Υπάρχουν πολλά μειονεκτήματα της αιολικής ενέργειας που πρέπει να ληφθούν υπόψη όταν εξετάζουμε επιλογές για την παραγωγή ενέργειας. Είναι σημαντικό να αναγνωρίσουμε ότι παρόλο που υπάρχουν ορισμένα ευδιάκριτα προβλήματα με τη χρήση της αιολικής ενέργειας, εξακολουθεί να είναι μια εξαιρετικά βιώσιμη και πολύ φιλική προς το περιβάλλον μέθοδος παραγωγής ενέργειας. Εάν η επιλογή είναι μεταξύ της αιολικής ενέργειας και μιας μονάδας παραγωγής ενέργειας από ορυκτά καύσιμα, η αιολική ενέργεια είναι σίγουρα ο καλύτερος τρόπος.
Ένα από τα μειονεκτήματα της αιολικής ενέργειας είναι ότι δεν είναι μια μορφή παραγωγής ενέργειας με μηδενικές εκπομπές. Ένας αριθμός πόρων χρησιμοποιείται για την κατασκευή ανεμογεννητριών και ενός συστήματος διανομής ενέργειας, και ενώ η παραγωγή αιολικής ενέργειας δεν δημιουργεί εκπομπές, οι εκπομπές εμπλέκονται στη συντήρηση των αιολικών πάρκων και σε άλλες συνήθεις εργασίες που περιβάλλουν τα αιολικά πάρκα. Ωστόσο, οι εκπομπές που δημιουργούνται από την αιολική ενέργεια είναι σίγουρα ελάχιστες σε σύγκριση με τις συνήθεις εκπομπές ενός σταθμού ηλεκτροπαραγωγής με καύση άνθρακα.
Τα αιολικά πάρκα μπορούν επίσης να καταβροχθίσουν γη που θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί με άλλους τρόπους, κάτι που είναι ένα από τα σημαντικότερα μειονεκτήματα της αιολικής ενέργειας. Ορισμένες εταιρείες έχουν αρχίσει να το αντιμετωπίζουν κατασκευάζοντας τουρμπίνες που μπορούν να χρησιμοποιηθούν σε αγροκτήματα και σε κατοικημένες κοινότητες. Οι παλαιότεροι στρόβιλοι, ωστόσο, απαιτούν ειδικό χώρο και μπορεί να χρειαστεί πολύς χώρος για να στεγαστούν αρκετοί στρόβιλοι για να παράγουν χρήσιμη ποσότητα ενέργειας. Οι ανεμογεννήτριες είναι επίσης εξαιρετικά θορυβώδεις, γεγονός που συχνά οδηγεί σε παράπονα της κοινότητας και μπορεί να απειλήσουν τα αποδημητικά πτηνά που έχουν συνηθίσει να έχουν ελεύθερα ηνία στον αέρα.
Η παραγωγή αιολικής ενέργειας περιορίζεται επίσης από την τοποθεσία. Οι περιοχές με σταθερούς ισχυρούς ανέμους είναι οι καλύτερες για αιολικά πάρκα και η γη σε αυτές τις περιοχές μπορεί να είναι ακριβή ή δύσκολο να εξασφαλιστεί. Τα αιολικά πάρκα πρέπει επίσης να βρίσκονται εύλογα κοντά στην περιοχή όπου χρησιμοποιείται η ενέργεια, ώστε να ελαχιστοποιούνται οι απώλειες στη διαδικασία μεταφοράς ενέργειας. Τα αιολικά πάρκα μπορεί επίσης να μην είναι πάντα παραγωγικά: οι επικρατούντες άνεμοι θα μπορούσαν να αλλάξουν, για παράδειγμα, καθιστώντας τις ανεμογεννήτριες άχρηστες, κάτι που είναι ένα από τα μειονεκτήματα της αιολικής ενέργειας σε σύγκριση με κάτι σαν υδροηλεκτρική ενέργεια, που βασίζεται σε σταθερό πόρο.
Κάποιοι πιστεύουν επίσης ότι τα αιολικά πάρκα λείπουν στο αισθητικό τμήμα. Οι ανεμογεννήτριες δεν είναι τρομερά συναρπαστικές, ειδικά σε μια τεράστια ομάδα, και οι τοπικές κοινότητες συχνά αντιτίθενται στην κατασκευή αιολικών πάρκων για αισθητικούς λόγους. Οι εταιρείες ηλεκτρικής ενέργειας πρέπει συχνά να περνούν από μια περίπλοκη διαδικασία αίτησης άδειας για να κατασκευάσουν, η οποία μπορεί να δημιουργήσει προβλήματα στα κατασκευαστικά σχέδια.
Λαμβάνοντας υπόψη όλα τα μειονεκτήματα της αιολικής ενέργειας, υπάρχουν ορισμένα ευδιάκριτα πλεονεκτήματα. Η αιολική ενέργεια είναι δωρεάν και η χρήση της αιολικής ενέργειας δεν έχει τον ίδιο περιβαλλοντικό αντίκτυπο με τη χρήση υδροηλεκτρικής ενέργειας, η οποία περιλαμβάνει φράγματα ή άλλες αλλαγές στο φυσικό περιβάλλον. Οι ίδιοι οι στρόβιλοι παράγουν μηδενικές εκπομπές όταν βρίσκονται σε λειτουργία και οι εκπομπές που σχετίζονται με την κατασκευή και τη συντήρηση μπορούν να μειωθούν σημαντικά με την κατασκευή και τη λειτουργία με περιβαλλοντικά συνειδητό τρόπο.