Η κλινική ανατομία είναι η μελέτη της ανθρώπινης ανατομίας καθώς σχετίζεται με την κλινική πρακτική. Αντί να έχει σχεδιαστεί για να επιτρέπει σε κάποιον να αποκτήσει γενικές ανατομικές γνώσεις, η κλινική ανατομία εστιάζει σε συγκεκριμένες δομές και ζητήματα που μπορεί να αντιμετωπίσουν οι άνθρωποι σε ένα κλινικό περιβάλλον. Πολλοί γιατροί, ιδιαίτερα χειρούργοι, μελετούν συστηματικά κλινική ανατομία και παρακολουθούν μαθήματα επιμόρφωσης, ώστε οι δεξιότητές τους στην ανατομία να παραμένουν υψηλές και να εξοικειωθούν με νέες τεχνικές στον τομέα τους.
Η γενική μελέτη της ανθρώπινης ανατομίας μπορεί να είναι πολύ ωφέλιμη για πολλούς ανθρώπους που εργάζονται στο ιατρικό επάγγελμα, καθώς τους επιτρέπει να εξερευνήσουν τις δομές του σώματος και τον τρόπο με τον οποίο τα συστήματα του σώματος διασυνδέονται μεταξύ τους. Πολλές ιατρικές σχολές απαιτούν από τους μαθητές τους να παρακολουθήσουν ένα μάθημα γενικής ανατομίας στο πρώτο τους έτος και οι φοιτητές ιατρικής ελέγχονται τακτικά σε ανατομικές γνώσεις.
Στην κλινική ανατομία, οι ιατροί λαμβάνουν γενικές δεξιότητες ανατομίας και τις εφαρμόζουν σε συγκεκριμένες κλινικές καταστάσεις. Για παράδειγμα, ένας οφθαλμίατρος βασίζεται στις γνώσεις του για την ανατομία του ματιού για τη διάγνωση και τη θεραπεία ασθενών και μπορεί να χρησιμοποιήσει φωτογραφίες, ανατομικά δείγματα και άλλα μέσα για να παραμείνει εξοικειωμένος με τις δομές του ματιού. Η γνώση της κλινικής ανατομίας επιτρέπει σε κάποιον να λάβει υπόψη μια ανατομική ανωμαλία και χρησιμοποιείται ως οδηγός για κάθε είδους ιατρικές διαδικασίες, από την αντικατάσταση της καρδιακής βαλβίδας μέχρι τον νάρθηκα ενός σπασμένου οστού.
Πολλοί ιατροί συμπληρώνουν τα μαθήματα γενικής ανατομίας με συγκεκριμένα μαθήματα κλινικής ανατομίας καθώς προχωρούν οι σπουδές τους και επιλέγουν ειδικότητες. Οι ιατρικές σχολές και οι ερευνητικές εγκαταστάσεις διοργανώνουν επίσης περιοδικά μαθήματα συνεχούς εκπαίδευσης για ειδικευμένους επαγγελματίες ιατρούς που θέλουν μια ευκαιρία να εργαστούν σε εργαστήριο ανατομίας και να εξερευνήσουν την ανατομία έχοντας κατά νου τις κλινικές τους εμπειρίες. Για παράδειγμα, οι χειρουργοί που ειδικεύονται στην ανακατασκευή του γόνατος μπορεί περιοδικά να ανατέμνουν τα πτωματικά γόνατα για να υπενθυμίζουν στον εαυτό τους όλες τις δομές στο γόνατο και για να εξοικειωθούν με το εύρος των παραλλαγών που μπορεί να δει κανείς στο ανθρώπινο γόνατο.
Οι επαγγελματικές οργανώσεις για τους γιατρούς έχουν συχνά ένα τμήμα κλινικής ανατομίας που δημοσιεύει ένα περιοδικό, διοργανώνει μαθήματα και παρέχει άλλες ευκαιρίες στους γιατρούς να αναλύσουν την ανατομία που σχετίζεται με την ειδικότητά τους. Αυτοί οι οργανισμοί μπορούν επίσης να διεξάγουν έρευνα που έχει σχεδιαστεί για την περαιτέρω γνώση της κλινικής ανατομίας και για την ανάπτυξη νέων τεχνικών, θεραπειών και πρωτοκόλλων υπό το φως αυτής της αυξημένης γνώσης. Η μακροπρόθεσμη μελέτη της κλινικής ανατομίας μπορεί επίσης να παρέχει αποκαλυπτικές πληροφορίες σχετικά με τις τάσεις στην ανθρώπινη υγεία, όπως οι συσσωρεύσεις σωματιδίων που σημειώνονται στους πνεύμονες πολλών κατοίκων των πόλεων.