Η λαπαροσκοπική χειρουργική είναι η πιο κοινή διαδικασία που εκτελείται για τη διάγνωση της ενδομητρίωσης και την αφαίρεση ενδομητρικών κύστεων – μη καρκινικών μαζών που περιέχουν σωματίδια ενδομητρικού ιστού. Ανάλογα με την ασθενή και τη σοβαρότητα της ενδομητρίωσης της, η λαπαροσκοπική χειρουργική μπορεί να είναι μια εξαιρετικά αποτελεσματική θεραπεία. Η χειρουργική επέμβαση είναι ελάχιστα επεμβατική και συνήθως εκτελείται σε βάση εξωτερικών ασθενών. Οι ασθενείς συχνά βιώνουν άμεση ανακούφιση από τον πόνο και σε πολλές περιπτώσεις, είναι δυνατή η αυξημένη γονιμότητα. Τα αποτελέσματα από τη χειρουργική επέμβαση μπορεί να είναι μόνιμα, αλλά πολλές γυναίκες εμφανίζουν υποτροπές και χρειάζονται περαιτέρω θεραπεία.
Κατά τη λαπαροσκοπική επέμβαση για ενδομητρίωση, γίνεται μια μικρή τομή στη βάση του ναυτικού. Η κοιλιά είναι γεμάτη με αέριο —συνήθως διοξείδιο του άνθρακα— το οποίο φουσκώνει την κοιλιά, επιτρέποντας στον γιατρό να βλέπει πιο εύκολα μόλις τοποθετήσει το λαπαροσκόπιο, ένα μικρό, φωτισμένο όργανο με κάμερα που επιτρέπει στον χειρουργό να εξετάσει τη μήτρα και τις ωοθήκες του ασθενούς του χωρίς κάνει ανοιχτή επέμβαση. Συχνά, η λαπαροσκοπική χειρουργική γίνεται για τη διάγνωση της ενδομητρίωσης. Εάν εντοπιστεί ενδομητρίωμα, μπορεί να αφαιρεθεί. Για να γίνει αυτό, ο χειρουργός θα κάνει μία ή περισσότερες πρόσθετες τομές στην κοιλιά, μέσω των οποίων μπορεί να εισάγει τα χειρουργικά του εργαλεία.
Ένας γυναικολόγος μπορεί να συστήσει λαπαροσκοπική χειρουργική επέμβαση για την ενδομητρίωση εάν ο ασθενής του εμφανίσει μη φυσιολογικό πόνο που σχετίζεται με τον εμμηνορροϊκό κύκλο, τη στειρότητα ή άλλα συμπτώματα ενδομητρίωσης. Το πλεονέκτημα της λαπαροσκοπικής χειρουργικής για την ενδομητρίωση είναι ότι είναι μια σχετικά σύντομη επέμβαση, που συνήθως διαρκεί 30 έως 45 λεπτά. Μπορεί να γίνει σε εξωτερικά ιατρεία και ο χρόνος αποκατάστασης μετά το χειρουργείο είναι συνήθως μόνο λίγες ημέρες έως μία εβδομάδα. Για τις γυναίκες που αντιμετωπίζουν κοιλιακό άλγος, η λαπαροσκοπική χειρουργική μπορεί να προσφέρει άμεση ανακούφιση από τον πόνο σε πολλές περιπτώσεις, ενώ μια εναλλακτική θεραπεία, όπως η ορμονοθεραπεία, μπορεί να μην είναι.
Για τις γυναίκες που αναζητούν ανακούφιση από τον πόνο που σχετίζεται με την ενδομητρίωση, η λαπαροσκοπική χειρουργική είναι αποτελεσματική στο 70 έως 100% των γυναικών κατά τους πρώτους μήνες μετά την επέμβαση. Στο 45% των γυναικών τα συμπτώματα επανεμφανίζονται τον πρώτο χρόνο μετά την επέμβαση. Όσο πιο προχωρημένη είναι η ενδομητρίωση, τόσο πιο πιθανό είναι μια γυναίκα να εμφανίσει υποτροπή ενδομητρίωσης ή ενδομήτριο πόνο. Κατά τη διάρκεια της λαπαροσκοπικής χειρουργικής για ενδομητρίωση, ο χειρουργός μπορεί είτε να παροχετεύσει ή να κόψει μέρος ενός ενδομητρώματος ή μπορεί να αφαιρέσει εντελώς την ενδομητρική κύστη. Πολλοί γιατροί συνιστούν την πλήρη αφαίρεση ως την πιο αποτελεσματική μέθοδο για την ανακούφιση του ενδομητρικού πόνου και για την πρόληψη της επανεμφάνισης της ενδομητρίωσης.
Γυναίκες των οποίων η υπογονιμότητα σχετίζεται με ενδομητρίωση έχουν διαφορετικά αποτελέσματα μετά από λαπαροσκοπική επέμβαση για ενδομητρίωση. Η λαπαροσκόπηση φαίνεται να είναι λιγότερο αποτελεσματική σε ήπιες περιπτώσεις ενδομητρίωσης. Ωστόσο, σε μέτριες έως βαριές περιπτώσεις, η λαπαροσκοπική επέμβαση για την ενδομητρίωση μπορεί να είναι χρήσιμη και μπορεί να οδηγήσει σε αύξηση της γονιμότητας. Άλλοι παράγοντες που καθορίζουν σε μεγάλο βαθμό τη γονιμότητα μιας γυναίκας μετά από λαπαροσκοπική επέμβαση για ενδομητρίωση περιλαμβάνουν την ηλικία της, τη βιωσιμότητα των ωαρίων της και τον κίνδυνο για αποβολή.