Οι αιτίες της συχνουρίας και του καψίματος μπορεί να σηματοδοτούν διαφορετικές καταστάσεις, ανάλογα με το φύλο του ατόμου. Στις γυναίκες, αυτά τα συμπτώματα προκαλούνται συνήθως από λοίμωξη της ουροδόχου κύστης ή λοίμωξη του ουροποιητικού συστήματος (UTI), αν και σε ορισμένες περιπτώσεις μπορεί να είναι αποτέλεσμα σεξουαλικά μεταδιδόμενου νοσήματος (ΣΜΝ). Στους άνδρες, οι λοιμώξεις του ουροποιητικού συστήματος θεωρούνται αρκετά σπάνιες λόγω του μήκους της ουρήθρας. Η πιο κοινή αιτία συχνουρίας και καψίματος στους άνδρες σχετίζεται συνήθως με ΣΜΝ.
Η ουρήθρα είναι ένας σωλήνας που μεταφέρει τα ούρα έξω από το σώμα. Στις γυναίκες, το άνοιγμα του σωλήνα βρίσκεται πολύ κοντά στο ορθό και τα βακτήρια του ορθού μπορούν εύκολα να μεταφερθούν στην ουρήθρα. Μόλις εκεί, τα βακτήρια μερικές φορές μεταναστεύουν στην ουροδόχο κύστη ή ακόμα και στα νεφρά. Η τοποθέτηση της ουρήθρας στην ανατομία των ανδρών την καθιστά πολύ λιγότερο επιρρεπή σε βακτηριακές λοιμώξεις. Για το λόγο αυτό, οι γυναίκες είναι πολύ πιο επιρρεπείς σε ουρολοιμώξεις από ότι οι άνδρες.
Μια άλλη πάθηση που μερικές φορές προκαλεί συχνουρία και κάψιμο είναι η κυστίτιδα, ή μια φλεγμονή της ουροδόχου κύστης. Συνήθως προκαλείται από βακτήρια και συνήθως θεωρείται ένας τύπος ουρολοίμωξης. Άλλες αιτίες κυστίτιδας που δεν προκαλούνται από βακτήρια περιλαμβάνουν τη χρήση καθετήρα και τις αντιδράσεις σε ορισμένους τύπους φαρμάκων. Εάν αφεθεί χωρίς θεραπεία, η κυστίτιδα μπορεί να εξαπλωθεί στα νεφρά και να προκαλέσει μια πολύ πιο σοβαρή κατάσταση. Όπως συμβαίνει με τους περισσότερους τύπους ουρολοιμώξεων, η θεραπεία συνήθως περιλαμβάνει μια σειρά αντιβιοτικών.
Τα χλαμύδια θεωρείται το πιο διαδεδομένο ΣΜΝ και πιστεύεται ότι επηρεάζει περισσότερους από 3 εκατομμύρια ανθρώπους κάθε χρόνο. Μαζί με το κάψιμο κατά την ούρηση, τα χλαμύδια συχνά περιλαμβάνουν έκκριμα από τον κόλπο ή το πέος. Τα συμπτώματα των χλαμυδίων μπορεί να σταματήσουν χωρίς θεραπεία, αλλά η λοίμωξη μπορεί να εξακολουθεί να υπάρχει στο σώμα. Αυτό έχει ως αποτέλεσμα πολλοί άνθρωποι να μεταφέρουν την ασθένεια χωρίς καν να το γνωρίζουν, κάτι που είναι πιθανώς ένας από τους λόγους που είναι τόσο ευρέως διαδεδομένη.
Ένα άλλο ΣΜΝ που μπορεί να προκαλέσει συχνουρία και κάψιμο τόσο σε άνδρες όσο και σε γυναίκες είναι η γονόρροια. Η γονόρροια είναι ένα άλλο ΣΜΝ που μερικές φορές μένει αδιάγνωστο επειδή πολλοί άνθρωποι δεν εμφανίζουν καθόλου συμπτώματα. Η γονόρροια μπορεί να εμφανιστεί στα σεξουαλικά όργανα, στο ορθό ή στο λαιμό. Θεωρείται εξαιρετικά μεταδοτική και εάν αφεθεί χωρίς θεραπεία, η γονόρροια μπορεί να έχει σοβαρές παρενέργειες.
Η θεραπεία τόσο για τα χλαμύδια όσο και για τη γονόρροια περιλαμβάνει συνήθως αντιβιοτικά. Επιπλέον, λόγω του κινδύνου μετάδοσης, οι γιατροί είναι συχνά υποχρεωμένοι από το νόμο να απαιτούν σεξουαλικό ιστορικό 60 ημερών από ασθενείς που έχουν κάποια από αυτές τις ασθένειες. Συνήθως, οι γιατροί θα πρέπει να γνωρίζουν τα ονόματα και τα στοιχεία επικοινωνίας των σεξουαλικών συντρόφων, έτσι ώστε αυτά τα άτομα να μπορούν να ειδοποιηθούν ότι ενδέχεται να διατρέχουν κίνδυνο.