Η ουβικιτίνη αναφέρεται στη δέσμευση της πρωτεΐνης ουβικιτίνης με άλλες πρωτεΐνες από τρία διαφορετικά ένζυμα. Μια δοκιμασία ουβικουιτίνης είναι μια δοκιμή που καθορίζει πόσο από αυτή τη διαδικασία συμβαίνει μέσα στο κύτταρο. Μπορούν να χρησιμοποιηθούν δοκιμές για τον προσδιορισμό του τρόπου με τον οποίο διαφορετικές συνθήκες επηρεάζουν τη δέσμευση πρωτεϊνών, τα βήματα και τις δομές που είναι σημαντικά στην οδό ουβικουιτίνης και την ποσότητα πρωτεΐνης στο κύτταρο. Ανεπαρκείς ή υπεράφθονες ποσότητες έχουν συνδεθεί με την ανάπτυξη πολλών διαφορετικών ασθενειών.
Μια πρωτεΐνη που βρίσκεται στα κύτταρα, η λειτουργία της ουβικιτίνης είναι να συνδέεται με πρωτεΐνες ενώ λειτουργεί ως «ετικέτα» ή σήμα σε άλλες δομές. Αυτή η «ετικέτα» στη συνέχεια σηματοδοτεί τα ένζυμα να γνωρίζουν ότι η πρωτεΐνη μπορεί να καταστραφεί, να ανακυκλωθεί ή να μετακινηθεί. Το αποτέλεσμα είναι η καταστροφή ή η μεταφορά πρωτεϊνών.
Αυτές οι πρωτεΐνες σήμανσης είναι σημαντικές για την επιδιόρθωση του DNA, τις ιογενείς λοιμώξεις και την ανοσολογική απόκριση. Άλλες σημαντικές λειτουργίες περιλαμβάνουν ρόλους στον κυτταρικό θάνατο, την κυτταρική διαίρεση και την ανάπτυξη των κυττάρων. Η υπερβολική ποσότητα ουμπικιτίνης ή η έλλειψή της μπορεί να παίζει ρόλο στον σχηματισμό πολλών ασθενειών, όπως ο καρκίνος, οι γενετικές διαταραχές και οι ασθένειες του ανοσοποιητικού συστήματος.
Οι ερευνητές θα χρησιμοποιήσουν μια δοκιμασία ουβικουιτίνης για να προσπαθήσουν να προσδιορίσουν ποιες συνθήκες αλλάζουν τη συγκέντρωση της πρωτεΐνης στο κύτταρο και να συγκρίνουν τα νοσούντα κύτταρα με τα υγιή κύτταρα. Οι επιστήμονες το χρησιμοποιούν επίσης για να διερευνήσουν ποιες συνθήκες θα προκαλέσουν αλλαγές στη δέσμευση. Επιπλέον, μπορεί να προσπαθήσουν να συνδέσουν συγκεκριμένο κώδικα DNA με την ποσότητα των ενζύμων στο κύτταρο.
Υπάρχουν περισσότεροι από ένας τύποι προσδιορισμού ουβικουιτίνης που χρησιμοποιούν ειδικά οι ερευνητές. Κάποιος θα καθορίσει το ποσοστό των πρωτεϊνών που συνδέονται με την ουβικουιντίνη. Ένας άλλος εξετάζει τη δραστηριότητα των ενζύμων ή την παρουσία οποιωνδήποτε άλλων ενδιάμεσων ενώσεων που βρίσκονται στο μονοπάτι ουβικινίωσης. Διαφορετικές αναλύσεις αναπτύσσονται με βάση την πρωτεΐνη-στόχο με την οποία θα συνδεθεί η ουβικιτίνη.
Η βάση μιας δοκιμασίας ουβικουιτίνης είναι η ενσωμάτωση μιας ένωσης που επισημαίνεται χρησιμοποιώντας μια άλλη εύκολα μετρήσιμη χημική ουσία. Σε ογκολογικούς προσδιορισμούς, η ουβικιτίνη μπορεί να επισημανθεί με κρυπτικό, μια ένωση που περιέχει δύο άτομα αζώτου. Αυτό μπορεί να χρησιμοποιηθεί για να προσδιοριστεί ποιο ένζυμο είναι πιο ενεργό στο κύτταρο.
Μια ανάλυση ουβικουϊτινοποίησης θα έχει δύο βήματα. Το πρώτο είναι ένα ενζυματικό στάδιο όπου τα ένζυμα θα δεσμεύσουν την επισημασμένη ουβικιτίνη στην πρωτεΐνη στόχο. Το δεύτερο είναι ένα στάδιο ανίχνευσης στο οποίο η δέσμευση της πρωτεΐνης στόχου εξετάζεται χρησιμοποιώντας ένα συζυγές όπως ένα αντίσωμα. Το αντίσωμα θα φθορίσει ή θα αλλάξει χρώμα, το οποίο στη συνέχεια επιτρέπει στον ερευνητή να προσδιορίσει τη δραστηριότητα των ενζύμων.