Οι κύριοι παράγοντες που επηρεάζουν τον μισθό ενός ιατροτεχνολόγου είναι οι τύποι δειγμάτων, οι τεχνικές εξέτασης, οι θέσεις απασχόλησης και οι ώρες εργασίας. Τα καθήκοντα εργασίας του ιατροτεχνολόγου ποικίλλουν ευρέως, όπως η ανάλυση αίματος ή ούρων. Γενικά, τα δείγματα που απαιτούν περισσότερες εξετάσεις από άλλα θα αυξήσουν τον μισθό ενός ιατροτεχνολόγου.
Ο ανθρώπινος ιστός, το αίμα και άλλα σωματικά υγρά εξετάζονται για τον αριθμό κυττάρων, τη χημική σύνθεση, ακόμη και τα επίπεδα φαρμάκων. Κάθε δείγμα που εξετάζεται έχει διαφορετικό επίπεδο δυσκολίας που σχετίζεται με την εργασία, η οποία απαιτεί διάφορα ποσά μισθού. Μια απλή διαδικασία πληκτρολόγησης αίματος δεν πρέπει να είναι ιδιαίτερα δύσκολη για τον ιατρό τεχνολόγο. Ωστόσο, η ανάλυση ορισμένων ιστών για μικροοργανισμούς που προκαλούν ασθένειες θα απαιτήσει κανονικά περισσότερη ικανότητα και προσπάθεια, και ως εκ τούτου ο μισθός του ιατροτεχνολόγου είναι υψηλότερος. Ο τεχνολόγος πρέπει να είναι σε θέση να χειριστεί το δείγμα και να χειριστεί τα όργανα εξέτασης για τα πιο ακριβή αποτελέσματα.
Οι τεχνικές εξέτασης είναι συχνά σχετικά απλές για τον χαμηλόμισθο τεχνολόγο, όπως η εκτέλεση μιας βασικής πλήρους αιμοληψίας. Απλά εργαλεία, όπως οι ράβδοι, τοποθετούνται σε ένα υγρό δείγμα και αντιδρούν παράγοντας ένα χρώμα. Αυτή η αλλαγή χρώματος υποδεικνύει συγκεκριμένα χαρακτηριστικά για το δείγμα, όπως υψηλή χοληστερόλη ή σάκχαρα στο έργο του αίματος. Ορισμένες τεχνικές εμπλέκονται πολύ περισσότερο, όπως ο πειραματισμός σε ιστό για να βρεθούν σημάδια αλλεργίας ή ασθένειας. Αυτοί οι εξειδικευμένοι τεχνολόγοι πειραματισμού εγγυώνται υψηλότερους μισθούς δεδομένου ότι συμμετέχουν στην έρευνα και το συμπέρασμα των αποτελεσμάτων τους ως επιστημονικοί επαγγελματίες.
Ο τόπος απασχόλησης μπορεί επίσης να επηρεάσει τον μισθό ενός ιατροτεχνολόγου. Οι εργαζόμενοι μπορούν να απασχοληθούν σε ένα μεγάλο ή μικρό εργαστήριο, καθώς και σε ένα νοσοκομείο. Τα μεγάλα εργαστήρια και τα νοσοκομειακά περιβάλλοντα έχουν συνήθως έναν αριθμό διαφορετικών ιατρικών τεχνολόγων που εργάζονται σε διάφορα δείγματα. Κάθε μισθός θα βασίζεται στα διαφορετικά επίπεδα εργασίας κάθε εργαζόμενου.
Τα μικρότερα εργαστήρια μπορούν να απασχολούν μόνο μερικούς τεχνολόγους, απαιτώντας από αυτούς να καλύψουν πολλές διαφορετικές διαδικασίες εξέτασης δειγμάτων. Ως αποτέλεσμα, ο μισθός ενός ιατροτεχνολόγου μπορεί να είναι υψηλότερος σε αυτές τις εγκαταστάσεις, καθώς απαιτούνται περισσότερα καθήκοντα εργασίας από κάθε άτομο. Κάθε εργαζόμενος πρέπει να έχει καλή γνώση όλων των οργάνων και των διαδικασιών εξέτασης, αντί να ειδικεύεται σε έναν τομέα.
Οι ώρες εργασίας είναι ένας άλλος παράγοντας που μπορεί να οδηγήσει σε διαφορετικά ποσοστά αμοιβής για έναν ιατρό τεχνολόγο. Πολλά μεγάλα νοσοκομεία και εγκαταστάσεις διαθέτουν 24ωρη εξυπηρέτηση ασθενών που απαιτούν από έναν ή περισσότερους τεχνολόγους να εργάζονται ανά πάσα στιγμή. Οι νυχτερινές βάρδιες προσφέρουν συνήθως υψηλότερους μισθούς, έτσι ώστε η θέση να είναι πιο ελκυστική για τους αιτούντες. Ορισμένοι εργοδότες προσφέρουν επίσης περιστρεφόμενες βάρδιες, έτσι ώστε οι εργαζόμενοι να μην εργάζονται ούτε νύχτες ούτε ημέρες αποκλειστικά.