Τα χημικά εμπόδια, όπως σχετίζονται με την ανθρώπινη ανοσολογία, είναι λιπαρά οξέα, πρωτεΐνες, σωματικές εκκρίσεις και άλλες ουσίες με φυσικά χαρακτηριστικά που βοηθούν στην άμυνα του οργανισμού από ασθένειες ή λοιμώξεις. Τέτοιες ουσίες μπορεί να έχουν αντιμικροβιακές ιδιότητες, χαμηλό ρΗ, ή να χρησιμεύουν για τη διάσπαση ή την αποσταθεροποίηση βακτηριακών κυττάρων. Τα περισσότερα από αυτά τα εμπόδια δεν έχουν σχεδιαστεί ως κύρια άμυνα του ανοσοποιητικού συστήματος, αλλά μάλλον έχουν τέτοιες ιδιότητες ως δευτερεύουσα λειτουργία. Λίγοι υπάρχουν αποκλειστικά ως αμυντικός μηχανισμός για το ανοσοποιητικό σύστημα.
Το ανθρώπινο σώμα διαθέτει πολλά συστήματα για την άμυνα ενάντια σε πιθανές απειλές ή λοιμώξεις, συμπεριλαμβανομένης της έμφυτης ή προσαρμοσμένης ανοσίας, ενεργών ή παθητικών μηχανισμών και ανατομικών, χυμικών ή κυτταρικών φραγμών. Όσον αφορά την κατηγοριοποίηση των χημικών φραγμών, αυτοί οι μηχανισμοί είναι έμφυτοι, παθητικοί και ανήκουν στον τίτλο των ανατομικών φραγμών.
Ως μέρος του έμφυτου ανοσοποιητικού συστήματος, τέτοια εμπόδια είναι ενσωματωμένα κατά τη γέννηση. Με άλλα λόγια, το σώμα δεν χρειάζεται να προσαρμόσει το ανοσοποιητικό σύστημα για την καταπολέμηση των λοιμώξεων χρησιμοποιώντας αυτά τα εμπόδια επειδή υπάρχουν πριν από την πρώτη ημέρα της ζωής ενός ατόμου. Η κατηγοριοποίηση των χημικών φραγμών ως παθητικών δείχνει ότι η υποβοήθηση του ανοσοποιητικού συστήματος είναι μια δευτερεύουσα λειτουργία. Ως ανατομικά εμπόδια, υπάρχουν εκτός των ιστών του σώματος και όχι σε κυτταρικό επίπεδο.
Οι πρωτεΐνες, τα οξέα, οι εκκρίσεις και τα ένζυμα που συνθέτουν χημικά εμπόδια παράγονται για να εκτελούν συγκεκριμένες πρωτογενείς εργασίες ως μέρος φυσιολογικών ή ακούσιων σωματικών λειτουργιών. Για παράδειγμα, το σώμα παράγει ιδρώτα ως μέρος του φυσικού του συστήματος ψύξης. Η εφίδρωση είναι επίσης ένα παθητικό φράγμα για το ανθρώπινο ανοσοποιητικό σύστημα επειδή το χαμηλό pH του εμποδίζει την ανάπτυξη των βακτηρίων.
Άλλες άμυνες περιλαμβάνουν σάλιο, δάκρυα και ρινικές εκκρίσεις. Αυτές οι ουσίες περιέχουν τόσο λυσοζύμη όσο και φωσφολιπάση, ουσίες που διασπούν φυσικά το εξωτερικό τοίχωμα και τις κυτταρικές μεμβράνες των βακτηριακών κυττάρων. Ο πρωταρχικός σκοπός του σάλιου είναι να βοηθήσει στην πέψη, όπου τα δάκρυα και οι ρινικές εκκρίσεις βοηθούν στην έκπλυση ξένων ουσιών και διατηρούν τις μεμβράνες του σώματος υγρές. Το γεγονός ότι αυτές οι χημικές ουσίες έχουν επίσης αρνητική επίδραση στα απειλητικά βακτήρια είναι περισσότερο παρενέργεια από την πρωταρχική λειτουργία.
Τα εσωτερικά χημικά εμπόδια προστατεύουν επίσης από τη μόλυνση σε περίπτωση που βακτήρια ή άλλες απειλές εισέλθουν σε εσωτερικά συστήματα ή όργανα. Οι πρωτεΐνες στους πνεύμονες και το γαστρεντερικό σωλήνα, γνωστές ως defensins, έχουν αντιμικροβιακές ιδιότητες που σκοτώνουν ορισμένους τύπους βακτηρίων. Άλλες χημικές ουσίες του γαστρεντερικού ανταγωνίζονται τα μολυσματικά κύτταρα για θρεπτικά συστατικά ή προσκολλώνται στα κυτταρικά τοιχώματα, λιμοκτονούν επιβλαβή ή απειλητικά κύτταρα. Όπως και τα λιπαρά οξέα στον ιδρώτα, οι χημικές ουσίες του γαστρεντερικού έχουν επίσης χαμηλό pH, το οποίο εμποδίζει περαιτέρω την ανάπτυξη επιβλαβών βακτηρίων μέσα στο σώμα.