Η κύρια διαφορά μεταξύ φυτοφαρμάκου και ζιζανιοκτόνου είναι ότι ένα φυτοφάρμακο χρησιμοποιείται γενικά για να σκοτώσει ή να απωθήσει παράσιτα όλων των τύπων, συμπεριλαμβανομένων των εντόμων και περιστασιακά φυτών, και ένα ζιζανιοκτόνο είναι συνήθως σχεδιασμένο για να σκοτώνει ορισμένους τύπους φυτών, όπως τα ζιζάνια και άλλα προβληματικά είδη φυτών . Το φυτοφάρμακο είναι ένας όρος που είναι αρκετά ευρύς επειδή υπάρχουν πολλοί διαφορετικοί τύποι προϊόντων, συμπεριλαμβανομένων των ζιζανιοκτόνων, που εμπίπτουν στην ταξινόμηση των φυτοφαρμάκων. Κάθε προϊόν που έχει σχεδιαστεί για να αντιμετωπίζει κάποιο είδος παρασίτων, συμπεριλαμβανομένων των ζωυφίων, των τρωκτικών και των φυτών, θα μπορούσε να θεωρηθεί φυτοφάρμακο. Το ζιζανιοκτόνο είναι ένας όρος που χρησιμοποιείται συνήθως μόνο για να περιγράψει προϊόντα που έχουν σχεδιαστεί για τη θανάτωση ή τον έλεγχο ενοχλητικών φυτών.
Τα περισσότερα φυτοφάρμακα και ζιζανιοκτόνα είναι διαθέσιμα προς πώληση στην πλειονότητα των κέντρων με γκαζόν και κήπους. Και οι δύο τύποι προϊόντων μπορούν να είναι είτε με χημική βάση είτε να παρασκευάζονται με φυσικά συστατικά. Τα φυτοφάρμακα χρησιμοποιούνται για τον έλεγχο των ζωυφίων, των ζιζανίων και των τρωκτικών καθώς και για μύκητες και φύκια. Δεν είναι όλα τα φυτοφάρμακα ελέγχου όλων των τύπων παρασίτων, και οι άνθρωποι πρέπει κανονικά να αναζητήσουν συγκεκριμένους τύπους φυτοφαρμάκων για να αντιμετωπίσουν τα μεμονωμένα προβλήματα παρασίτων τους. Τα ζιζανιοκτόνα, τα οποία γενικά χρησιμοποιούνται για τον έλεγχο της ανεπιθύμητης ανάπτυξης των φυτών, είναι τυπικά διαθέσιμα είτε σε επιλεκτικές είτε σε μη εκλεκτικές μορφές.
Τα επιλεκτικά ζιζανιοκτόνα δημιουργούνται είτε για τη θανάτωση είτε για τον έλεγχο ενός συγκεκριμένου τύπου ή τύπων φυτών. Τα επιλεκτικά ζιζανιοκτόνα μπορεί να είναι πιο επιθυμητά για ένα άτομο με κήπο που θέλει να απαλλαγεί από ορισμένα ενοχλητικά είδη φυτών χωρίς να βλάψει την πιο επιθυμητή ανάπτυξη των φυτών. Τα μη εκλεκτικά ζιζανιοκτόνα γενικά σκοτώνουν οποιοδήποτε είδος φυτού έρχονται σε επαφή. Η ποικιλία μη εκλεκτικού ζιζανιοκτόνου χρησιμοποιείται συχνά σε πεζοδρόμια, δρόμους και δρόμους για να απαλλαγούμε από την ανάπτυξη που εμφανίζεται σε ρωγμές μεταξύ βράχων ή σκυροδέματος. Τόσο τα επιλεκτικά όσο και τα μη εκλεκτικά ζιζανιοκτόνα θεωρούνται μορφές φυτοφαρμάκων.
Η έκθεση σε φυτοφάρμακα και ζιζανιοκτόνα μπορεί να είναι δυνητικά επιβλαβής ή ακόμη και θανατηφόρα για τον άνθρωπο. Ένα άτομο που έχει μικρά παιδιά ή κατοικίδια μπορεί να θέλει να είναι προσεκτικό όταν χρησιμοποιεί φυτοφάρμακα και ζιζανιοκτόνα, επειδή οι επιπτώσεις των προϊόντων είναι συνήθως χειρότερες σε παιδιά και κατοικίδια. Υπάρχουν ορισμένοι τύποι φυτοφαρμάκων και ζιζανιοκτόνων που δεν έχουν χημική βάση. Μερικά παραδείγματα συστατικών που χρησιμοποιούνται συχνά σε φυσικές ποικιλίες φυτοφαρμάκων και ζιζανιοκτόνων περιλαμβάνουν το neem, το σκόρδο και το σαπούνι. Παρόλο που τα φυσικά προϊόντα θεωρούνται ασφαλέστερα στη χρήση, θα μπορούσαν να προκαλέσουν κάποιο ερεθισμό κατά την επαφή, ιδιαίτερα σε άτομα που έχουν αλλεργίες στα συστατικά και μπορεί επίσης να απαιτούν συχνές εφαρμογές επειδή συνήθως δεν είναι τόσο ισχυρά όσο τα προϊόντα με βάση τη χημική ουσία. .