Medula oblongata împreună cu măslina inferioară, piramidele și puțul formează regiunea creierului cunoscută sub numele de trunchi cerebral. Această regiune este responsabilă pentru procesele sistemului nervos autonom care controlează ritmul cardiac, respirația, sensibilitatea la durere, vărsăturile și reflexele vasomotorii. Fiind porțiunea trunchiului cerebral care leagă pontul de măduva spinării, medulara oblongata ar fi ușor de confundat cu țesutul spinal dacă nu ar fi structurile piramidale distincte de pe părțile sale laterale. Medula oblongata este alcătuită predominant din substanță albă și cenușie; adăpostește, de asemenea, căile de comunicare care transportă mesaje între emisfere, precum și între creier și măduva spinării. Având în vedere că întreaga structură măsoară mai puțin de 1.2 inchi (3 cm) în lungime, funcțiile individuale ale majorității elementelor sale microscopice nu sunt bine înțelese.
Parcurgând în întregime jumătatea superioară a medulei oblongate se află fibrele arciforme. Acestea se găsesc atât în adâncul medulului, cât și pe suprafața acesteia. Cele mai profunde fibre sunt cele mai frecvente, conectând nucleii funiculus gracilis, funiculus cuneatus și corpul restiform de rafe.
Rafe se găsește chiar deasupra piramidelor din centrul medulei oblongate. Este compus dintr-un amestec dens de neuroni și fibre nervoase. Fibrele sale se extind în numeroase direcții, dintre care unele se conectează la podeaua ventriculului al patrulea.
Uneori considerat porțiunea cea mai inferioară a puțului, cel de-al patrulea ventricul poate fi considerat și porțiunea cea mai superioară a medulei oblongate. În cadrul acestuia se găsesc nucleul hipoglos și nucleul ambiguu, precum și punctul de origine atât al nervilor accesorii hipoglos, cât și al nervilor accesori glosofaringieni. Această structură în formă de diamant are atât podea, cât și acoperiș. Acoperișul este format din vela medulară, iar podeaua este formată din fosa romboidă și formatio reticularis.
Formatio reticularis este o structură neobișnuită care se găsește în spatele măslinei și piramidelor. Este alcătuit din fascicule de fibre nervoase dispuse la unghi de 90 de grade unul față de celălalt. Se conectează la măslin, măduva spinării, funiculus cuneatus și funiculus gracilis.
Substanța cenușie se găsește în toată partea laterală a medulului. În cadrul acestuia se află un număr mare de nuclee vitale care sunt utilizate pentru transmiterea informațiilor senzoriale din sistemul nervos periferic. Substanța cenușie conține și mulți nervi cranieni.