Ο εντερικός πόνος συνήθως προκύπτει από ασθένεια, κατάσταση υγείας ή τραυματισμό που επηρεάζει τα όργανα στην κοιλιά. Ενώ ο πόνος μπορεί να προέρχεται απευθείας είτε από το λεπτό είτε από το παχύ έντερο, είναι δύσκολο να πούμε εάν ο πόνος είναι πραγματικά εντερικός ή αν προέρχεται από άλλα όργανα ή κοιλιακές περιοχές. Οι πιο κοινές αιτίες του εντερικού πόνου είναι η φλεγμονή, η απόφραξη του εντέρου, η δυσπεψία, τα αέρια και τα έλκη.
Όταν ένα όργανο ή άλλοι ιστοί στην κοιλιακή περιοχή διογκώνονται λόγω ασθένειας ή τραυματισμού, συχνά οδηγεί σε πόνο κοντά στα έντερα. Ο πόνος από φλεγμονή συχνά ξεκινά ξαφνικά και μπορεί να είναι συνεχής ή διαλείπουσα. Ορισμένες φλεγμονώδεις καταστάσεις, όπως η σκωληκοειδίτιδα, είναι σοβαρές και απαιτούν επείγουσα ιατρική φροντίδα. Άλλα, όπως η εκκολπωματίτιδα, ένα πρήξιμο των ιστών γύρω από το παχύ έντερο, συνήθως οδηγούν σε μικρό πόνο και απαιτούν ελάχιστη έως καθόλου ιατρική θεραπεία.
Οι εντερικές αποφράξεις είναι μια από τις πιο κοινές αιτίες εντερικού πόνου που πραγματικά προέρχεται από τα έντερα. Οι πέτρες στη χολή μπορεί να μπλοκάρουν τον χοληδόχο πόρο, ο οποίος φράζει τα έντερα και οδηγεί σε πόνο. Τα μπλοκαρίσματα στο λεπτό έντερο ή στο κόλον μπορεί να εμποδίσουν τη διέλευση υγρού από τα έντερα, οδηγώντας σε πόνο. Αυτά τα μπλοκαρίσματα προκαλούνται συνήθως από κήλες, προσβεβλημένα κόπρανα ή ζώνες ινώδους ιστού που σχηματίζονται στην κοιλιά, αν και μερικές φορές ευθύνονται και οι όγκοι.
Ορισμένα εντερικά μπλοκαρίσματα επιλύονται από μόνα τους με υγρά και δίαιτα χαμηλή σε φυτικές ίνες. Πιο σοβαρά εμπόδια μπορεί να χρειαστεί να αφαιρεθούν χειρουργικά. Τα μπλοκαρίσματα που δεν αντιμετωπίζονται μπορεί να προκαλέσουν θάνατο τμημάτων του εντέρου και οποιοσδήποτε νεκρός ιστός μπορεί επίσης να αφαιρεθεί κατά τη διάρκεια της χειρουργικής επέμβασης για να καθαριστεί η απόφραξη.
Η δυσπεψία και τα αέρια είναι μερικές από τις πιο κοινές αιτίες κοιλιακού πόνου και δυσφορίας που εμφανίζεται στην εντερική περιοχή. Η δυσπεψία είναι συχνά σημάδι μιας υποκείμενης πάθησης όπως το σύνδρομο ευερέθιστου εντέρου, η γαστροοισοφαγική παλινδρόμηση ή τα έλκη. Αέρια από την κατάποση περίσσειας αέρα ή βακτηρίων στο παχύ έντερο που εργάζονται για την πέψη των τροφών μπορεί επίσης να οδηγήσουν σε εντερικό πόνο. Το αέριο συνήθως δεν απαιτεί ιατρική θεραπεία, αν και τα επίμονα προβλήματα με τα αέρια μπορεί να είναι σημάδι εντερικού προβλήματος ή διαταραχής.
Τα έλκη είναι μικρές πληγές στο στομάχι ή στο λεπτό έντερο. Μπορούν να προκαλέσουν κοιλιακό άλγος και πίεση που μπορεί να γίνει αισθητή μέσα ή κοντά στα έντερα. Αν και οποιοσδήποτε μπορεί να αναπτύξει έλκη που να οδηγούν σε εντερικό πόνο, άτομα που καπνίζουν, πίνουν αλκοόλ τακτικά, είναι 50 ετών και άνω ή λαμβάνουν μη στεροειδή αντιφλεγμονώδη φάρμακα τακτικά είναι πιο πιθανό να εμφανίσουν έλκη. Πολλά έλκη υποχωρούν από μόνα τους και τα περισσότερα υποχωρούν με φάρμακα που μειώνουν τα επίπεδα οξέος στο στομάχι.