Η θεραπεία που χρησιμοποιείται για μια κύστη ήπατος εξαρτάται συνήθως από τον τύπο της κύστης, το πού βρίσκεται και το εάν προκαλεί προβλήματα στην υγεία του ασθενούς ή όχι. Εάν μια ηπατική κύστη είναι καλοήθης και δεν έχει αξιοσημείωτη επίδραση στην υγεία του ασθενούς, η θεραπεία μπορεί να μην είναι καθόλου απαραίτητη. Σε άλλες περιπτώσεις, ωστόσο, οι επιπτώσεις στην υγεία ή το μέγεθος μπορεί να απαιτούν θεραπεία και οι γιατροί μπορούν να χρησιμοποιήσουν αντιβιοτικά, παροχέτευση ή χειρουργική επέμβαση ως θεραπεία. Σε ορισμένες περιπτώσεις, οι γιατροί μπορεί ακόμη και να θεραπεύσουν μια ηπατική κύστη θεραπεύοντας την υποκείμενη πάθηση που την προκάλεσε.
Ένας τρόπος θεραπείας μιας ηπατικής κύστης περιλαμβάνει τη χρήση αντιβιοτικών. Εάν μια κύστη έχει αναπτυχθεί λόγω βακτηριακής λοίμωξης, η χρήση του κατάλληλου αντιβιοτικού για τον συγκεκριμένο τύπο βακτηριακής λοίμωξης μπορεί να αποδειχθεί χρήσιμη. Το χρονικό διάστημα που ο ασθενής θα πρέπει να λάβει ένα αντιβιοτικό για τη θεραπεία μιας ηπατικής κύστης εξαρτάται συνήθως από τον τύπο της λοίμωξης και τη σοβαρότητά της. Σε ορισμένες περιπτώσεις, ένα άτομο μπορεί να χρειαστεί να πάρει αντιβιοτικά για ένα μήνα ή περισσότερο. Σε άλλες, ωστόσο, αρκετές ημέρες χρήσης αντιβιοτικών μπορεί να είναι αρκετές.
Η παροχέτευση χρησιμοποιείται μερικές φορές και για τη θεραπεία απλών κύστεων γεμάτων υγρό. Οι γιατροί, για παράδειγμα, μπορούν να χρησιμοποιήσουν παροχέτευση για να ανακουφίσουν οποιαδήποτε πίεση προκαλεί η κύστη. Η παροχέτευση, ωστόσο, δεν είναι πάντα η καλύτερη επιλογή για τη θεραπεία αυτού του τύπου κύστης, καθώς μπορεί να μην θεραπεύσει την πάθηση που προκάλεσε την ανάπτυξή της. Αντίθετα, ο ασθενής μπορεί να αναπτύξει νέες ηπατικές κύστεις με την πάροδο του χρόνου.
Η χειρουργική επέμβαση είναι μια άλλη πιθανή θεραπεία για τις ηπατικές κύστεις. Χρησιμοποιείται συχνότερα όταν οι κύστεις είναι πολύ μεγάλες, προκαλούν υπερβολική πίεση ή συμβάλλουν σε άλλα προβλήματα υγείας. Μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί όταν οι κύστεις έχουν αποτύχει να ανταποκριθούν καλά σε άλλους τύπους θεραπείας. Είναι ενδιαφέρον ότι δεν αντιμετωπίζονται όλες οι ηπατικές κύστεις με ανοιχτή χειρουργική επέμβαση. Ορισμένοι αντιμετωπίζονται με λαπαροσκοπική χειρουργική, η οποία περιλαμβάνει μόνο μια μικρή τομή μέσω της οποίας αφαιρείται η κύστη. Ο τύπος της χειρουργικής επέμβασης που χρησιμοποιείται συνήθως εξαρτάται από το πόσο μεγάλη είναι η κύστη και το τμήμα του ήπατος στο οποίο βρίσκεται.
Μερικές φορές η θεραπεία για μια κύστη ήπατος περιλαμβάνει τη φροντίδα μιας σχετικής πάθησης που έχει συμβάλει στην ανάπτυξή της. Για παράδειγμα, οι γιατροί μπορεί να συνταγογραφήσουν φάρμακα για μια υποκείμενη πάθηση και αυτή η θεραπεία μπορεί επίσης να βοηθήσει στη θεραπεία της κύστης. Μερικές φορές, ωστόσο, η θεραπεία των ηπατικών κύστεων μπορεί να είναι τόσο απλή όσο η πραγματοποίηση διατροφικών αλλαγών.