Οι πιο συνηθισμένες αιτίες μη παραγωγής σπέρματος στους άνδρες αφορούν γενετικά ελαττώματα που επηρεάζουν τη γονιμότητά τους. Μερικές φορές αυτά τα ελαττώματα μπορεί να επηρεάσουν την παραγωγή σπέρματος και άλλες φορές μπορεί να οδηγήσουν σε απόφραξη που εμποδίζει την απελευθέρωση του σπέρματος. Άλλες πιθανές αιτίες για μικρό ή καθόλου αριθμό σπερματοζωαρίων μπορεί να περιλαμβάνουν τραυματισμό στους όρχεις ή το πέος και βαζεκτομή.
Το σύνδρομο Klinefelter είναι η πιο κοινή αιτία μη παραγωγής σπέρματος. Είναι μια γενετική μετάλλαξη στην οποία ένα αρσενικό έχει ένα επιπλέον φυλετικό χρωμόσωμα. Οι περισσότεροι άνδρες έχουν ένα χρωμόσωμα Χ και ένα Υ. Όσοι έχουν σύνδρομο Klinefelter έχουν ένα επιπλέον χρωμόσωμα Χ, που οδηγεί σε υπερβολική παραγωγή μαστού, μικρούς σκληρούς όρχεις και υπογονιμότητα. Υπάρχουν επίσης γενετικά ελαττώματα που μπορεί να αλλάξουν την ορμονική ισορροπία στους άνδρες, και αυτά μπορεί επίσης να οδηγήσουν σε έλλειψη παραγωγής σπέρματος. Οι άντρες που αντιμετωπίζουν προβλήματα με το να κάνουν παιδί με τις συντρόφους τους θα πρέπει να ελέγχονται για αυτές τις ανωμαλίες.
Μια άλλη γενετική πάθηση που μπορεί να οδηγήσει σε απουσία σπέρματος είναι η συγγενής απουσία του van deferens (CAVD). Αυτό έχει ως αποτέλεσμα την έλλειψη αγωγών που χρειάζονται για την έκκριση σπέρματος στο σπέρμα. Μερικές φορές το αρσενικό μπορεί να έχει πόρους αλλά είναι κακοσχηματισμένοι. Τα αρσενικά με αυτή την πάθηση έχουν συνήθως μέση παραγωγή σπέρματος, αλλά τα σπερματοζωάρια παγιδεύονται μέσα στους όρχεις χωρίς τρόπο διαφυγής. Οι άνδρες με CAVD μπορούν ακόμα να εμποτίσουν μια γυναίκα μέσω τεχνητής γονιμοποίησης ή σε ορισμένες περιπτώσεις μπορεί να γίνει χειρουργική επέμβαση για την άρση τυχόν μπλοκαρίσματος.
Σε ορισμένες περιπτώσεις, ένας άνδρας μπορεί να έχει έλλειψη σπέρματος για άγνωστους λόγους. Άλλες φορές ένας τραυματισμός στο πέος ή στους όρχεις μπορεί να οδηγήσει σε μη παραγωγή σπέρματος. Σε αυτές τις περιπτώσεις, ορισμένοι άνδρες μπορεί να έχουν διορθωτικές διαδικασίες για την αποκατάσταση της ζημιάς. Πολλές φορές όμως αυτό δεν μπορεί να γίνει και προκύπτει μόνιμη υπογονιμότητα.
Οι άνδρες που έχουν υποβληθεί σε βαζεκτομή θα έχουν επίσης μηδενικό αριθμό σπερματοζωαρίων. Το σπέρμα εξακολουθεί να παράγεται στους όρχεις, αλλά η δίοδος μεταξύ αυτών και του πέους είναι φραγμένη ή κομμένη. Σε ορισμένες περιπτώσεις μια βαζεκτομή μπορεί να αντιστραφεί και η πλήρης ή μερική γονιμότητα μπορεί να αποκατασταθεί, αλλά αυτό δεν είναι πάντα μια επιλογή.
Ακόμη και οι άνδρες που έχουν μηδενικό αριθμό σπερματοζωαρίων μπορεί να έχουν μικρό αριθμό σπερματοζωαρίων μέσα στους όρχεις. Οι σύγχρονες θεραπείες υπογονιμότητας μπορούν μερικές φορές να επιτρέψουν την ανάκτηση και χρήση αυτών των σπερματοζωαρίων. Εκείνοι που πραγματικά δεν έχουν σπέρμα μπορεί να χρειαστεί να καταφύγουν στη χρήση δότη σπέρματος για να κάνουν οικογένεια με τους συντρόφους τους.