Το ντίζελ και το βιοντίζελ είναι δύο προϊόντα που μπορούν να επιτελούν την ίδια λειτουργία, αλλά προέρχονται από πολύ διαφορετικές πηγές. Τόσο το ντίζελ όσο και το βιοντίζελ μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τροφοδοσία οχημάτων ντίζελ, όπως αυτοκίνητα, φορτηγά, τρακτέρ και μηχανοκίνητα χλοοκοπτικά. Η κύρια διαφορά μεταξύ αυτών των δύο πηγών καυσίμου είναι ότι το ντίζελ προέρχεται από πετρέλαιο, ένα μη ανανεώσιμο υποπροϊόν ορυκτών καυσίμων, ενώ το βιοντίζελ εξάγεται από φυτικά, σπορέλαια και ζωικά έλαια. Το ντίζελ και το βιοντίζελ διαφέρουν επίσης ως προς τη διαθεσιμότητα. Ενώ το ντίζελ είναι συνήθως ένα τυπικό προϊόν στα περισσότερα πρατήρια καυσίμων, οι προμηθευτές βιοντίζελ είναι συχνά λίγοι.
Οι κινητήρες ντίζελ δημιουργήθηκαν αρχικά για να είναι πιο αποδοτικό προϊόν από τους βενζινοκινητήρες. Το ντίζελ, το οποίο είναι πιο λιπαρό και παχύρρευστο από τη βενζίνη, απαιτεί λιγότερο διύλιση από τη βενζίνη και είναι επίσης γενικά λιγότερο ακριβό. Δημοφιλές από τη βιομηχανία φορτηγών, το ντίζελ προτιμάται συχνά έναντι της βενζίνης για μεγάλα οχήματα που μεταφέρουν βαριά φορτία.
Αν και κάπως πιο αποδοτικό από τη βενζίνη, το κύριο μειονέκτημα του παραδοσιακού ντίζελ είναι η επίδρασή του στο περιβάλλον. Κατά τη διαδικασία καύσης, το ντίζελ εκπέμπει υψηλά επίπεδα αιθάλης και αζώτου, τα οποία μεταφράζονται σε αυξημένη ατμοσφαιρική ρύπανση, αιθαλομίχλη και υψηλές συγκεντρώσεις οξέος στο νερό της βροχής. Επιπλέον, όπως και η βενζίνη, το ντίζελ απελευθερώνει επίσης αέρια του θερμοκηπίου, όπως το μονοξείδιο του άνθρακα, που μπορεί να συμβάλει στην υπερθέρμανση του πλανήτη και στη ζημιά του όζοντος. Ένα άλλο ζήτημα με το παραδοσιακό ντίζελ είναι ότι προέρχεται από μια μη ανανεώσιμη πηγή, το πετρέλαιο, που σημαίνει ότι η υπερβολική χρήση μπορεί να οδηγήσει σε εξάντληση ή ακόμα και πλήρη εξόντωση των φυσικών πόρων. Αν και οι εκπομπές του θερμοκηπίου είναι χαμηλότερες από αυτές που εκπέμπει η βενζίνη, πολλοί περιβαλλοντικοί εμπειρογνώμονες θεωρούν ότι το ντίζελ αποτελεί σοβαρή απειλή για την ποιότητα του αέρα και το περιβάλλον.
Το βιοντίζελ είναι ένα ανανεώσιμο από ντίζελ που παρασκευάζεται από βιοδιασπώμενα έλαια, όπως σογιέλαιο ή φυστικέλαιο. Όταν συνδυάζεται με ορισμένες αλκοόλες, το λίπος σε αυτά τα έλαια δημιουργεί μακριές αλυσίδες μιας χημικής ουσίας γνωστής ως εστέρες, οι οποίες καθιστούν το λάδι χρησιμοποιήσιμο ως καύσιμο. Το βιοντίζελ μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε σχεδόν κάθε κινητήρα ντίζελ με λίγες τροποποιήσεις και χωρίς ζημιά στον κινητήρα. Εκτός από το ότι προέρχεται από ανανεώσιμη πηγή, το βιοντίζελ απελευθερώνει εξαιρετικά οριακά επίπεδα ρύπων στον αέρα.
Συγκρίνοντας το ντίζελ και το βιοντίζελ, είναι εύκολο να υποθέσουμε ότι το ντίζελ είναι κακό και το βιοντίζελ ένα θαυματουργό, ασφαλές για το περιβάλλον προϊόν. Στην πραγματικότητα, το ντίζελ δημιουργήθηκε αρχικά για να βελτιώσει την απόδοση του κινητήρα, περιορίζοντας έτσι τη σπατάλη καυσίμου. Το βιοντίζελ, ενώ έχει πολλά πλεονεκτήματα όσον αφορά τη μείωση της ρύπανσης, απαιτεί την εκτροπή των καλλιεργειών τροφίμων σε παραγωγή ελαίου. Στις αναπτυσσόμενες χώρες, ορισμένοι ανησυχούν ότι η εκτροπή των καλλιεργειών που απαιτείται για την παραγωγή βιοντίζελ και άλλων βιοκαυσίμων θα μπορούσε να οδηγήσει σε μειωμένη προσφορά τροφίμων και σε αυξημένα επίπεδα πείνας. Ενώ ούτε το ντίζελ ούτε το βιοντίζελ δεν φαίνεται να έχουν τέλειες απαντήσεις για το μέλλον των καυσίμων, και τα δύο είναι σημαντικά βήματα στη μακρά πορεία προς καθαρές, ανανεώσιμες, αποδοτικές πηγές ενέργειας για τις μεταφορές.