Η σύνταξη μιας ακαδημαϊκής έκθεσης ή μιας ερευνητικής εργασίας απαιτεί από τον συγγραφέα να δώσει ιδιαίτερη προσοχή στις απαιτήσεις μορφοποίησης υποσημείωσης. Ορισμένες βιομηχανίες και ιδρύματα έχουν τη δική τους συγκεκριμένη μορφοποίηση και μπορεί είτε να παρέχουν τον δικό τους οδηγό στυλ είτε να ακολουθούν έναν πιο τυπικό. Τα τυπικά στυλ μορφοποίησης υποσημειώσεων περιλαμβάνουν αυτά της Αμερικανικής Ψυχολογικής Εταιρείας (APA) και της Ένωσης Σύγχρονης Γλώσσας (MLA). Οι υποσημειώσεις τύπου APA επικεντρώνονται στην ακριβή πηγή έρευνας και την ημερομηνία της και χρησιμοποιούνται για ψυχολογικές και επιστημονικές εργασίες, άρθρα και περιοδικά. Τα έγγραφα στους κλάδους της γλώσσας και της λογοτεχνίας τείνουν να τονίζουν το στυλ MLA, το οποίο εστιάζει περισσότερο στον συγγραφέα παρά στις λεπτομέρειες στην πηγή.
Σε αντίθεση με τις σημειώσεις τέλους που βρίσκονται στο τέλος ενός εγγράφου, οι υποσημειώσεις τοποθετούνται στο κάτω μέρος της σελίδας όπου εμφανίζεται μια αναφορά. Οι υποσημειώσεις χρησιμοποιούνται για την παράθεση αποσπασμάτων από βιβλία ή άρθρα, πηγές στατιστικών στοιχείων και έννοιες που προέρχονται από τις ιδέες ενός επιχειρήματος άλλου συγγραφέα. Οι πληροφορίες που χρησιμοποιούνται για την περιγραφή και τον ορισμό των εννοιών με λεπτομέρεια μπορούν επίσης να αναφέρονται με την κατάλληλη πηγή τους. Ο τρόπος με τον οποίο δομούνται αυτές οι πληροφορίες εξαρτάται από τη μορφοποίηση της υποσημείωσης που χρησιμοποιείται.
Η μορφοποίηση υποσημείωσης για τεχνικές και επιστημονικές πληροφορίες ακολουθεί τις οδηγίες της APA. Η πηγή της έρευνας τονίζεται επειδή παρόμοια άρθρα που δημοσιεύονται από τον ίδιο συγγραφέα μπορεί να αντικατοπτρίζουν ξεπερασμένες πληροφορίες. Λεπτομέρειες που είναι κρίσιμες για τις ιδέες που εκφράζονται στο έγγραφο μπορούν να αναφερθούν χρησιμοποιώντας παραπομπές εντός του κειμένου. Οι αναφορές μπορούν διαφορετικά να επισημανθούν με έναν υπερκείμενο αριθμό ή έναν αστερίσκο που αντιστοιχεί στη συγκεκριμένη υποσημείωση.
Στις υποσημειώσεις τύπου APA, το επίθετο και το όνομα του συγγραφέα εμφανίζονται στην αρχή, ακολουθούμενα από τον τίτλο του άρθρου ή τον ιστότοπο με πλάγιους χαρακτήρες. Είναι προαιρετικό να προσθέσετε την ημερομηνία, σε αγκύλες ή παρενθέσεις, κατά την οποία ανακτήθηκαν οι πληροφορίες. Η διεύθυνση του ιστότοπου, εάν χρειάζεται, πρέπει να τοποθετείται στο τέλος της υποσημείωσης.
Ένα άλλο σημαντικό στυλ μορφοποίησης υποσημείωσης είναι το MLA. Αυτή η μορφή εστιάζει στον συγγραφέα, αλλά εάν το όνομα του συγγραφέα δεν είναι γνωστό, ο ιστότοπος μπορεί να αναφέρεται πρώτα με πλάγιους χαρακτήρες. Το όνομα του συγγραφέα εμφανίζεται πρώτο σε άλλες περιπτώσεις, ακολουθούμενο από την ημερομηνία που βρέθηκαν οι πληροφορίες σε μορφή μήνα, ημέρας και έτους. Οι πληροφορίες σχετικά με τον τίτλο της πηγής ή τη διεύθυνση του ιστότοπου ακολουθούν αυτές τις πληροφορίες. Αυτό το είδος μορφοποίησης υποσημείωσης, όπως και άλλες πτυχές του MLA, έχει σχεδιαστεί για να παρέχει συνοπτικές και σύντομες αναφορές στο κείμενο και είναι προσαρμοσμένο στις ανάγκες των σχολαστικών κλάδων.