Η αμοξικιλλίνη είναι ένα από τα τρία αντιβιοτικά που συνταγογραφούνται συχνά για τη θεραπεία των χλαμυδίων, μιας σεξουαλικά μεταδιδόμενης ασθένειας, αλλά η αποτελεσματικότητά της εξαρτάται από το άτομο. Μερικοί άνθρωποι ανακαλύπτουν ότι έχουν ανοσία σε ορισμένα αντιβιοτικά ή παρουσιάζουν αρνητικές παρενέργειες και ο πάροχος υγειονομικής περίθαλψης του/της θα αλλάξει φάρμακα. Συνήθως συνταγογραφείται ένα σχήμα επτά ημερών αμοξικιλλίνης για τα χλαμύδια, επειδή δρα αναστέλλοντας την ανάπτυξη του βακτηρίου Chlamydia trachomatis. Η σοβαρότητα της νόσου μπορεί επίσης να αλλάξει το αντιβιοτικό που συνταγογραφεί ο γιατρός επειδή υπάρχουν διάφορα στάδια της νόσου.
Τα χλαμύδια μπορεί συχνά να είναι δύσκολο να εντοπιστούν επειδή δεν έχουν πάντα συμπτώματα ή τα συμπτώματα μπορεί να είναι τόσο ήπια που να περνούν απαρατήρητα. Ο πάσχων μπορεί να μην εμφανίσει σημάδια ασθένειας μέχρι να προχωρήσει και γι’ αυτό θα πρέπει να συμβουλευτείτε αμέσως έναν γιατρό. Οι γυναίκες συχνά παρατηρούν μη φυσιολογικές κολπικές εκκρίσεις και πόνο κατά την ούρηση, που θα μπορούσε να συνοδεύεται από πυρετό. Οι άνδρες συνήθως αισθάνονται πόνο κατά την ούρηση και μπορεί να παρατηρήσουν εκκρίσεις γύρω από την άκρη του πέους.
Η θεραπεία συνήθως περιλαμβάνει λήψη αντιβιοτικών, όπως αμοξικιλλίνη, επανέλεγχο μόλις ολοκληρωθεί το αντιβιοτικό και αποχή από οποιαδήποτε μορφή σεξουαλικής δραστηριότητας έως ότου τα αποτελέσματα των εξετάσεων είναι αρνητικά. Αυτή η ασθένεια είναι εξαιρετικά μεταδοτική και μπορεί να μεταδοθεί με διάφορες σεξουαλικές πράξεις καθώς και από τη μητέρα στο αγέννητο παιδί. Η αζριθρομυκίνη και η δοξυκυκλίνη είναι τα άλλα δύο αντιβιοτικά που συνήθως συνταγογραφούνται για τη θεραπεία των χλαμυδίων και ο καθοριστικός παράγοντας βασίζεται συνήθως στο στάδιο της νόσου, στο ιατρικό ιστορικό του ατόμου και στον συνταγογραφούντα ιατρό.
Εάν η νόσος δεν αντιμετωπιστεί, μπορεί να εμφανιστούν σοβαρές επιπλοκές, συμπεριλαμβανομένης της φλεγμονώδους νόσου της πυέλου στις γυναίκες και της μη γονοκοκκικής ουρηθρίτιδας, μιας λοίμωξης της ουρήθρας, στους άνδρες. Οι συνέπειες για τις έγκυες γυναίκες χωρίς θεραπεία και τα αγέννητα παιδιά τους είναι πολύ πιο σοβαρές. Τα παιδιά μπορεί να εμφανίσουν προβλήματα στους πνεύμονες, τύφλωση ή πνευμονία μετά τη γέννηση. Οι έγκυες γυναίκες είναι η πιο κοινή ομάδα που συνταγογραφείται αμοξικιλλίνη για τα χλαμύδια επειδή είναι ασφαλέστερη από τα άλλα προαναφερθέντα αντιβιοτικά, τα οποία συνήθως δεν συνιστώνται κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης.
Προληπτικά για αυτήν και άλλες σεξουαλικά μεταδιδόμενες ασθένειες είναι η αποχή, οι περιορισμένοι σεξουαλικοί σύντροφοι, το ασφαλές σεξ και οι συχνοί έλεγχοι όταν είναι σεξουαλικά ενεργοί. Τα χλαμύδια μπορεί να είναι παρόντα για παρατεταμένες χρονικές περιόδους χωρίς συμπτώματα, κάτι που μπορεί να είναι επικίνδυνο για το μολυσμένο άτομο καθώς και για τους σεξουαλικούς του/της συντρόφους. Κάθε σεξουαλική δραστηριότητα θα πρέπει να αποφεύγεται όσο ένα άτομο υποβάλλεται σε θεραπεία για χλαμύδια, επειδή ο ασθενής εξακολουθεί να είναι μεταδοτικός. Ο πάροχος υγειονομικής περίθαλψης συνήθως θα τον/την επανεξετάσει μετά την ολοκλήρωση της φαρμακευτικής αγωγής σε περίπτωση που δεν ήταν αποτελεσματική και θα συμβουλεύσει τον ασθενή πότε μπορεί να συνεχιστεί η σεξουαλική δραστηριότητα.