Η αντίσταση στην κλινδαμυκίνη αναφέρεται σε ένα στέλεχος βακτηρίων που κάποτε σκοτώθηκε από την κλινδαμυκίνη αλλά έχει αναπτύξει ανοσία έναντι του φαρμάκου. Ένα βακτήριο είναι ένας ζωντανός οργανισμός, ικανός να προσαρμοστεί στο περιβάλλον του για να επιβιώσει. Η αντιβιοτική θεραπεία σκοτώνει τα ευάλωτα βακτήρια, αλλά παραμένουν ισχυρότερα βακτηριακά στελέχη και αναπτύσσουν τρόπους αντίστασης στις τοξικές επιδράσεις του αντιβιοτικού κλινδαμυκίνης. Καθώς τα βακτήρια πολλαπλασιάζονται και μεταβιβάζουν τις προσαρμοστικές δυνάμεις στους απογόνους τους, ο πληθυσμός των βακτηρίων αναπτύσσει ευρεία αντίσταση στο φάρμακο. Η ικανότητα των βακτηρίων να προσαρμόζονται και να αντιστέκονται στις επιδράσεις της κλινδαμυκίνης ονομάζεται αντίσταση στην κλινδαμυκίνη.
Ένα αντιβιοτικό φάρμακο, η κλινδαμυκίνη αναπτύχθηκε για την καταπολέμηση κοινών λοιμώξεων που προκαλούνται από αναερόβια βακτήρια, όπως η ελονοσία, οι λοιμώξεις του δέρματος, η τοξοπλάσμωση, η περιτονίτιδα, οι λοιμώξεις της αναπνευστικής οδού και οι οδοντικές λοιμώξεις. Αυτές οι ασθένειες είναι σε μεγάλο βαθμό λοιμώξεις που αποκτώνται από την κοινότητα και ως εκ τούτου είναι παρούσες σε πολύ μεγάλους αριθμούς σε ένα πολύ ευρύ φάσμα περιβαλλόντων. Μέσα σε ένα τόσο τεράστιο περιβάλλον, τα βακτήρια που προκαλούν αυτές τις λοιμώξεις έχουν χώρο να προσαρμοστούν και να συμμορφωθούν. Ανάλογα με τον τύπο του βακτηρίου και τη μέθοδο προσαρμογής του, τα βακτήρια είναι σε θέση να εξουδετερώνουν τις επιδράσεις της κλινδαμυκίνης ή να πολλαπλασιάζονται πιο γρήγορα, ώστε να υπερκαλύπτει την αποτελεσματικότητα του φαρμάκου.
Το πρόβλημα της αντοχής στα αντιβιοτικά, συμπεριλαμβανομένης της αντοχής στην κλινδαμυκίνη, έχει γίνει παγκόσμιο ζήτημα υγείας. Οι ασθένειες που κάποτε νικήθηκαν μέσω της αντιβιοτικής θεραπείας βιώνουν ένα κύμα αριθμού, εξαπλώνοντας στον παγκόσμιο πληθυσμό ανεμπόδιστα ή με δαπανηρές και δύσκολες εναλλακτικές θεραπείας. Η λοίμωξη από ανθεκτικό στη μεθικιλλίνη σταφυλόκοκκος (MSRA) ή «υπερβακτηρίδιο» όπως αποκαλείται συχνά, είναι ένα απειλητικό παράδειγμα αντοχής στην κλινδαμυκίνη. Αυτή η κοινή, μεταδοτική λοίμωξη του δέρματος μπορεί να εξελιχθεί σε μια πολύ σοβαρή ασθένεια που καταστρέφει τη σάρκα ή θανατηφόρα. Η μόνη θεραπεία για ορισμένες λοιμώξεις από MSRA είναι η αφαίρεση του άρρωστου τμήματος του σώματος ή ο ακρωτηριασμός ενός προσβεβλημένου άκρου.
Για να αποτρέψουν τις τρομερές συνέπειες της αντοχής στην κλινδαμυκίνη, οι επαγγελματίες του ιατρικού τομέα συμβουλεύουν την αυτοσυγκράτηση στη χρήση αντιβιοτικών και τη σωστή χορήγηση φαρμάκων με αντιβιοτική θεραπεία. Η κλινδαμυκίνη είναι ακατάλληλη για ιογενείς λοιμώξεις όπως το κοινό κρυολόγημα, η γρίπη, η βρογχίτιδα και πολλές λοιμώξεις του αυτιού. Το αντιβιοτικό θα πρέπει να χορηγείται μόνο για το στέλεχος βακτηρίων που επηρεάζει. Οι ασθενείς θα πρέπει να συμπληρώσουν ολόκληρη τη συνταγογραφούμενη δόση για να σκοτώσουν πλήρως όλα τα στελέχη των βακτηρίων στο σώμα.