Από το 2010, υπήρχαν δύο τύποι εμβολίων ηπατίτιδας που δοκιμάζονταν και χρησιμοποιούνται σε ανθρώπους. Το καθένα λειτουργεί πολύ διαφορετικά, καθώς το πρώτο δεν είναι εμβόλιο με την παραδοσιακή έννοια της λέξης. Αντί να εμποδίζει ένα άτομο να κολλήσει τον ιό, βοηθά το σώμα να καταπολεμήσει μια υπάρχουσα λοίμωξη ενισχύοντας την ανοσολογική απόκριση. Από εκείνα που χορηγήθηκαν οποιοδήποτε εμβόλιο, οι μόνες παρενέργειες του εμβολίου ηπατίτιδας C που αναφέρθηκαν τείνουν να είναι ο πόνος και η ευαισθησία στο σημείο της ένεσης. Αυτό δεν σημαίνει ότι δεν θα ανακαλυφθούν τελικά περισσότερες παρενέργειες, καθώς το εμβόλιο έχει χορηγηθεί μόνο σε περιορισμένο αριθμό ατόμων.
Ο ιός της ηπατίτιδας C (HCV) προκαλεί φλεγμονή του ήπατος και διακοπή της σωστής λειτουργίας του. Είναι η πιο θανατηφόρα από όλες τις μορφές ηπατίτιδας, γιατί μέχρι πρόσφατα δεν υπήρχε διαθέσιμη μέθοδος πρόληψης εμβολίου. Δύο τύποι εμβολίων κατά του HCV έχουν αναπτυχθεί και χρησιμοποιηθεί σε περιορισμένο αριθμό ατόμων. Η ελπίδα είναι να γίνει τελικά η χρήση τους ευρέως διαδεδομένη.
Ο πρώτος τύπος εμβολίου χορηγείται αφού ο ιός έχει ήδη επικρατήσει. Στους ασθενείς χορηγείται ένεση με μια ουσία που βοηθά στην ενίσχυση της ανταπόκρισης του ανοσοποιητικού συστήματος στον ιό και συμβάλλει στην ενίσχυση της ηπατικής λειτουργίας, απομακρύνοντας τον ιό από το ήπαρ γρηγορότερα. Το δεύτερο μοιάζει πολύ με οποιοδήποτε άλλο εμβόλιο, καθώς χρησιμοποιεί μια νεκρή ή ανενεργή εκδοχή του ιού για να προκαλέσει μια παράνομη ανοσολογική απόκριση. Μόλις το ανοσοποιητικό σύστημα δημιουργήσει αντισώματα κατά του ανενεργού ιού, το σώμα είναι στη συνέχεια σε θέση να καταπολεμήσει τον πραγματικό αν έρθει σε επαφή μαζί του.
Οι παρενέργειες του εμβολίου ηπατίτιδας C περιλαμβάνουν πόνο και ευαισθησία στο σημείο της ένεσης. Αυτά είναι συνήθως ήπια και διαρκούν μία ημέρα ή λιγότερο. Ερυθρότητα μπορεί επίσης να εμφανιστεί σε ορισμένα άτομα. Δεδομένου ότι οι παρενέργειες του εμβολίου για την ηπατίτιδα C δεν έχουν μελετηθεί ευρέως, είναι ασφαλές να υποθέσουμε ότι θα εμφανιστούν πρόσθετα συμπτώματα καθώς τα εμβόλια θα χορηγούνται σε περισσότερα άτομα. Οι συχνές ανεπιθύμητες ενέργειες που εμφανίζονται στην πλειονότητα των εμβολίων, συμπεριλαμβανομένων των εμβολίων για την ηπατίτιδα Β και την ηπατίτιδα Α, περιλαμβάνουν πόνο και οίδημα, ελαφρύ πυρετό, ναυτία, κόπωση, πονοκέφαλο, ζάλη και μερικές φορές έμετο. Αυτές είναι συνήθως ήπιες και οι πιο σοβαρές από αυτές εμφανίζονται μόνο σε μικρό αριθμό ατόμων.
Άλλες πιθανές παρενέργειες του εμβολίου ηπατίτιδας C περιλαμβάνουν αλλεργικές αντιδράσεις, αν και καμία δεν έχει αναφερθεί από το 2010. Αυτές μπορεί να κυμαίνονται από ήπιες έως σοβαρές και μπορεί να προκαλέσουν συμπτώματα όπως δύσπνοια, ερεθισμό του δέρματος ή κνίδωση, ζάλη, ξηροστομία και σοκ. Εάν κάποιο από αυτά συμβεί και είναι σοβαρό, θα πρέπει να αναζητηθεί αμέσως ιατρική βοήθεια. Αυτά είναι σημάδια αναφυλακτικού σοκ και μπορεί να είναι θανατηφόρα εάν δεν αντιμετωπιστούν έγκαιρα.