Δεν υπάρχουν πάρα πολλοί διαφορετικοί τύποι οφθαλμικών σταγόνων για μωρά που θεωρούνται ασφαλείς από την ιατρική κοινότητα. Οι γονείς θα πρέπει να συμβουλευτούν τον γιατρό του παιδιού εάν εμφανιστούν μολύνσεις ή ερεθισμοί στα μάτια. Οι πάροχοι υγειονομικής περίθαλψης γενικά συνταγογραφούν αντιβιοτικά σκευάσματα σε δόσεις που θα εξαλείψουν τη μόλυνση ενώ θα παράγουν τον μικρότερο αριθμό ανεπιθύμητων ενεργειών. Ακόμη και οι οφθαλμικές σταγόνες για παιδιά περιέχουν σκευάσματα που είναι πολύ ισχυρά για τα μικρά σώματα των μικρών βρεφών. Μερικοί παιδίατροι προτείνουν να απλώσετε μερικές σταγόνες μητρικού γάλακτος στο ερεθισμένο μάτι.
Τις ώρες λίγο μετά τη γέννηση, οι επαγγελματίες υγείας χρησιμοποιούν αντιβιοτικές οφθαλμικές σταγόνες για μωρά ως προστασία έναντι τυχόν λοιμώξεων που μπορεί να έχει προσβληθεί το βρέφος στη μήτρα. Ο νιτρικός άργυρος ήταν το φάρμακο εκλογής για δεκαετίες, αλλά οι γιατροί άλλαξαν σε ερυθρομυκίνη επειδή έχει λιγότερα ερεθιστικά αποτελέσματα. Περιστασιακά τα βρέφη αναπτύσσουν αυτό που φαίνεται να είναι οφθαλμικές μολύνσεις, που συνήθως ονομάζονται ροζ μάτια, που προκαλούν ερυθρότητα και κρούστα αποχέτευσης. Οι γονείς θα πρέπει να συμβουλεύονται έναν γιατρό πριν βάλουν οποιαδήποτε ουσία στα μάτια του μωρού, καθώς πολλά φάρμακα κατακλύζουν τα μικρά βρέφη. Ένας πάροχος υγειονομικής περίθαλψης μπορεί να συνταγογραφήσει τομπραμυκίνη ή άλλα αντιβιοτικά διαλύματα που κρίνονται ασφαλή για χρήση σε μωρά.
Πολλοί οφθαλμίατροι προσφέρουν οφθαλμικές εξετάσεις του μωρού για να αξιολογήσουν εάν τα μάτια του παιδιού λειτουργούν μαζί και προσαρμόζονται για αλλαγές στο φως. Ο οφθαλμίατρος μπορεί να χρησιμοποιήσει οφθαλμικές σταγόνες που διαστέλλουν τις κόρες των ματιών, επιτρέποντας στον γιατρό να εξετάσει το εσωτερικό μάτι για σημεία αστιγματισμού ή μυωπίας. Τα αποτελέσματα των οφθαλμικών σταγόνων συνήθως περιλαμβάνουν θολή όραση, η οποία διαρκεί έως και 90 λεπτά μετά την εξέταση. Περιστασιακά τα βρέφη αναπτύσσουν καταρράκτη ή γλαύκωμα, αλλά δεν υπάρχουν ασφαλείς συνταγογραφούμενες οφθαλμικές σταγόνες για μωρά που αντιμετωπίζουν αυτές τις καταστάσεις και τα βρέφη μπορεί να χρειαστούν διορθωτική χειρουργική επέμβαση.
Οι οφθαλμικές σταγόνες για αλλεργίες χωρίς ιατρική συνταγή γενικά σκευάζονται για χρήση σε παιδιά ηλικίας έξι ετών και άνω. Εάν ένα βρέφος εμφανίσει ερεθισμό των ματιών που δεν φαίνεται να σχετίζεται με λοίμωξη του αναπνευστικού, οι γονείς δεν πρέπει να χρησιμοποιούν οφθαλμικές σταγόνες για μωρά, εκτός εάν το συστήσει γιατρός. Ειδικές συνταγογραφούμενες οφθαλμικές σταγόνες μπορεί να χρησιμοποιηθούν για αλλεργίες ή οι πάροχοι υγειονομικής περίθαλψης μπορούν να προτείνουν άλλες μεθόδους καταπραϋντικής ανακούφισης των ερεθισμένων ματιών. Δεν συνιστώνται φαρμακευτικές οφθαλμικές σταγόνες που περιέχουν κορτιζόνη ή παράγωγα στεροειδών, καθώς τα σκευάσματα μπορεί να προκαλέσουν αδυναμία των οστών, των αρθρώσεων ή των τενόντων και παραμορφώσεις.