Υπάρχουν δύο κύριοι τύποι χειριστηρίων εκσκαφέας σε κοινή χρήση. τα ακόλουθα είναι εκείνα τα σχέδια όπως προσδιορίζονται από το Society of Automotive Engineers International (SAE) και από τον Διεθνή Οργανισμό Τυποποίησης (ISO). Η δυναμική ελέγχου κάθε συστήματος είναι ουσιαστικά πανομοιότυπη με τη μόνη διαφορά ότι τα χειριστήρια για τη λειτουργία του βραχίονα μπούμας και του βραχίονα διέλευσης αντικατοπτρίζονται. Σε πολύ γενικούς όρους, οι εκσκαφέες που χρησιμοποιούνται στις Ηνωμένες Πολιτείες χρησιμοποιούν πιο συχνά το σύνολο χειριστηρίων SAE, ενώ οι εκσκαφείς που χρησιμοποιούνται αλλού στον κόσμο λειτουργούν με τη διάταξη ISO. Πολλοί εκσκαφείς και εκσκαφείς προσφέρουν συστήματα ελέγχου που μπορούν να εναλλάσσονται μεταξύ των διατάξεων SAE και ISO, αφήνοντας την απόφαση στην προτίμηση του χειριστή.
Και στους δύο τύπους χειριστηρίων εκσκαφέας υπάρχουν δύο μοχλοί, ένας για κάθε χέρι του χειριστή. Κοινό και στα δύο συστήματα ελέγχου, η αριστερή και η δεξιά κίνηση του αριστερού μοχλού ελέγχει την περιστροφή ή την περιστροφή του σώματος του μηχανήματος. Ομοίως και στα δύο συστήματα, η μετακίνηση του δεξιού μοχλού αριστερά και δεξιά ελέγχει την κατακόρυφη περιστροφή ή την καμπύλη του κάδου ή του προσαρτημένου εξαρτήματος.
Είναι στην κίνηση προς τα εμπρός και προς τα πίσω των χειρολαβών που διαφέρουν τα δύο συστήματα ελέγχου. Χρησιμοποιώντας τη διάταξη SAE, η μετακίνηση του αριστερού μοχλού προς τα εμπρός και προς τα πίσω ελέγχει την κατακόρυφη κίνηση του βραχίονα βύθισης, ενώ ο δεξιός μοχλός ελέγχει την κατακόρυφη κίνηση του βραχίονα της μπούμας. Σύμφωνα με το στυλ ISO των χειριστηρίων εκσκαφέας, αυτές οι λειτουργίες αντιστρέφονται. Ως παράδειγμα αυτής της μεθόδου ελέγχου, η μετακίνηση και των δύο χεριών μοχλών προς τα εμπρός προκαλεί ανύψωση του βραχίονα αναρρόφησης και χαμήλωμα του βραχίονα μπούμας. Αυτή η ενέργεια έχει ως αποτέλεσμα να ευθυγραμμιστεί ολόκληρος ο βραχίονας του εκσκαφέα μπροστά από το μηχάνημα.
Εκτός από τα χειριστήρια του εκσκαφέα με μοχλό χειρός, υπάρχουν δύο πεντάλ ποδιού ακριβώς μπροστά από τον χειριστή, τα οποία χρησιμοποιούνται για να λειτουργούν ανεξάρτητα τα ίχνη του μηχανήματος. Στα πεντάλ των ποδιών, συνήθως, είναι δύο μακρύι μοχλοί ελέγχου που επιτρέπουν στις ράγες να χειρίζονται με το χέρι εάν το επιθυμείτε. Η απομάκρυνση και των δύο πεντάλ από τον χειριστή αναγκάζει και τα δύο σετ τροχιάς να κινηθούν προς την εμπρός κατεύθυνση. Ομοίως, η μετακίνηση και των δύο πεντάλ προς τον χειριστή έχει το αντίθετο αποτέλεσμα.
Για να περιστρέψει το μηχάνημα, ο χειριστής μπορεί είτε να μετακινήσει το ένα πεντάλ προς τον εαυτό του και το άλλο πεντάλ μακριά για να μετακινηθεί γύρω από το κεντρικό σημείο του μηχανήματος, ενώ μετακινώντας μόνο ένα από τα πεντάλ προς ή μακριά περιστρέφει το μηχάνημα γύρω από τη θέση στατικής τροχιάς . Για παράδειγμα, μετακινώντας το αριστερό πεντάλ προς τον χειριστή και το δεξί πεντάλ μακριά θα προκαλέσει το αριστερό κομμάτι να κινηθεί προς τα πίσω και το δεξί κομμάτι να κινηθεί προς τα εμπρός, κάνοντας το μηχάνημα να περιστρέφεται γύρω από τον κεντρικό του άξονα αριστερόστροφα. Αυτά τα χειριστήρια επιτρέπουν στο μηχάνημα να είναι πολύ πιο εύκολος στους ελιγμούς από ό,τι θα περίμεναν πολλοί άνθρωποι.
Ορισμένες πρώιμες εκδόσεις εκσκαφέων εκσκαφέας χρησιμοποιούν ένα απαρχαιωμένο σύστημα τριών μοχλών, όπου οι μοχλοί κινούνται μόνο σε μια κατεύθυνση από μπροστά προς τα πίσω και ελέγχουν χωριστά τον βραχίονα βύθισης, τον βραχίονα μπούμας και την κίνηση γωνίας κάδου. Αυτά τα χειριστήρια εκσκαφέας εμφανίζονται πιο συχνά σε εξαρτήματα εκσκαφέας όπου η εκσκαφή δεν είναι η κύρια λειτουργία του μηχανήματος και σε μη περιστρεφόμενους εκσκαφείς. Τα μαθήματα εκπαίδευσης χειρισμού εκσκαφέας γενικά επικεντρώνονται στις παραλλαγές SAE και ISO που περιγράφονται παραπάνω.