Το ανοσοποιητικό σύστημα των παιδιών είναι τόσο περίπλοκο όσο και αξιοσημείωτο. Ένα φυσιολογικά υγιές βρέφος γεννιέται με κάποια αντισώματα που παρέχονται από τη μητέρα. Αυτό ονομάζεται μητρική επίκτητη ανοσία, αλλά θεωρείται προσωρινή, παθητική ανοσία και δεν αποτελεί εγγύηση έναντι όλων των τύπων λοιμώξεων. Προκειμένου το ανοσοποιητικό σύστημα των παιδιών να αναπτυχθεί φυσιολογικά, είναι απαραίτητη κάποια έκθεση σε ξένα αντιγόνα και ένα πρόγραμμα ρουτίνας εμβολιασμών βοηθά στην παροχή αντισωμάτων που δεν μπορούν να αποκτηθούν παθητικά.
Το ανοσοποιητικό σύστημα των παιδιών βασίζεται σε αλληλεξαρτώμενα κύτταρα και όργανα που προστατεύουν τον οργανισμό από λοιμώξεις. Οι αμυγδαλές, τα αδενοειδή, οι λεμφαδένες, ο μυελός των οστών, τα λευκά αιμοσφαίρια, ακόμη και ο εντερικός σωλήνας είναι όλα μέρη του σώματος που βοηθούν στην προστασία του οργανισμού των παιδιών από διάφορους τύπους λοιμώξεων. Ένα φυσιολογικό βρέφος μπορεί να αρχίσει να αναπτύσσει ανοσοαποκρίσεις σε ξένα αντιγόνα ξεκινώντας από τη γέννηση, υπό την προϋπόθεση ότι όλα τα κύτταρα και τα όργανα λειτουργούν σωστά.
Τα αντισώματα αναπτύσσονται με την πάροδο του χρόνου καθώς το σώμα γίνεται πιο ικανό να συνθέτει αντισώματα ως απόκριση στα αντιγόνα. Η μητρική ανοσία αρχίζει να εξαφανίζεται εντός έξι έως οκτώ μηνών και χρειάζονται περίπου έξι έως οκτώ χρόνια για να αποκτήσει το ανοσοποιητικό σύστημα των παιδιών συγκεντρωμένα επίπεδα αντισωμάτων. Εν μέρει, αυτό το χρονοδιάγραμμα εξηγεί γιατί πολλά παιδιά βιώνουν περισσότερες ασθένειες, όπως κρυολογήματα, νωρίς, αλλά όλο και λιγότερες καθώς πλησιάζουν την εφηβεία.
Η φύση του αναπτυσσόμενου ανοσοποιητικού συστήματος είναι τέτοια που γίνεται ισχυρότερο όταν είναι σε θέση να καταπολεμήσει μόνο του τη μόλυνση. Αντίθετα, οι λοιμώξεις που ο οργανισμός δεν μπορεί να καταπολεμήσει και αυτές που αντιμετωπίζονται αδιακρίτως με αντιβιοτικά εξασθενούν μόνο το ανοσοποιητικό σύστημα. Τα αντιβιοτικά είναι εξαιρετικά χρήσιμα φάρμακα όταν χρησιμοποιούνται για τη θεραπεία λοιμώξεων που το σώμα δεν μπορεί να καταπολεμήσει από μόνο του, αλλά η υπερβολική χρήση πρέπει να αποφεύγεται.
Καθώς ένα παιδί μεγαλώνει, τα συστατικά του ανοσοποιητικού του συστήματος αλλάζουν ελαφρώς. Για παράδειγμα, οι αδενοειδείς εκβλαστήσεις και οι αμυγδαλές συχνά συρρικνώνονται σε μικρότερο μέγεθος με την έναρξη της εφηβείας. Αυτό συμβαίνει επειδή το ανοσοποιητικό σύστημα των παιδιών εξαρτάται λιγότερο από αυτά καθώς αναπτύσσονται. Σε ορισμένες περιπτώσεις, αυτά τα όργανα μπορεί να παρουσιάζουν σημάδια χρόνιας λοίμωξης ή μη φυσιολογικής διεύρυνσης και συχνά αφαιρούνται για να αποφευχθεί η παρεμβολή σε άλλες σωματικές λειτουργίες.
Τα παιδιά με μη φυσιολογικό ανοσοποιητικό σύστημα δεν είναι σε θέση να καταπολεμήσουν τη μόλυνση με τον τρόπο που μπορεί ένα υγιές παιδί. Οι γονείς θα πρέπει να δώσουν ιδιαίτερη προσοχή στα σημάδια επίμονης λοίμωξης, συμπεριλαμβανομένων των χρόνιων και υψηλού βαθμού πυρετού, των νυχτερινών εφιδρώσεων και των ευαίσθητων ή διογκωμένων λεμφαδένων. Τα παιδιά πρέπει να αξιολογούνται τακτικά για σωματική και συναισθηματική ανάπτυξη, μια διαδικασία υγειονομικής περίθαλψης που παρακολουθεί επίσης την ανάπτυξη του ανοσοποιητικού συστήματος.
Για να βοηθήσουν το ανοσοποιητικό σύστημα των παιδιών να αναπτυχθεί κανονικά, οι έγκυες γυναίκες θα πρέπει να αποφεύγουν το αλκοόλ και τον καπνό, να τρώνε υγιεινές τροφές και να λαμβάνουν προγεννητικές βιταμίνες. Η έκθεση στο παθητικό κάπνισμα στη βρεφική και παιδική ηλικία έχει επίσης κατασταλτική επίδραση στο ανοσοποιητικό σύστημα των παιδιών. Άλλες καταστάσεις όπως η ανεπάρκεια βιταμινών, η ασθένεια του αίματος και ο καρκίνος θα επηρεάσουν το ανοσοποιητικό.