Principala problemă de sănătate asociată cu guanoul liliecilor este histoplasmoza. Această boală aeriană își are originea într-o ciupercă care trăiește în excrementele de lilieci. Poate afecta sistemul respirator al oricărui om care respiră aer care a fost expus la acesta. Organismul este de obicei capabil să lupte cu această boală, cu toate acestea, persoanele cu un sistem imunitar compromis pot necesita medicamente pentru tratament.
Liliecii aleg adesea să se odihnească în poduri și să deschidă căpriorii caselor și hambarelor. Dorm ziua, vânează noaptea și pot crea cuiburi extinse prin împerechere și naștere de pui după câteva sezoane. Guanoul de lilieci pe care îl lasă în urmă, atât în interiorul zonelor superioare ale casei, cât și pe pământ în exterior, este foarte toxic pentru oameni dacă este deranjat.
Histoplasmoza poate trăi deasupra guanoului de lilieci sau în sol care a fost expus la excremente. Când guanoul este agitat în orice fel, ciuperca devine rapid în aer. Poate circula în aerul respirabil al unei case sau al unei clădiri și poate infecta plămânii oricărei persoane care o inhalează.
Boala necesită de obicei o perioadă de aproximativ zece zile pentru a germina și a începe să evidențieze simptomele. Pacienții tind să se plângă de febră, dureri în piept, tuse, dureri de cap și pierderea poftei de mâncare. Sistemul imunitar al organismului este, în general, capabil să lupte împotriva bolii și să experimenteze o recuperare completă în câteva săptămâni. Cei cu sistem imunitar compromis, cum ar fi persoanele care sunt deja bolnave de o altă boală sau au fost infectate cu SIDA, pot necesita tratament, inclusiv medicamente și spitalizare.
Multe țări, inclusiv SUA, protejează liliecii ca specie pe cale de dispariție și nu permit ca aceștia să fie exterminați în timpul procesului de îndepărtare. Proprietarii pot dori să contacteze un exterminator profesionist care poate elimina complet infestarea fără a ucide animalele. Ei ar trebui să sigileze imediat toate deschiderile rămase către podul sau căpriorii casei odată ce acest lucru a fost finalizat, pentru a preveni întoarcerea animalelor. Unele dintre aceste servicii percep și o taxă pentru îndepărtarea deșeurilor animalelor.
Guanoul de lilieci este toxic doar dacă este deranjat și se va disipa de la sine în mod inofensiv în aer dacă este lăsat neatins după doi sau trei ani. Dacă infestarea a avut loc într-o parte a casei care poate fi etanșată de ocupanți sau într-o anexă rar folosită, atunci ar putea fi benefic să nu îndepărtați deloc excrementele. Cele mai multe cazuri de îmbolnăvire prin expunerea la acest tip de deșeuri apar după ce un cuib sau pământul din apropierea cuibului a fost curățat și îndepărtat. Dacă un proprietar preferă să curețe zona, ar trebui să poarte o mască de față care poate filtra particulele de până la un milimicron. Ar trebui să folosească un aspirator cu un filtru de aer de înaltă eficiență pentru a îndepărta deșeurile și a le arunca imediat într-un sac de gunoi sigilat.