Υπάρχουν τρεις κύριες διαμορφώσεις ή τύποι πανιών καγιάκ. Αυτές οι διαφορετικές διαμορφώσεις είναι γνωστές ως πλήρη ιστιοπλοϊκά σκάφη, ανεξάρτητα πανιά και συμπαγείς ανεμοστρόβιλοι. Με τη χρήση πανιών, το άθλημα του καγιάκ αλλοιώνεται σημαντικά, φέρνοντας ένα νέο στοιχείο ταχύτητας. Το καγιάκ δεν περιορίζεται πλέον μόνο σε αθλήματα στο λευκό νερό, αλλά είναι επίσης ένα μέσο μεταφοράς σε επίπεδο νερό. Είναι σε αυτήν την περιοχή που τα πανιά καγιάκ έχουν βρει μια θέση στην αγορά.
Ο τύπος του ιστιοφόρου καγιάκ που είναι γνωστός ως γεμάτο ιστιοπλοΐα γεφυρώνεται μέσω οπών στο σώμα του καγιάκ ή συνδέεται μέσω ενός συστήματος αποκοπής για να παρέχει ακαμψία. Είναι ένα στιβαρό πανί, ικανό να αντέχει ανέμους στη θάλασσα μέχρι περίπου 30 κόμβους. Αυτός ο τύπος πανιού μπορεί να οδηγήσει σε επιπλοκές κατά τη διάρκεια υπερβολικά ισχυρών ανέμων λόγω της αδυναμίας να αφαιρέσετε εύκολα τα πανιά από το σκάφος. Τα πλήρη ιστιοφόρα μπορούν να θεωρηθούν ως μόνιμη προσθήκη σε μια εγκατάσταση ιστιοπλοΐας καγιάκ.
Μια άμεση εναλλακτική λύση σε αυτά τα γεμάτα ιστιοπλοΐα υπάρχει με τη μορφή ανεξάρτητων πανιών. Αυτοί οι τύποι πανιών καγιάκ δεν απαιτούν μόνιμη μέθοδο στερέωσης στο σώμα του καγιάκ. Αντίθετα, τα ιστιοφόρα ανεξάρτητα ακουμπούν στο σώμα του καγιάκ σε μια θέση γενικά πιο κοντά στον χειριστή για να επιτρέψουν την ευκολία χρήσης και τη γρήγορη απομάκρυνση όταν απαιτείται. Λόγω του προσωρινού χαρακτήρα τους, τα ανεξάρτητα πανιά είναι πολύ λιγότερο ανθεκτικά από τα γεμάτα ιστιοφόρα και είναι ευαίσθητα σε ισχυρούς ανέμους όταν χρησιμοποιούνται. Ο ανεξάρτητος τύπος πανιού ταιριάζει καλύτερα σε τυπικά στυλ καγιάκ που ενσωματώνουν πιλοτήρια για τους χειριστές καθώς η χρήση του ποδιού για την τοποθέτηση των πανιών σε καθίσματα στην κορυφή (SOP) καγιάκ θαλάσσης αφήνει τα πανιά πολύ μακριά από τον χειριστή να ελέγχεται ή να αφαιρείται εύκολα.
Μια εναλλακτική λύση τόσο για τις γεμάτες ιστιοπλοΐες όσο και για τα ανεξάρτητα ιστιοφόρα καγιάκ, οι συμπαγείς ανεμοστρόβιλοι περιστρέφονται στη μέση μεταξύ των δύο από την άποψη της ακαμψίας και της ανθεκτικότητας, που μπορούν να αντέξουν τους ανέμους της θάλασσας έως και περίπου 15 κόμβους. Οι συμπαγείς περιστρεφόμενοι ανεμοστρόβιλοι αναφέρονται συχνότερα ως πανί χαρταετού και τοποθετούνται στο σώμα του καγιάκ μέσω βεντούζας. Τα πανιά Kite είναι μικρότερα, εύκολα μεταφερόμενα και πιο ελαφριά από άλλες μορφές πανιών καγιάκ, και ως εκ τούτου, χρησιμοποιούνται συχνά κατά τη διάρκεια τουριστικών αποστολών. Εάν οι άνεμοι γίνουν πολύ ισχυροί, τα πανιά του χαρταετού είναι εύκολα αφαιρούμενα για να καταπολεμήσουν τον κίνδυνο ανατροπής και πρόσθετες οδηγίες μπορούν να τοποθετηθούν στα πλάγια του σώματος του καγιάκ για να διατηρηθεί ένα επίπεδο ελέγχου στο σκάφος.