Η αποκατάσταση οικοτόπου αναφέρεται σε έργα που προορίζονται να αναπληρώσουν τους φυσικούς πόρους ενός οικοσυστήματος μετά από φυσικές ή ανθρωπογενείς ζημιές. Σε ορισμένες περιπτώσεις, η αποκατάσταση των οικοτόπων είναι ζωτικής σημασίας για την επιβίωση των ιθαγενών ειδών, την ακεραιότητα του εδάφους ή του νερού και τη συνεχιζόμενη ύπαρξη ενός φυσικού οικοσυστήματος. Υπάρχουν πολλοί διαφορετικοί τύποι αποκατάστασης οικοτόπων, συμπεριλαμβανομένης της αναδάσωσης, της παράκτιας αποθήκευσης, της αποκατάστασης των λιβαδιών και της αποκατάστασης των κοραλλιογενών υφάλων. Η ανάληψη κάθε είδους αποκατάστασης οικοτόπων μπορεί να βοηθήσει στη διασφάλιση του μέλλοντος των οικοσυστημάτων που υπήρχαν, σε ορισμένες περιπτώσεις, για χιλιάδες χρόνια.
Η αναδάσωση περιλαμβάνει τη φύτευση αυτοφυών δέντρων, θάμνων και χόρτων για την αποκατάσταση μιας δασικής έκτασης. Η αναδάσωση μπορεί να είναι απαραίτητη αφού μια περιοχή έχει υποστεί εκτεταμένη υλοτομία ή έχει υποστεί φυσική καταστροφή, όπως μια πυρκαγιά στα δάση. Εάν τα είδη ζώων έχουν εξαφανιστεί ή έχουν υποστεί πολύ μειωμένο αριθμό από μια δασική περιοχή λόγω αποψίλωσης των δασών, τα έργα αναδάσωσης μπορεί να περιλαμβάνουν προσπάθειες επανεισαγωγής των ειδών στην άγρια φύση, συχνά από αιχμάλωτα δείγματα. Δεδομένου ότι ένα οικοσύστημα βασίζεται συχνά σε ένα εξελιγμένο σύστημα αλληλεπιδράσεων μεταξύ ιθαγενών ζώων και αυτοφυών φυτών, είναι σημαντικό τα έργα αναδάσωσης να παραμείνουν στην αναδημιουργία της φυσικής ισορροπίας των ειδών, παρά στην εισαγωγή εξωτικών φυτών ή ζώων σε νέο περιβάλλον.
Η αποθήκευση των ωοειδών είναι ένας τύπος αποκατάστασης οικοτόπου που εξασφαλίζει την ακεραιότητα και την ύπαρξη φυσικών πηγών νερού. Το παραποτάμιο προστατευτικό είναι η ζώνη βράχων και φυτών που τρέχουν παράλληλα με τα όρια ενός ποταμού ή ρέματος. Η βλάστηση διατηρεί το νερό σε ένα ρέμα ή ποτάμι απαλλαγμένο από ιζήματα δημιουργώντας ένα στερεό φράγμα αντί για μια εύθραυστη τράπεζα εδάφους. Η αποκατάσταση παραποτάμιων ζωνών προστασίας μετά από κατασκευαστικά έργα, αποψίλωση ή πλημμύρες, μπορεί να βοηθήσει να διασφαλιστεί ότι οι φυσικές πηγές νερού παραμένουν βιώσιμες σε ένα οικοσύστημα.
Στη Βόρεια Αμερική, κανένα περιβάλλον δεν έχει δει τόσο μεγάλη καταστροφή όσο τα μεγάλα λιβάδια που εκτείνονται στη μέση των Ηνωμένων Πολιτειών και του Καναδά. Παρόλο που η ανεπτυγμένη γη των λιβαδιών επιτρέπει πολλά από τα αγροκτήματα που βοηθούν στη σίτιση του κόσμου, τα μοναδικά είδη και τα πλεονεκτήματα που καταστρέφονται λόγω της απώλειας των λιβαδιών μπορεί να έχουν σημαντικό αντίκτυπο στο περιβάλλον. Ιστορικά, τα λιβάδια έχουν γεμίσει με ψηλά χόρτα και αγριολούλουδα που επιτρέπουν την προώθηση των πληθυσμών των μελισσών, μαζί με την υποστήριξη πολλών άλλων ειδών. Χωρίς μέλισσες, η διασταυρούμενη επικονίαση είναι σχεδόν αδύνατη, γεγονός που καθιστά την καλλιέργεια βιώσιμων καλλιεργειών τεράστια πρόκληση. Η αποκατάσταση των οικοτόπων στο λιβάδι επιδιώκει να μετατρέψει τις διαβρωμένες πεδιάδες σε οικότοπους με λουλούδια και γηγενή γρασίδι που μπορούν να υποστηρίξουν τις μέλισσες καθώς και πολλά απειλούμενα είδη λιβαδιών.
Οι κοραλλιογενείς ύφαλοι είναι μακράν οι μεγαλύτερες πηγές ζωής στον ωκεανό. Χιλιάδες είδη θαλάσσιων φυτών και ψαριών φτιάχνουν τα σπίτια τους ανάμεσα σε εκτεταμένους υφάλους, που αποτελούν οάσεις ζωής και αναζωογόνησης ανάμεσα στις μεγάλες άγονες περιοχές του θαλάσσιου τοπίου. Το κοράλλι είναι ευαίσθητο στις αλλαγές θερμοκρασίας και τις όξινες ισορροπίες και συχνά καταστρέφεται για να δημιουργήσει κανάλια αλιείας ή μέσω συγκομιδής καταναλωτικών προϊόντων. Η αποκατάσταση των οικοτόπων των κοραλλιών χρησιμοποιεί τόσο συνθετικά κοράλλια όσο και προγράμματα εκτροφής κοραλλιών για να διασφαλίσει ότι οι ύφαλοι παραμένουν γεμάτοι ζωή και ποικιλομορφία.