Τα θερμοκήπια είναι υπέροχα για την επέκταση της καλλιεργητικής περιόδου σε περιοχές με μεγάλες περιόδους ψύχους για την καλλιέργεια λουλουδιών που συνήθως δεν ευδοκιμούν σε εξωτερικό περιβάλλον. Τα καλύτερα λουλούδια θερμοκηπίου περιλαμβάνουν όλα τα είδη ορχιδέων και κρίνων, διετές όπως αλεπούδες, πολυετή φυτά όπως λούπινο ή δελφίνιο και μονοετή φυτά όλων των ειδών. Γενικά, τα καλύτερα λουλούδια θερμοκηπίου είναι αυτά που εκτιμούν ένα ζεστό, υγρό περιβάλλον.
Υπάρχει μια σειρά από οφέλη που παρέχουν τα θερμοκήπια στα λουλούδια που δεν προσφέρει η υπαίθρια κηπουρική. Το περιβάλλον προστατεύεται, επομένως τα φυτά δεν θα χτυπηθούν ή θα καταστραφούν από τους δυνατούς ανέμους ή το ζεματιστό ηλιακό φως. Η θερμότητα, ακόμη και σε μη θερμαινόμενο θερμοκήπιο, είναι ευκολότερο να ρυθμιστεί. Εφόσον το θερμοκήπιο δεν επιτρέπεται να γίνει πολύ ζεστό, τα καλύτερα λουλούδια θερμοκηπίου θα είναι εκείνα που προτιμούν να βάζουν μπουμπούκια σε ομοιόμορφη θερμοκρασία. Τα θερμοκήπια προσφέρουν επίσης κάποια προστασία και πάλι από έντομα και πολλές ασθένειες. Τα λουλούδια που είναι ιδιαίτερα ευαίσθητα στη λευκή μύγα, τα αδηφάγα σκαθάρια, τα ζωύφια Ιουνίου και άλλα παράσιτα του κήπου καθώς και τις ασθένειες που μεταδίδονται από αυτά τα έντομα είναι μια καλή επιλογή για καλλιέργεια σε θερμοκήπιο.
Από τις ορχιδέες, οι ορχιδέες phalaenopsis, cattleya και ontoglossum τα πάνε ιδιαίτερα καλά σε ρυθμισμένα περιβάλλοντα θερμοκηπίου. Οι Odontoglossum προτιμούν ένα πιο δροσερό θερμοκήπιο. Αυτές οι όμορφες ορχιδέες βάζουν μπουμπούκια σε αρωματικά σπρέι και είναι πιο ευτυχισμένες σε ένα θερμοκήπιο όπου οι νυχτερινές θερμοκρασίες μπορούν να διατηρηθούν στους 55 βαθμούς Φαρενάιτ (12.8 βαθμοί Κελσίου) και η θερμοκρασία την ημέρα δεν υπερβαίνει τους 75 βαθμούς Φαρενάιτ (23.9 βαθμούς Κελσίου). Ευδοκιμούν σε φιλτραρισμένο φως και ακόμη και υγρασία.
Οι ορχιδέες Cattleya προτιμούν τις ενδιάμεσες θερμοκρασίες μεταξύ 60 βαθμών Φαρενάιτ (15.6 βαθμών Κελσίου) τη νύχτα και 85 βαθμών Φαρενάιτ (29.4 βαθμών Κελσίου) κατά τη διάρκεια της ημέρας. Οι ορχιδέες Phalaenopsis απαιτούν την περισσότερη θερμότητα. Έχουν δυσανεξία σε νυχτερινές θερμοκρασίες κάτω των 65 βαθμών Φαρενάιτ (18.3 βαθμοί Κελσίου) και αντέχουν σε ζεστό, υγρό περιβάλλον έως και 90 βαθμούς Φαρενάιτ (32.2 βαθμοί Κελσίου).
Τα κρίνα της Κάλλας δημιουργούν εξαιρετικά λουλούδια θερμοκηπίου. Ιθαγενείς στη Νότια Αμερική, τα μακριά άνθη τους που μοιάζουν με σωλήνα καταλήγουν σε ανοιχτό φλάουτο. Απαιτούν σκιασμένο ή φιλτραρισμένο φως και θα πιεστούν από την υπεραφθονία του ηλιακού φωτός. Είναι σημαντικό για τους κηπουρούς που καλλιεργούν κρίνα κάλλας να διατηρήσουν ομοιόμορφη υγρασία στο έδαφος και να μην το αφήνουν να στεγνώσει.
Τα διετές λουλούδια όπως τα γάντια αλεπού που απαιτούν συνήθως δύο χρόνια από τη φύτευση έως την ανθοφορία είναι μια άλλη εξαιρετική επιλογή θερμοκηπίου. Οι κηπουροί μπορούν να φυτέψουν τους σπόρους το φθινόπωρο, ώστε να έχουν ένα φυτό έτοιμο για κήπο μέχρι την άνοιξη για φύτευση. Αντίθετα, μπορεί να επιλέξουν να διατηρήσουν τα λουλούδια στο θερμοκήπιο όλο το χρόνο, όπου συχνά θα συνεχίσουν να βάζουν λουλούδια για αρκετά χρόνια πριν καούν.
Τα πολυετή λουλούδια, όπως τα δελφίνια ή τα λούπινα, δημιουργούν επίσης υπέροχα λουλούδια θερμοκηπίου. Τα λούπινα, τα οποία προέρχονται από την οικογένεια των μπιζελιών, παράγουν άνθη σε ψηλούς μίσχους που μπορεί να υποφέρουν από ζημιές από τον άνεμο. Αναπτύσσονται καλύτερα σε ένα δροσερό θερμοκήπιο. Όπως τα λούπινα, οι ψηλοί ανθοφόροι μίσχοι πάνω στους οποίους αναπτύσσονται τα άνθη του δελφινιού είναι ευαίσθητοι στον δυνατό αέρα και είναι ιδιαίτερα νόστιμοι σε πολλά παράσιτα του κήπου. Το περιβάλλον του θερμοκηπίου μπορεί να προσφέρει μια προστατευτική καλλιεργητική περίοδο όλο το χρόνο ή να χρησιμοποιηθεί για την προετοιμασία δενδρυλλίων για φύτευση σε προστατευμένους εξωτερικούς χώρους.
Όλοι οι τύποι ετήσιων φυτών έχουν την πρώτη θέση ως λουλούδια θερμοκηπίου. Φυτεύοντας σπόρους στα μέσα του χειμώνα, οι κηπουροί θα έχουν φυτά έτοιμα να ανθίσουν όταν είναι η κατάλληλη στιγμή για να τα φυτέψουν σε εξωτερικούς χώρους. Τα ετήσια που ξεκινούν σε θερμοκήπια μπορεί να κυμαίνονται από ανυπόμονα έως ψώρα.