Η γονιδιωματική και η πρωτεϊνομική είναι στενά συνδεδεμένα επιστημονικά πεδία. Το ένα επικεντρώνεται στη μελέτη του γονιδιώματος, του συνόλου του κληρονομικού υλικού που βρίσκεται σε κάθε κύτταρο του σώματος. Το άλλο είναι η μελέτη των πρωτεϊνών και του πρωτεώματος, η συλλογή μεμονωμένων πρωτεϊνών σε δεδομένα κύτταρα, καθώς και ολόκληρου του σώματος. Η κατανόηση του ενός απαιτείται γενικά για τον άλλο, αλλά είναι δύο διαφορετικά πεδία σπουδών.
Για να διαχωριστεί η μελέτη της γονιδιωματικής από την πρωτεομική, βοηθά να δανειστεί κανείς τη μεταφορά μιας βιβλιοθήκης. Το γονιδίωμα είναι ο κατάλογος καρτών, η λίστα με όλα όσα πρέπει να υπάρχουν στη βιβλιοθήκη. Το πρωτέωμα είναι το πραγματικό περιεχόμενο της βιβλιοθήκης. Οι ερευνητές που μελετούν το γονιδίωμα ενδιαφέρονται να δουν τα χαρακτηριστικά για τα οποία κωδικοποιεί το γονιδίωμα, να κατανοήσουν τον ρόλο του DNA που δεν φαίνεται να κωδικοποιεί τίποτα, όπως κάρτες που αναφέρονται σε βιβλία και βιβλία που έχουν χαθεί από καιρό και να εξετάσουν πώς τα χαρακτηριστικά κληρονομούνται.
Οι άνθρωποι που μελετούν πρωτεομική ενδιαφέρονται για το πώς εκφράζεται πραγματικά το γονιδίωμα στο σώμα. Εξετάζουν πώς σχηματίζονται οι πρωτεΐνες, τι παρεμβαίνει στην παραγωγή πρωτεϊνών, πώς προκύπτουν παραλλαγές πρωτεϊνών και σχετικά θέματα. Η γονιδιωματική και η πρωτεομική είναι σίγουρα συνδεδεμένες, καθώς το γονιδίωμα παρέχει τα προσχέδια για το πρωτεόσωμα. Η χαρτογράφηση και η έρευνα πρωτεϊνών παρέχει στους ερευνητές πληροφορίες σχετικά με το πώς το ίδιο γονίδιο μπορεί να εκφραστεί διαφορετικά σε διαφορετικά άτομα και προσθέτει επίσης διορατικότητα και κατανόηση σε ερευνητές που ενδιαφέρονται να μάθουν πώς συμπεριφέρονται οι πρωτεΐνες στο σώμα.
Τόσο η γονιδιωματική όσο και η πρωτεομική απαιτούν εκτεταμένη επιστημονική εκπαίδευση. Πολλοί άνθρωποι που εργάζονται και στους δύο τομείς έχουν προχωρημένα πτυχία και περνούν μεγάλο μέρος του χρόνου τους στο εργαστήριο. Η δουλειά τους μπορεί επίσης να εφαρμοστεί σε τομείς όπως η φαρμακολογία και η ιατρική, όπου οι άνθρωποι τοποθετούν τις πληροφορίες που συλλέγουν στο εργαστήριο σε πραγματική χρήση στο πεδίο. Υπάρχουν πολλά κοινά ενδιαφέροντα μεταξύ των ερευνητών στη γονιδιωματική και την πρωτεϊνομική.
Η πρώιμη εκπαίδευση και για τους δύο τομείς τείνει να είναι παρόμοια, καθώς οι άνθρωποι πρέπει να μάθουν τις ίδιες βασικές αρχές είτε σκοπεύουν να ξεμπερδέψουν τα μυστήρια του γονιδιώματος είτε μάθουν περισσότερα για τη δομή των πρωτεϊνών. Καθώς οι άνθρωποι εισέρχονται σε πιο προχωρημένες σπουδές, η εργασία τους αρχίζει να αποκλίνει και εισέρχονται σε διαφορετικούς τομείς σπουδών. Οι ερευνητές γονιδιωματικής και πρωτεϊνικής μπορεί να καταλήξουν να εργάζονται σε διαφορετικά εργαστήρια και περιβάλλοντα και να εφαρμόζουν την έρευνά τους με διαφορετικούς τρόπους. ένας ερευνητής γονιδιωματικής, για παράδειγμα, μπορεί να αναγνωρίσει μια αλληλουχία DNA που κωδικοποιεί την έκφραση μιας συγκεκριμένης πρωτεΐνης και ένας ερευνητής πρωτεϊνικής μπορεί να ρίξει φως σε αυτό που κάνει αυτή η πρωτεΐνη.