Η μοριακή ανοσολογία είναι ένα υποπεδίο της ανοσολογίας που στοχεύει να εξετάσει τις ανοσολογικές διεργασίες σε μοριακό επίπεδο. Το ανοσοποιητικό σύστημα είναι το σωματικό σύστημα που ανταποκρίνεται σε ξένες οντότητες, όπως βακτήρια ή άλλους μολυσματικούς παράγοντες στο σώμα. Η ανοσολογική απόκριση που προκαλεί μια τέτοια ξένη οντότητα τείνει να είναι εξαιρετικά συγκεκριμένη. Το σώμα παράγει αντισώματα που είναι ειδικά σχεδιασμένα για να στοχεύουν ένα συγκεκριμένο αντιγόνο ή ξένο σώμα που πυροδοτεί μια ανοσολογική απόκριση, ακριβώς όπως μια μεμονωμένη κλειδαριά τείνει να ταιριάζει με ένα μόνο κλειδί. Το πεδίο της μοριακής ανοσολογίας υπάρχει για να εξετάσει αυτή και άλλες πτυχές της ανοσολογικής απόκρισης που ελέγχονται σε μοριακό επίπεδο.
Οι στόχοι της μοριακής ανοσολογίας ποικίλλουν και χρησιμοποιούνται διάφορες τεχνικές στο πεδίο τόσο σε εργαστηριακό όσο και σε κλινικό περιβάλλον. Η μεγαλύτερη κατανόηση της μοριακής βάσης της λειτουργίας του ανοσοποιητικού έχει επιτρέψει πιο στοχευμένες και αποτελεσματικές μεθόδους διάγνωσης και θεραπείας για ορισμένες ασθένειες. Παρείχε επίσης πολλές νέες πειραματικές μεθόδους που θα χρησιμοποιηθούν σε εργαστήρια μοριακής βιολογίας και μοριακής ανοσολογίας. Ο υψηλός βαθμός εξειδίκευσης των αντισωμάτων είναι ιδιαίτερα σημαντικός, καθώς μπορούν να παραχθούν αντισώματα για να στοχεύσουν σχεδόν οποιοδήποτε βιολογικό συστατικό ενδιαφέροντος. Μπορούν, επομένως, να χρησιμοποιηθούν για την «επισήμανση» ορισμένων κυτταρικών συστατικών ή για να προσδιοριστεί εάν μια συγκεκριμένη ουσία υπάρχει σε ένα δείγμα επειδή θα δεσμευτούν ειδικά με το αντιγόνο που ενδιαφέρει.
Οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ αντισωμάτων και αντιγόνων είναι κεντρικές για τη μοριακή ανοσολογία και για την ανοσολογία συνολικά. Διάφορα κύτταρα του ανοσοποιητικού συστήματος έχουν υποδοχείς που συνδέονται με αντιγόνα στο σώμα και πυροδοτούν μια ανοσολογική απόκριση. Τα αντισώματα παράγονται με περιοχές μοριακής δέσμευσης προσαρμοσμένες ειδικά στο αντιγόνο που ενδιαφέρει. τείνουν να μην δεσμεύονται μη ειδικά σε οτιδήποτε εκτός από το αντιγόνο στο οποίο κατασκευάστηκαν να στοχεύσουν. Τα συστατικά του ανοσοποιητικού συστήματος είναι επίσης σε θέση να εντοπίσουν και να επιτεθούν σε κύτταρα που έχουν υποστεί βλάβη, όπως στην περίπτωση των ιών.
Εκτός από ασθένειες που καταπολεμά το ανοσοποιητικό σύστημα, ο τομέας της μοριακής ανοσολογίας ενδιαφέρεται επίσης για ασθένειες και διαταραχές που επηρεάζουν το ίδιο το ανοσοποιητικό σύστημα. Στην περίπτωση των αυτοάνοσων ασθενειών, για παράδειγμα, το ανοσοποιητικό σύστημα στοχεύει «εαυτά» κύτταρα αντί για αντιγόνα. Σε ορισμένες άλλες διαταραχές και ασθένειες, η αποτελεσματικότητα του ανοσοποιητικού συστήματος μειώνεται, προκαλώντας έτσι μια κατάσταση ανοσοανεπάρκειας. Η αναγνώριση αντιγόνου καθοδηγείται από συγκεκριμένους μοριακούς μηχανισμούς και ακόμη και μικρές αλλαγές στις διαμορφώσεις των δομών των αντιγόνων μπορεί να έχουν σημαντικές επιπτώσεις στην ανοσολογική απόκριση. Οι επιστήμονες που εργάζονται στη μοριακή ανοσολογία ελπίζουν ότι η μεγαλύτερη κατανόηση της μοριακής βάσης της ανοσολογίας θα τους βοηθήσει να καταπολεμήσουν καλύτερα αυτές και άλλες ασθένειες και διαταραχές.