Fagotul și oboiul sunt ambele instrumente de suflat din lemn cu stuf dublu, dar au câteva diferențe semnificative care le deosebesc unul de altul. Câteva dintre diferențele care sunt imediat evidente atunci când ne uităm la cele două instrumente includ dimensiunea, forma și amplasarea piesei bucale. Fagotul și oboiul au, de asemenea, sunete diferite, fagotul cântând într-un registru mult mai scăzut decât oboiul. Deși versiunile pentru studenți ale ambelor instrumente sunt adesea construite din plastic durabil din rășină, modelele de calitate superioară pentru muzicienii experimentați sunt realizate din diferite tipuri de lemn. Sistemele de tastare sunt, de asemenea, foarte diferite între cele două instrumente, împreună cu modul în care sunt ținute.
Când sunt examinate unul lângă altul, mai multe diferențe între fagot și oboi sunt imediat evidente. Aspectul general al fiecărui instrument este distinctiv. Fagotul este mult mai mare decât oboiul și este format din aproximativ 7 până la 8 picioare (aproximativ 2.13 până la 2.44 metri) de tuburi îndoite într-o formă de U neuniformă. Partea mai scurtă și mai îngustă este locul unde piesa bucală cu cârlig este atașată la aproximativ jumătatea lungimii instrumentului; celălalt capăt este mult mai larg și se extinde dincolo de muștiuc. Oboiul este construit dintr-o singură lungime de țeavă dreaptă, care se deschide într-o formă ușoară de clopot în partea de jos și are un muștiuc și o trestie atașată în partea de sus.
Atât fagotul, cât și oboiul produc sunet atunci când muzicianul suflă aer în trestia dublă, provocând vibrații care rezonează în interiorul tubului. Fiecare instrument are un sunet și o gamă specifică. Fagotul este capabil să cânte într-un registru foarte scăzut, cu cel mai scăzut sunet din familia de instrumente de suflat, cu excepția contrafagotului mai mare. Oboiul este capabil să cânte note mai înalte, iar sunetul său a fost comparat cu cel al unei rațe, cu un ton foarte clar care este ușor de distins între celelalte instrumente din orchestră. Ambele instrumente sunt remarcate pentru expresivitatea lor.
Versiunile pentru studenți ale ambelor instrumente sunt de obicei realizate din plastic rășin, deoarece este durabil. Un instrument de calitate superioară este de obicei ales de muzicieni mai experimentați. Fagotul și oboiul sunt de obicei realizate din diferite tipuri de lemn. Fagotul este adesea realizat din arțar, deși poate fi construit din alte tipuri de lemn cu un nivel mediu de duritate. Oboiul este cel mai adesea realizat dintr-un lemn cunoscut sub numele de African Blackwood sau grenadila.
Fiecare instrument are un sistem de tastare diferit. Tastele sunt folosite împreună cu degetele pentru a acoperi găurile din tubulatura instrumentului pentru a produce note specifice. Fagotul are mai puține clape, în timp ce oboiul are un număr relativ mare, cu aproximativ 45 de piese complexe de clape.
Fagotul și oboiul sunt de asemenea ținute diferit. Datorită dimensiunii sale, fagotul este ținut de o parte a muzicianului, adesea cu un suport suplimentar, cum ar fi un scaun sau o curea de gât. Muzicianul este de obicei capabil să țină oboiul în fața corpului său, deoarece este mult mai mic.