana dawka bez żadnych skutków ubocznych. Podawanie iwermektyny w celu zwalczania pasożytów można rozpocząć, gdy koń jest w wieku od sześciu do ośmiu tygodni.
Lek jest tak skuteczny w zwalczaniu pasożytów, że weterynarze często zalecają od czasu do czasu zamianę go na inny rodzaj leczenia. Problem polega na tym, że pasożyty w końcu rozwiną u koni oporność na iwermektynę, co sprawi, że stanie się ona nieskuteczna. Jednocześnie weterynarze ostrzegają przed zbyt częstą rotacją odrobaczków i twierdzą, że może to spowodować, że pasożyty rozwiną oporność na wiele leków jednocześnie. Zalecanym sposobem postępowania jest ścisła współpraca z weterynarzem przy podawaniu programu leczenia odrobaczania koni.
Od czasu do czasu wiadomo, że stosowanie iwermektyny u koni powoduje działania niepożądane. U niektórych koni po leczeniu iwermektyną z powodu mikrofilarii nicieni szyjkowych wystąpił obrzęk i swędzenie. Uważa się, że reakcje były wynikiem jednoczesnego obumierania dużej liczby mikrofilarii. Iwermektyna jest uważana za wyjątkowo bezpieczną dla koni, ale ostrzega się ludzi, aby myli ręce po kontakcie z lekiem. Zużytych strzykawek z iwermektyną nie należy wyrzucać do źródła wody ze względu na możliwość uszkodzenia lub śmierci bezkręgowców znajdujących się w wodzie.