Όταν το σώμα επιτίθεται σε ορισμένα μέρη του δικού του θυρεοειδούς αδένα, απόδειξη αυτού μπορεί να βρεθεί με την παρουσία μη φυσιολογικών μορίων που ονομάζονται αντισώματα θυρεοειδικής υπεροξειδάσης (TPO). Άλλοι όροι για αυτές τις ουσίες είναι τα αντιθυρεοειδικά μικροσωματικά αντισώματα ή τα αντισώματα κατά της υπεροξειδάσης. Τα αυξημένα επίπεδα συνδέονται στενότερα με τη θυρεοειδίτιδα Hashimoto, αλλά μπορούν επίσης να παρατηρηθούν με τη νόσο του Graves. Ένα ορισμένο ποσοστό ασυμπτωματικών ατόμων χωρίς προβλήματα θυρεοειδούς βγαίνει θετικό για αυτό το αντίσωμα και αυτά τα άτομα διατρέχουν αυξημένο κίνδυνο να αναπτύξουν ανωμαλίες του θυρεοειδούς στο μέλλον.
Γενικά, η παρουσία αντισωμάτων υπεροξειδάσης του θυρεοειδούς στο αίμα είναι ένα μη φυσιολογικό εύρημα. Τα αντισώματα είναι πρωτεΐνες που παράγονται από το ανοσοποιητικό σύστημα που βοηθούν στην καταπολέμηση βακτηρίων ή άλλων απειλών για την υγεία του σώματος. Αν και το σώμα κανονικά παράγει αντισώματα μόνο έναντι ξένων ουσιών, σε μια συγκεκριμένη κατηγορία ασθενειών που ονομάζονται αυτοάνοσες διαταραχές το σώμα παράγει αντισώματα εναντίον στοιχείων του εαυτού του. Με την παραγωγή των αντισωμάτων TPO, το σώμα παράγει μια πρωτεΐνη που επιτίθεται σε ένα μόριο σημαντικό για τη λειτουργία του θυρεοειδούς, το ένζυμο υπεροξειδάση του θυρεοειδούς. Αυτή η ουσία είναι απαραίτητη για τη δημιουργία θυρεοσφαιρίνης, η οποία είναι μια πρωτεΐνη που μεταφέρει τη θυρεοειδική ορμόνη μέσω του αίματος σε μακρινά μέρη του σώματος.
Ένα θετικό αποτέλεσμα για την παρουσία αντισωμάτων υπεροξειδάσης του θυρεοειδούς εντοπίζεται συχνότερα στην αυτοάνοση θυρεοειδίτιδα, μια κατάσταση γνωστή και ως θυρεοειδίτιδα Hashimoto. Οι ασθενείς με αυτή τη νόσο δημιουργούν αντισώματα που επιτίθενται στον θυρεοειδή αδένα. Τελικά παρουσιάζουν μείωση της παραγωγής της θυρεοειδικής ορμόνης, μια κατάσταση γνωστή ως υποθυρεοειδισμός. Πολλοί γιατροί θεωρούν ότι η εύρεση θετικών αντισωμάτων TPO σε έναν ασθενή που έχει υποθυρεοειδισμό είναι διαγνωστική για τη θυρεοειδίτιδα Hashimoto. Η βασική θεραπεία για αυτήν την πάθηση είναι η παροχή στον ασθενή με συμπληρωματική θυρεοειδική ορμόνη σε μορφή χαπιού.
Η ύπαρξη αντισωμάτων υπεροξειδάσης του θυρεοειδούς σχετίζεται επίσης με μια σειρά από άλλες καταστάσεις. Οι ασθενείς με νόσο του Graves, μια αυτοάνοση διαταραχή του θυρεοειδούς που προκαλεί τον θυρεοειδή να υπερπαράγει τη θυρεοειδική ορμόνη, μπορεί να έχουν αντισώματα υπεροξειδάσης του θυρεοειδούς στο αίμα τους. Ορισμένες μελέτες έχουν δείξει ότι οι γυναίκες που παράγουν αυτό το αντίσωμα διατρέχουν αυξημένο κίνδυνο να αναπτύξουν αναπαραγωγικά προβλήματα όπως πρόωρο τοκετό στην εγκυμοσύνη, αποβολές και στειρότητα.
Μερικοί φυσιολογικοί, ασυμπτωματικοί άνθρωποι μπορεί να έχουν ανιχνεύσιμα επίπεδα αντισωμάτων υπεροξειδάσης του θυρεοειδούς. Έως και 5 έως 10 τοις εκατό του γενικού πληθυσμού θα είχε θετικά αποτελέσματα σε αυτήν την εργαστηριακή εξέταση, εάν ελεγχθεί. Αν και πολλές φορές αυτά τα άτομα δεν έχουν κανένα σύμπτωμα, θα μπορούσαν να κινδυνεύουν να παρουσιάσουν προβλήματα με τη λειτουργία του θυρεοειδούς τους στο μέλλον. Μερικοί γιατροί ελέγχουν αυτό το επίπεδο αντισωμάτων πριν ξεκινήσουν ορισμένα φάρμακα που θα μπορούσαν να οδηγήσουν σε υποθυρεοειδισμό, συμπεριλαμβανομένης της αμιωδαρόνης και του λιθίου, επειδή μπορεί να επιλέξουν να μην χρησιμοποιήσουν αυτά τα φάρμακα σε ασθενείς που ήδη διατρέχουν κίνδυνο να αναπτύξουν προβλήματα με την παραγωγή θυρεοειδικών ορμονών.