Η ανάλυση κυτταρικού κύκλου είναι μια τεχνική που χρησιμοποιείται στη βιοχημική έρευνα για τον εντοπισμό και την ανάλυση της φάσης ενός βιολογικού κυττάρου. Κατά τη διάρκεια της ζωής του, ένα κύτταρο διέρχεται από μια σειρά κυκλικών φάσεων που συλλογικά είναι γνωστές ως κυτταρικός κύκλος. Η ποσότητα του δεοξυριβονουκλεϊκού οξέος (DNA) στο κύτταρο αλλάζει ανάλογα με τη φάση. Στην ανάλυση του κυτταρικού κύκλου, το DNA του κυττάρου χρωματίζεται με μια φθορίζουσα χρωστική, επιτρέποντας στους ερευνητές να προσδιορίσουν πόσο από το DNA υπάρχει και πού βρίσκεται το κύτταρο στον κύκλο του.
Ο κυτταρικός κύκλος αποτελείται από δύο ευρείες φάσεις: τη μεσόφαση και τη μίτωση. Η ενδιάμεση φάση αποτελείται από προετοιμασία για τη διαίρεση του κυττάρου, ή μίτωση, η οποία ονομάζεται επίσης φάση Μ. Το μεγαλύτερο μέρος του κύκλου ζωής του κυττάρου αφιερώνεται στην προετοιμασία για μίτωση, η οποία είναι σύντομη συγκριτικά, επομένως η μεσόφαση υποδιαιρείται σε τρία μέρη: φάση G1, φάση S και φάση G2.
Στο G1, το κύτταρο ασχολείται κυρίως με την ανάπτυξη. Κατά τη φάση S, η γενετική πληροφορία του κυττάρου με τη μορφή DNA αντιγράφεται ως προετοιμασία για τη διαίρεση του σε δύο θυγατρικά κύτταρα. Στο G2, το κύτταρο προετοιμάζεται για διαίρεση, οδηγώντας στη φάση Μ. Μετά τη μίτωση, το κύτταρο επιστρέφει στο τμήμα G1 της μεσόφασης και ο κύκλος ξεκινά ξανά. Τα κύτταρα που για κάποιο λόγο σταματούν να διαιρούνται εγκαταλείπουν τον κύκλο και υπάρχουν αδρανώς σε αυτό που είναι γνωστό ως φάση G0.
Το κύτταρο αντιγράφει το DNA του κατά τη φάση S, επομένως υπάρχει διπλάσιο DNA στο κύτταρο κατά τη διάρκεια των G2 και M από ότι υπάρχει στο G1 ή G0. Οι ερευνητές χρησιμοποιούν αυτές τις πληροφορίες στην ανάλυση του κυτταρικού κύκλου για να προσδιορίσουν την κυτταρική φάση. Η ανάλυση του κυτταρικού κύκλου μπορεί επίσης να αποκαλύψει ανωμαλίες στο κυτταρικό DNA.
Η τεχνική που χρησιμοποιείται στην ανάλυση του κυτταρικού κύκλου είναι γνωστή ως κυτταρομετρία ροής. Αρχικά, μια φθορίζουσα χρωστική εισάγεται στο κύτταρο που λερώνει τα μόρια του DNA δεσμεύοντας χημικά σε αυτά. Στη συνέχεια, οι ερευνητές χρησιμοποιούν ένα όργανο που ονομάζεται κυτταρόμετρο για να προσδιορίσουν την ένταση του φθορισμού του κυττάρου. Ένας υψηλότερος φθορισμός δείχνει ότι περισσότερη χρωστική ήταν ικανή να δεσμευτεί και δείχνει ότι υπάρχει περισσότερο DNA στο κύτταρο.
Συνήθως, η ανάλυση του κυτταρικού κύκλου χρησιμοποιείται σε μια ομαδοποίηση κυττάρων. Ένας τύπος γραφήματος που ονομάζεται ιστόγραμμα δημιουργείται από τα δεδομένα, που συχνά εμφανίζει δύο διακριτές κορυφές: μια που δείχνει τον πληθυσμό των κυττάρων στη φάση G1 και μια άλλη —διπλάσια υψηλότερη— που δείχνει εκείνα στη φάση G2. Η κορυφή της φάσης G2 είναι διπλάσια, επειδή τα κύτταρα σε αυτόν τον πληθυσμό περιέχουν διπλάσια ποσότητα DNA από αυτά στην κορυφή G1. Τα κύτταρα που βρίσκονται στη φάση S, τα οποία βρίσκονται ακόμη στη διαδικασία αντιγραφής του DNA, εμφανίζονται στο γράφημα σε ένα ενδιάμεσο επίπεδο μεταξύ των δύο κορυφών.