Τα αντιβιοτικά και η διάρροια έχουν μια σειρά από συνδέσεις. Για παράδειγμα, η διάρροια είναι μια κοινή ανεπιθύμητη ενέργεια πολλών αντιβιοτικών φαρμάκων. Η θεραπεία με αντιβιοτικά μπορεί επίσης να προκαλέσει διάρροια που σχετίζεται με τα αντιβιοτικά, η οποία είναι μια ασθένεια που προκύπτει από τον θάνατο των φυσιολογικών βακτηρίων του γαστρεντερικού συστήματος. Επιπλέον, διάφορες μολυσματικές αιτίες διάρροιας μπορούν να αντιμετωπιστούν με αντιβιοτικά φάρμακα.
Πολλά αντιβιοτικά φάρμακα προκαλούν διάρροια ως παρενέργεια. Η κατηγορία των μακρολιδίων των αντιβιοτικών, η οποία περιλαμβάνει τα φάρμακα κλαριθρομυκίνη, αζιθρομυκίνη και ερυθρομυκίνη, προκαλεί συνήθως διάρροια. Τα φάρμακα τετρακυκλίνης, συμπεριλαμβανομένης της τετρακυκλίνης, της δεμεκλοκυκλίνης και της μινοκυκλίνης μπορούν επίσης να προκαλέσουν διάρροια. Γαστρεντερικά προβλήματα που κυμαίνονται από ναυτία έως διάρροια παρατηρούνται συχνά με τα αντιβιοτικά κεφαλοσπορίνης, συμπεριλαμβανομένης της κεφαλεξίνης, της κεφεπίμης και της κεφτριαξόνης.
Η διάρροια που σχετίζεται με αντιβιοτικά είναι ένας άλλος σύνδεσμος μεταξύ αντιβιοτικών και διάρροιας. Αυτή είναι μια κατάσταση που αναπτύσσεται μετά την έναρξη της αντιβιοτικής θεραπείας για τη θεραπεία μιας λοίμωξης. Μαζί με τη θανάτωση των βακτηρίων που προκαλούν τη μόλυνση, το αντιβιοτικό σκοτώνει πολλά από τα αβλαβή βακτηριακά είδη που ζουν στο γαστρεντερικό σωλήνα. Ως αποτέλεσμα, οι ασθενείς είναι επιρρεπείς σε μόλυνση με το βακτήριο Clostridium difficile (C. diff), που οδηγεί σε διάρροια. Αυτή η ασθένεια είναι γνωστή με τα ονόματα διάρροια που σχετίζεται με αντιβιοτικά, ψευδομεμβρανώδη κολίτιδα και διάρροια που σχετίζεται με το C. diff.
Αν και μπορεί να φαίνεται αντιφατικό, η διάρροια που σχετίζεται με αντιβιοτικά αντιμετωπίζεται με αντιβιοτικά. Πρώτα, ωστόσο, διακόπτεται το αντιβιοτικό που προκάλεσε αρχικά τη διάρροια που σχετίζεται με τα αντιβιοτικά. Απλές περιπτώσεις μπορούν στη συνέχεια να αντιμετωπιστούν με το αντιβιοτικό μετονιδαζόλη. Πιο σοβαρές περιπτώσεις μπορεί να απαιτούν θεραπεία με βανκομυκίνη, ένα ισχυρότερο αντιβιοτικό. Μερικοί γιατροί χρησιμοποιούν επίσης προβιοτικούς παράγοντες σε ασθενείς με διάρροια που σχετίζεται με αντιβιοτικά σε μια προσπάθεια να επαναπληθίσουν το γαστρεντερικό τους σύστημα με ωφέλιμα βακτηριακά είδη.
Ένα ερώτημα που μπορεί να προκύψει όταν εξετάζουμε τα αντιβιοτικά και τη διάρροια, ειδικά εάν η διάρροια ξεκινά μετά την έναρξη της θεραπείας με αντιβιοτικό, είναι εάν η διάρροια είναι παρενέργεια ή είναι διάρροια που σχετίζεται με αντιβιοτικά. Η αλληλουχία των γεγονότων είναι σημαντική για τον προσδιορισμό της αιτίας. Η διάρροια που είναι παρενέργεια φαρμακευτικής αγωγής συνήθως ξεκινά αμέσως μετά την έναρξη των αντιβιοτικών. Αντίθετα, η διάρροια που σχετίζεται με αντιβιοτικά συνήθως δεν ξεκινά παρά μόνο μία έως δύο εβδομάδες μετά την έναρξη των αντιβιοτικών. Εάν υπάρχει οποιαδήποτε σύγχυση, η διάρροια που σχετίζεται με αντιβιοτικά μπορεί να επιβεβαιωθεί αναζητώντας τοξίνες C. diff στα κόπρανα.
Μια άλλη σύνδεση μεταξύ αντιβιοτικών και διάρροιας είναι ότι η διάρροια μπορεί να προκληθεί από τη μόλυνση για την οποία χρησιμοποιούνται τα φάρμακα. Η διάρροια των ταξιδιωτών, για παράδειγμα, προκαλείται τυπικά από το βακτήριο Escherichia coli. ορισμένα αντιβιοτικά λειτουργούν καλά για να εξαλείψουν τη μόλυνση και να σταματήσουν τη διάρροια. Η διάρροια που προκαλείται από τα βακτηριακά είδη Yersinia enterocolitica, Listeria monocytogenes και Salmonella enteriditis συχνά ανταποκρίνεται σε αντιβιοτικά φάρμακα.