Η λογιστική υποκαταστημάτων είναι η χρήση πολλών διαφορετικών λογιστικών γραφείων για τον χειρισμό της καταγραφής, της αναφοράς και της διαχείρισης των οικονομικών πληροφοριών μιας εταιρείας. Κάθε λογιστικό σύστημα είναι ξεχωριστό και ανεξάρτητο το ένα από το άλλο σε έναν μεγαλύτερο οργανισμό. Το γραφείο έδρας της μεγάλης οντότητας θα έχει συνήθως έναν λογαριασμό ή τμήμα του κύριου γενικού λογιστικού καθολικού που εμφανίζει τις οικονομικές πληροφορίες από κάθε υποκατάστημα. Ο λογαριασμός στο κύριο καθολικό θα έχει συνήθως ένα περιγραφικό όνομα που υποδεικνύει ποια στοιχεία υποκαταστήματος βρίσκονται στον λογαριασμό.
Πολλοί μεγάλοι οργανισμοί — ή εταιρείες που κατέχονται από το δημόσιο — χρησιμοποιούν κάποια μορφή λογιστικής υποκαταστημάτων στις δραστηριότητές τους. Αυτό βοηθά την εταιρεία να διαχειρίζεται τις οικονομικές πληροφορίες χωρίς να έχει ουσιαστική φυσική παρουσία στις τοποθεσίες των υποκαταστημάτων. Η λογιστική υποκαταστημάτων χρειάζεται συχνά έναν λογιστικό διευθυντή ή επόπτη για να επιβλέπει τις λειτουργίες. Αυτό το άτομο είναι στη συνέχεια υπεύθυνο για την ενημέρωση των πληροφοριών και την ολοκλήρωση ad hoc έργων από το γραφείο στο σπίτι. Ένα όφελος για αυτόν τον τύπο οργάνωσης λογιστικού γραφείου είναι η δυνατότητα αποφυγής της ύπαρξης ελεγκτή ή επικεφαλής οικονομικού διευθυντή σε κάθε τοποθεσία. Αυτές οι θέσεις θα έχουν συχνά υψηλούς μισθούς, αυξάνοντας τα λειτουργικά έξοδα της εταιρείας.
Τα περισσότερα λογιστικά γραφεία υποκαταστημάτων χρησιμοποιούν μια μικρότερη έκδοση του γενικού λογιστικού καθολικού του γραφείου στο σπίτι. Ο κύριος οικονομικός διευθυντής και ο επικεφαλής επιχειρησιακών υπηρεσιών του οργανισμού θα συνεργαστούν και θα δημιουργήσουν τους κανόνες για τη ροή εργασιών λειτουργίας του λογιστικού γραφείου. Αυτό διασφαλίζει ότι το λογιστήριο του υποκαταστήματος μπορεί να καταγράφει με ακρίβεια όλες τις απαραίτητες οικονομικές πληροφορίες. Οι τοποθεσίες των υποκαταστημάτων έχουν συχνά το πρόβλημα των τμημάτων και των τμημάτων που είναι λιγότερο πρόθυμα να συνεργαστούν κατά την επίτευξη των συνολικών στόχων της εταιρείας. Ο λόγος που συμβαίνει αυτό προέρχεται από το ότι το υποκατάστημα βρίσκεται τόσο μακριά από τα βασικά στελέχη της εταιρείας. Οι διευθυντές μπορεί να είναι λιγότερο πρόθυμοι να συνεργαστούν εάν δεν φοβούνται αντίποινα από τους ανωτέρους τους.
Οι έλεγχοι είναι ένα πρωταρχικό εργαλείο που χρησιμοποιείται για τη διατήρηση της ακεραιότητας των λογιστικών γραφείων ή γραφείων μιας εταιρείας. Το γραφείο καταγωγής θα στείλει εσωτερικούς ελεγκτές οι οποίοι θα επανεξετάσουν τις λογιστικές πράξεις για να διασφαλίσουν ότι είναι αποτελεσματικές, ακριβείς και έγκαιρες στην καταγραφή και την αναφορά πληροφοριών. Ανάλογα με την αξιοπιστία των προηγούμενων ελέγχων του γραφείου, η συχνότητα των μελλοντικών ελέγχων μπορεί να είναι αρκετά συχνά εάν ανακαλυφθούν πάρα πολλές παρελθούσες περιπτώσεις κακών λογιστικών πρακτικών. Οι ελεγκτές από το γραφείο στο σπίτι θα διασφαλίσουν επίσης ότι οι λογιστές του υποκαταστήματος ακολουθούν την εσωτερική λογιστική πολιτική της εταιρείας. Αυτοί οι κανόνες συχνά συμπίπτουν ή διευρύνουν τα τρέχοντα εθνικά λογιστικά πρότυπα που χρησιμοποιεί η εταιρεία για την καταγραφή και την αναφορά οικονομικών πληροφοριών.