Η ανατομία του αναπαραγωγικού συστήματος περιλαμβάνει εκείνα τα όργανα, τους ιστούς και τα αγγεία που συμμετέχουν στη διαδικασία της αναπαραγωγής ή τη δημιουργία ενός ή περισσότερων απογόνων από έναν άνδρα και μια γυναίκα γονέα. Σε αντίθεση με τα άλλα συστήματα του ανθρώπινου σώματος, η ανατομία του αναπαραγωγικού συστήματος διαφέρει σημαντικά σε άνδρες και γυναίκες. Στις γυναίκες, τα κύρια όργανα περιλαμβάνουν τον κόλπο, τη μήτρα και τις ωοθήκες, ενώ στους άνδρες τα κύρια όργανα αναπαραγωγής είναι το πέος, το όσχεο και οι όρχεις. Οι σάλπιγγες και ο τράχηλος συνδέουν αυτά τα όργανα στο γυναικείο αναπαραγωγικό σύστημα, ενώ στους άνδρες, τα αγγεία περιλαμβάνουν την επιδιδυμίδα και τα σπλάχνα. Μια συζήτηση για την ανατομία του αναπαραγωγικού συστήματος πρέπει επίσης να περιλαμβάνει τις μικρότερες μονάδες του, το σπερματοζωάριο στους άνδρες και το ωάριο ή το ωάριο στις γυναίκες.
Τόσο στους άνδρες όσο και στις γυναίκες, η ανατομία του αναπαραγωγικού συστήματος μπορεί να χωριστεί σε εξωτερικά και εσωτερικά όργανα. Το θηλυκό εξωτερικό όργανο αναφέρεται συχνά ως κόλπος. Αυτό το όργανο, ωστόσο, είναι τεχνικά το εσωτερικό κανάλι που οδηγεί το σπέρμα του άνδρα στη μήτρα.
Τα εξωτερικά γυναικεία γεννητικά όργανα περιλαμβάνουν τα προστατευτικά χείλη, τις μεγάλες πτυχώσεις που τυλίγουν τα υπόλοιπα εξωτερικά όργανα: τα μικρά χείλη, την κλειτορίδα και τους αδένες του Bartholin. Τα μικρά χείλη είναι οι μικρότερες πτυχώσεις που προστατεύουν το κολπικό άνοιγμα καθώς και το άνοιγμα προς την ουρήθρα ή το ουροποιητικό σύστημα. Η κλειτορίδα είναι ένα μικρό, γεμάτο νεύρα όργανο μπροστά από το κολπικό άνοιγμα που είναι ομόλογο με το αρσενικό πέος. Οι γυναίκες έχουν επίσης αδένες Bartholin, οι οποίοι απελευθερώνουν εκκρίσεις που παρέχουν αρχική λίπανση για το πέος κατά την είσοδο στον κόλπο.
Τα εξωτερικά όργανα του ανδρικού αναπαραγωγικού συστήματος περιλαμβάνουν το πέος, τους όρχεις και το όσχεο. Το πέος είναι το όργανο που επιτρέπει στο σπέρμα να φτάσει στο θηλυκό ωάριο κατά τη διάρκεια της επαφής, ή κολπική διείσδυση. Πυκνό με αιμοφόρα αγγεία, καθίσταται όρθιο κατά τη διάρκεια της διέγερσης λόγω της ορμής της ροής αίματος στην περιοχή, επιτρέποντάς του να διεισδύσει στον γυναικείο κόλπο. Πίσω από το πέος βρίσκεται το όσχεο, ο εξωτερικός σάκος που περιέχει και προστατεύει τους ζευγαρωμένους όρχεις. Αυτοί οι όρχεις ή όρχεις είναι τα όργανα που παράγουν σπέρμα, τα αρσενικά αναπαραγωγικά κύτταρα.
Η ανατομία του αναπαραγωγικού συστήματος πρέπει επίσης να περιλαμβάνει τα εσωτερικά όργανα της αναπαραγωγής. Στις γυναίκες, αυτοί είναι ο κόλπος, η μήτρα και οι ωοθήκες. Ο κόλπος είναι το επεκτάσιμο κανάλι, μόλις λίγα εκατοστά βάθος, που οδηγεί στη μήτρα και μέσα από το οποίο περνά ένα μωρό κατά τον τοκετό. Στο πίσω μέρος του κόλπου βρίσκεται ο τράχηλος, ένα άνοιγμα μέσω του οποίου το σπέρμα περνά καθ ‘οδόν προς τη μήτρα. Η μήτρα είναι ο χώρος όπου το έμβρυο αναπτύσσεται κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης και μπορεί επίσης να επεκταθεί πολύ.
Και στις δύο πλευρές της άνω μήτρας, οι σάλπιγγες οδηγούν στις ωοθήκες, τα γυναικεία σεξουαλικά όργανα. Αυτά τα όργανα παράγουν ωάρια ή ωάρια που απελευθερώνονται κάθε μήνα προκειμένου να γονιμοποιηθούν από το αρσενικό σπέρμα. Εάν αυτό δεν συμβεί, αποβάλλονται από το σώμα μαζί με το βλεννογόνο της μήτρας, όπου το γονιμοποιημένο ωάριο θα έμπαινε κατά τη σύλληψη, με τη μορφή εμμήνου ρύσεως.
Η εσωτερική ανατομία του ανδρικού αναπαραγωγικού συστήματος περιλαμβάνει την ουρήθρα, τα vas deferens και την επιδιδυμίδα. Αρχίζοντας με το άνοιγμα στην άκρη του πέους, η ουρήθρα είναι το εσωτερικό αγγείο που μεταφέρει το σπέρμα, το υγρό που περιέχει σπέρμα και τα ούρα έξω από το σώμα. Οδηγεί στο vas deferens, τον σωλήνα που φέρνει σπέρμα στην ουρήθρα.
Η επιδιδυμίδα είναι η μονάδα αποθήκευσης των όρχεων. Βρίσκεται πίσω από κάθε όρχι και είναι ένας σωλήνας που φιλοξενεί τα σπερματοζωάρια που παράγονται από τους όρχεις μέχρι να ωριμάσουν αρκετά για να μπορέσουν να γονιμοποιήσουν το θηλυκό ωάριο. Κατά τη διέγερση, αυτά τα κύτταρα απελευθερώνονται από την επιδιδυμίδα στα αγγεία, όπου αναμιγνύονται με το σπερματικό υγρό για να σχηματίσουν σπέρμα, το οποίο θα απελευθερωθεί στον γυναικείο κόλπο κατά την εκσπερμάτωση.