Τα διαδικτυακά μαθήματα μικροβιολογίας προσφέρονται σε πολλά διαφορετικά εκπαιδευτικά επίπεδα και διαφέρουν σημαντικά στον όγκο της εργασίας που απαιτείται για την ολοκλήρωση ενός μαθήματος. Τα μαθήματα έχουν επίσης μεγάλες διαφορές σε τιμή και ποιότητα. Εκτός και αν κάποιος παρακολουθήσει ένα μάθημα μικροβιολογίας απλώς για την αγάπη της μάθησης, το πιο σημαντικό στοιχείο για την επιλογή ενός διαδικτυακού μαθήματος μικροβιολογίας είναι εάν το μάθημα θα πληροί τις απαιτήσεις για τον κύριο εκπαιδευτικό στόχο. Στις περισσότερες περιπτώσεις, ο συνολικός εκπαιδευτικός στόχος για έναν φοιτητή που ψάχνει ένα διαδικτυακό μάθημα μικροβιολογίας είναι να μεταφερθεί σε ένα πρόγραμμα επιστημών υγείας, όπως ένα εγγεγραμμένο νοσηλευτικό, άδεια πρακτικής νοσηλευτικής ή εργαστήριο τεχνολογίας εργαστηρίου.
Προκειμένου να ελαχιστοποιηθούν τα προβλήματα με τη μεταφορά του μαθήματος, κάθε διαδικτυακό μάθημα που εξετάζει ένας φοιτητής θα πρέπει να προέρχεται από αναγνωρισμένο περιφερειακό ίδρυμα. Επιπλέον, τα περισσότερα προγράμματα επιστημών υγείας θέλουν βασικά μαθήματα επιστήμης όπως η μικροβιολογία να περιλαμβάνουν εργαστηριακό στοιχείο. Αυτό είναι πιο δύσκολο, αλλά όχι αδύνατο, να βρεθεί σε ένα online μάθημα μικροβιολογίας. Υπάρχουν ορισμένες δραστηριότητες που συνήθως εμπλέκονται σε ένα εργαστήριο μικροβιολογίας που δεν είναι διαθέσιμες μέσω της εξ αποστάσεως εκπαίδευσης. Για παράδειγμα, η καλλιέργεια βακτηρίων είναι μια συνηθισμένη πρακτική στο εργαστήριο μικροβιολογίας, αλλά δεν θεωρείται ασφαλής δραστηριότητα στο σπίτι.
Ορισμένα σχολεία αντιμετωπίζουν αυτό το πρόβλημα προσφέροντας μόνο το τμήμα της τάξης για το μάθημα της μικροβιολογίας στο διαδίκτυο. Ο μαθητής καλείται να ολοκληρώσει το εργαστηριακό στοιχείο σε ένα τοπικό σχολείο. Αυτό μετριάζει κάπως την ευκολία της επιλογής στο διαδίκτυο. Άλλα σχολεία προσφέρουν εργαστήριο στο σπίτι παρέχοντας μικροσκόπια ενοικίασης και στέλνοντας στους μαθητές προκαθορισμένες διαφάνειες για προβολή. Αυτό μπορεί να είναι μια καλύτερη επιλογή για έναν μαθητή που δεν μπορεί να ταξιδέψει σε ένα τοπικό σχολείο, αν και πιθανότατα θα αυξήσει κάπως την τιμή του μαθήματος.
Ένας άλλος παράγοντας που πρέπει να λάβουν υπόψη οι μαθητές όταν επιλέγουν ένα διαδικτυακό μάθημα μικροβιολογίας είναι η μέθοδος που χρησιμοποιεί το σχολείο για την αξιολόγηση της γνώσης. Ορισμένα σχολεία χρησιμοποιούν ένα διαδικτυακό σύστημα δοκιμών, συνήθως χρονομετρημένο για να αποτρέψει την εκτεταμένη χρήση άλλου υλικού πόρων. Άλλα σχολεία απαιτούν από τους μαθητές να βρουν τον δικό τους προστάτη και να κάνουν ένα διαδικτυακό τεστ με έναν καθηγητή που παρακολουθεί. Αυτό μπορεί να προσθέσει σημαντικά τον χρόνο εκτός σπιτιού που απαιτείται για το μάθημα, οπότε μπορεί να μην είναι μια καλή επιλογή για φοιτητές με μικρή ευελιξία στο πρόγραμμά τους.
Τέλος, κατά την επιλογή ενός διαδικτυακού μαθήματος μικροβιολογίας, ο μαθητής θα πρέπει να ρωτήσει για τον αριθμό των μαθητών στο διαδικτυακό μάθημα. Ενώ ένα μεγάλο μέγεθος τάξης μπορεί να είναι δύσκολο για τον μαθητή που χρειάζεται επιπλέον βοήθεια σε ένα παραδοσιακό περιβάλλον τάξης, είναι ακόμη περισσότερο εμπόδιο στη μάθηση με διαδικτυακή εκπαίδευση. Ρωτήστε επίσης εάν ο εκπαιδευτής θα είναι διαθέσιμος μόνο μέσω email ή τηλεφωνικά. Ιδανικά, ένα καλό διαδικτυακό μάθημα μικροβιολογίας θα παρέχει έναν εκπαιδευτή στον οποίο ο φοιτητής μπορεί να καλέσει για βοήθεια ή με ερωτήσεις κατά τις κανονικές προγραμματισμένες ώρες γραφείου.