Το μικροσκόπιο φθορισμού είναι ένα μικροσκόπιο που χρησιμοποιείται για την εξέταση δειγμάτων με ιδιότητες φωταύγειας ή δειγμάτων που έχουν παρασκευαστεί με ουσίες που δημιουργούν ιδιότητες φωταύγειας. Σε αυτόν τον τύπο μικροσκοπίας, το ίδιο το δείγμα είναι η πηγή φωτός. Πολλές πληροφορίες μπορούν να συλλεχθούν με τη χρήση μικροσκοπίου φθορισμού και αυτά τα μικροσκόπια μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν για τη δημιουργία εκπληκτικών εικόνων στις οποίες οι λεπτομερείς δομές είναι σαφώς ορατές.
Αυτά τα μικροσκόπια εκμεταλλεύονται τις ιδιότητες ορισμένων χημικών ενώσεων. Όταν διεγείρονται από το φως του κατάλληλου μήκους κύματος, το κλασικό υπεριώδες φως, αυτές οι χημικές ουσίες θα ανάψουν. Εάν η φωταύγεια είναι σύντομη, είναι γνωστή ως φθορισμός, ενώ μια πιο παρατεταμένη περίοδος φωταύγειας μετά τη διέγερση ονομάζεται φωσφορισμός. Και στις δύο περιπτώσεις, το χρώμα της φωταύγειας θα ποικίλλει, ανάλογα με τις χημικές ουσίες που εμπλέκονται, όπως και η ακριβής διάρκεια της περιόδου φωταύγειας.
Σε ένα μικροσκόπιο φθορισμού, φως συγκεκριμένου μήκους κύματος διέρχεται μέσω ενός ειδικού συμπυκνωτή μικροσκοπίου που εστιάζει το φως σε μια πολύ στενή δέσμη. Όταν το φως χτυπά το δείγμα, οι φωταυγείς ενώσεις διεγείρονται και αρχίζουν να εκπέμπουν φως. Με τη χρήση ενός διχρωμικού καθρέφτη που φιλτράρει τη δέσμη φωτός που χρησιμοποιείται για τη διέγερση του δείγματος, ένας ερευνητής μπορεί να δει καθαρά τη φωταύγεια και να σημειώσει τις ιδιότητές του ή να τραβήξει μια φωτογραφία του δείγματος στη σκηνή του μικροσκοπίου για μελλοντική αναφορά.
Επειδή το φως που χρησιμοποιείται σε ένα μικροσκόπιο φθορισμού είναι συχνά δυνητικά επικίνδυνο για τα μάτια, είναι συνήθως απαραίτητο να χρησιμοποιείται ένα πολωτικό φίλτρο στο προσοφθάλμιο, έτσι ώστε τα μάτια του χρήστη να μην καταστραφούν από το μικροσκόπιο. Τα πολωτικά φίλτρα μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν για διόρθωση χρώματος ή για αύξηση της αντίθεσης, έτσι ώστε η φωταύγεια να είναι πιο ευδιάκριτη. Όπως και με άλλα μικροσκόπια, η ευκρίνεια της εικόνας μπορεί να ρυθμιστεί εστιάζοντας τα εξαρτήματα του μικροσκοπίου και το επίπεδο μεγέθυνσης μπορεί επίσης να αυξηθεί ή να μειωθεί ανάλογα με τις ανάγκες.
Σε ορισμένες περιπτώσεις, ένα δείγμα μπορεί να είναι φυσικά φωταύγεια, όπως στην περίπτωση ορισμένων ορυκτών που φθορίζουν ή φωσφορίζουν κάτω από φως συγκεκριμένου μήκους κύματος. Τα δείγματα μπορούν επίσης να επισημανθούν με μόρια γνωστά ως φθοροφόρα. Αυτά τα μόρια μπορούν να στοχεύσουν συγκεκριμένες δομές εντός του δείγματος, δημιουργώντας μια φθορίζουσα εικόνα των δομών, όταν το δείγμα διεγείρεται από το φως στο μικροσκόπιο.
Ένα μικροσκόπιο φθορισμού μπορεί να είναι μια ακριβή αγορά, ειδικά στην περίπτωση μικροσκοπίων υψηλής ποιότητας. Κατά γενικό κανόνα, αυτός ο τύπος μικροσκοπίας διατίθεται μόνο σε πολύ καλά εξοπλισμένα εργαστήρια.