Η σκλήρυνση του ιππόκαμπου είναι μια διαταραχή κατά την οποία τα νευρικά κύτταρα πεθαίνουν και σχηματίζεται ουλώδης ιστός σε μια περιοχή του εγκεφάλου που είναι γνωστή ως ιππόκαμπος. Η πάθηση είναι γνωστό ότι σχετίζεται με περίπου τα τρία τέταρτα των περιπτώσεων επιληψίας του κροταφικού λοβού, μια ασθένεια στην οποία οι άνθρωποι βιώνουν ασυνήθιστες αισθήσεις, μαζί με αλλοιωμένα συναισθήματα και συμπεριφορά, μυϊκούς σπασμούς και μερικές φορές σπασμούς. Παρά την ισχυρή αυτή συσχέτιση, δεν είναι γνωστό εάν η σκλήρυνση του ιππόκαμπου προκαλεί επιληψία του κροταφικού λοβού ή η επιληψία του κροταφικού λοβού προκαλεί σκλήρυνση του ιππόκαμπου. Είναι πιθανό και οι δύο καταστάσεις να συνδέονται με μια άλλη υποκείμενη ανωμαλία.
Ο ιππόκαμπος βρίσκεται σε μια περιοχή του εγκεφάλου που ονομάζεται έσω κροταφικός λοβός, όπου αποτελεί μέρος αυτού που είναι γνωστό ως μεταιχμιακό σύστημα. Ως μέρος του μεταιχμιακού συστήματος, το οποίο ασχολείται με την αίσθηση της όσφρησης, την αίσθηση του φόβου και το σχηματισμό της μακροπρόθεσμης μνήμης, ο ιππόκαμπος εμπλέκεται στο σχηματισμό νέων αναμνήσεων. Θεωρείται επίσης ότι παίζει ρόλο σε αυτό που ονομάζεται χωρική πλοήγηση, μια διαδικασία που εξαρτάται από το ότι τα άτομα είναι σε θέση να θυμούνται και να συγκρίνουν τις τρέχουσες και προηγούμενες θέσεις τους στο περιβάλλον προκειμένου να βρουν τον δρόμο τους. Ενώ η σκλήρυνση σε αυτή την περιοχή του εγκεφάλου συνδέεται συχνότερα με την επιληψία του κροταφικού λοβού, συχνά εμπλέκονται και άλλες δομές στο μεταιχμιακό σύστημα, όπως η αμυγδαλή, η οποία ελέγχει την αίσθηση του φόβου.
Χρησιμοποιώντας μαγνητική τομογραφία (MRI), η κύρια αλλαγή που παρατηρείται στον ιππόκαμπο όταν προσβάλλεται από σκλήρυνση του ιππόκαμπου είναι η μείωση του μεγέθους. Κατά την προβολή δειγμάτων του ιππόκαμπου κάτω από ένα μικροσκόπιο, είναι δυνατό να διαπιστωθεί ότι μεμονωμένα νευρικά κύτταρα έχουν χαθεί και ότι έχουν αναπτυχθεί ουλές. Θεωρείται ότι αυτή η βλάβη μπορεί να προκληθεί από υπερβολικές ποσότητες ορισμένων νευροδιαβιβαστών, των χημικών ουσιών που μεταφέρουν σήματα μεταξύ των νεύρων, που απελευθερώνονται. Αυτοί οι συγκεκριμένοι νευροδιαβιβαστές συνδέονται με ειδικούς υποδοχείς στα νευρικά κύτταρα, προκαλώντας την είσοδο ασβεστίου. Σε περίσσεια, η υπερφόρτωση ασβεστίου οδηγεί σε κυτταρικό θάνατο.
Οι ερευνητές έχουν διερευνήσει εάν οι επιληπτικές κρίσεις μπορεί να προκαλέσουν σκλήρυνση του ιππόκαμπου. Έχει προταθεί ότι οι κρίσεις που εμφανίζονται στην παιδική ηλικία, όπως αυτές που σχετίζονται με τον πυρετό, μπορεί να τραυματίσουν τον εγκέφαλο, να βλάψουν τον ιππόκαμπο και να οδηγήσουν σε επιληψία του κροταφικού λοβού στη μετέπειτα ζωή. Ενώ ορισμένα παιδιά που παρουσιάζουν τέτοιου είδους κρίσεις διαπιστώνεται ότι έχουν σκλήρυνση του ιππόκαμπου αργότερα, τα περισσότερα από αυτά δεν έχουν και δεν είναι δυνατό να γνωρίζουμε εάν η σκλήρυνση αναπτύχθηκε πριν από την πρώτη κρίση. Μια άλλη θεωρία είναι ότι ελαττώματα στον κροταφικό λοβό μπορεί να προδιαθέτουν τα άτομα τόσο σε σκλήρυνση του ιππόκαμπου όσο και σε επιληπτικές κρίσεις. Εναλλακτικά, ένας συνδυασμός κληρονομικών, περιβαλλοντικών και αναπτυξιακών παραγόντων θα μπορούσε να κάνει μερικούς ανθρώπους πιο επιρρεπείς τόσο στην επιληψία όσο και στη σκλήρυνση στον ιππόκαμπο.