Τα πλεονεκτήματα και τα μειονεκτήματα της αντικαταθλιπτικής θεραπείας τείνουν να ποικίλλουν ανάλογα με τον τύπο των αντικαταθλιπτικών που λαμβάνονται. Υπάρχουν τρεις κύριοι τύποι αντικαταθλιπτικών φαρμάκων: τα τρικυκλικά, οι αναστολείς της φήμης της σερατονίνης και οι αναστολείς της μονοαμινοξειδάσης. Γενικά, το πρωταρχικό πλεονέκτημα των περισσότερων τύπων αντικαταθλιπτικής θεραπείας είναι η σημαντική ενίσχυση της διάθεσης και της συνολικής προοπτικής για τη ζωή. Για πολλούς ανθρώπους, τα αντικαταθλιπτικά λειτουργούν πολύ καλά για να τερματίσουν τα συναισθήματα της κατάθλιψης. Τα μειονεκτήματα των αντικαταθλιπτικών σχετίζονται σχεδόν πάντα με τις παρενέργειες κάθε συγκεκριμένου φαρμάκου και το γεγονός ότι, για μερικούς ανθρώπους, τα αντικαταθλιπτικά δεν λειτουργούν για την εξάλειψη της κατάθλιψης.
Τα τρικυκλικά αντικαταθλιπτικά ήταν μερικά από τα πρώτα που κυκλοφόρησαν και τείνουν να είναι πολύ χρήσιμα για τη θεραπεία και την πρόληψη της κατάθλιψης. Οι παρενέργειες των τρικυκλικών μπορεί να είναι δυσάρεστες και επειδή αυτά ήταν μερικά από τα πρώτα αντικαταθλιπτικά που αναπτύχθηκαν, οι παρενέργειες είναι επίσης πιο πιθανό να εμφανιστούν επειδή οι χημικές ουσίες που απελευθερώνονται από τα τρικυκλικά για να απαλλαγούμε από τα συναισθήματα της κατάθλιψης δεν είναι επιλεκτικές και εμποδίζουν κάποια άλλα σημαντικά θέσεις υποδοχέα στον εγκέφαλο. Τα άτομα που λαμβάνουν τρικυκλικά συχνά αναφέρουν έντονη ξηροστομία μαζί με αύξηση βάρους και αισθήματα άγχους. Τα τρικυκλικά μπορεί επίσης να προκαλέσουν καρδιακούς παλμούς, θολή όραση και ορισμένα προβλήματα με τη σεξουαλική απόδοση τόσο σε άνδρες όσο και σε γυναίκες.
Οι αναστολείς της φήμης της σερατονίνης, οι οποίοι συχνά αναφέρονται και ως SSRI, έγιναν πιο δημοφιλείς από τα τρικυκλικά όταν κυκλοφόρησαν επειδή, σε αντίθεση με τα τρικυκλικά, οι χημικές ουσίες που περιέχονται στους SSRI είναι εκλεκτικές και πολλές από τις παρενέργειες που σχετίζονται με τη μη εκλεκτικότητα των τρικυκλικών αντικαταθλιπτικών αποφεύγονται εύκολα. Τα SSRI είναι διαθέσιμα με πολλές διαφορετικές επωνυμίες και τείνουν να λειτουργούν καλά για την ανύψωση της διάθεσης στους περισσότερους ανθρώπους. Τα μειονεκτήματα των SSRI συνήθως σχετίζονται με τις παρενέργειες, μερικές από τις οποίες περιλαμβάνουν αϋπνία, πονοκεφάλους και τρόμο. Υπάρχουν επίσης άνθρωποι που αναφέρουν ότι οι SSRI αφαιρούν τα χαρούμενα συναισθήματα μαζί με τα λυπημένα συναισθήματα, κάνοντάς τους να αισθάνονται χωρίς συναισθήματα γενικά. Ακριβώς όπως όλοι οι τύποι αντικαταθλιπτικής θεραπείας, οι SSRI μπορεί περιστασιακά να είναι αναποτελεσματικοί για την τόνωση της διάθεσης.
Οι αναστολείς της μονοαμινοξειδάσης, γνωστοί και ως MOIs, είναι φάρμακα αντικαταθλιπτικής θεραπείας που λειτουργούν για να ανεβάσουν τη διάθεση αυξάνοντας τα επίπεδα αδρεναλίνης και ντοπαμίνης. Η ντοπαμίνη είναι μια χημική ουσία που παράγει ο εγκέφαλος με φυσικό τρόπο και επηρεάζει έντονα το κέντρο ευχαρίστησης του σώματος. Τα MOI συνήθως δεν συνταγογραφούνται τόσο συχνά για την κατάθλιψη όσο οι SSRI, αλλά μπορεί να είναι απίστευτα χρήσιμα για την τόνωση της διάθεσης. Σε αντίθεση με πολλούς άλλους τύπους αντικαταθλιπτικών, τα MOI έχουν μια δυνητικά επικίνδυνη παρενέργεια της αύξησης της αρτηριακής πίεσης. Τα άτομα που βρίσκονται σε MOI είναι πιθανό να εμφανίσουν υψηλή αρτηριακή πίεση εάν λαμβάνουν αποσυμφορητικά ή αντιισταμινικά φάρμακα ή καταναλώνουν ορισμένους τύπους παλαιωμένων τυριών ή κρασιού, ιδιαίτερα κόκκινο κρασί.