Το γλωσσοφαρυγγικό νεύρο ονομάζεται επίσης ένατο κρανιακό νεύρο. Τα κρανιακά νεύρα είναι ζωτικά νεύρα που προέρχονται από τον εγκέφαλο και βοηθούν τον εγκέφαλο να ελέγχει τους μύες, να επεξεργάζεται τις πέντε αισθήσεις και να ελέγχει τους αδένες του σώματος. Όπως υποδηλώνει το όνομά του, το γλωσσοφαρυγγικό νεύρο προέρχεται από τον εγκέφαλο κοντά στη βάση του κρανίου, εξέρχεται από το κρανίο μέσω μιας μεγάλης οπής που ονομάζεται σφαγιτιδικό τρήμα και καταλήγει στο πίσω μέρος του στόματος και του λαιμού. Το γλωσσοφαρυγγικό νεύρο επιτρέπει την αντίληψη της γεύσης στο πιο οπίσθιο τμήμα της γλώσσας, παρέχει την αίσθηση του πόνου και της αφής από το λαιμό και τη γλώσσα και ασκεί έλεγχο στους μύες που χρησιμοποιούνται κατά την κατάποση.
Είναι δύσκολο να αξιολογηθεί μόνο το γλωσσοφαρυγγικό νεύρο, αλλά οι γιατροί συνήθως εξετάζουν το αντανακλαστικό και τη γεύση στο οπίσθιο τμήμα της γλώσσας για να καθορίσουν τη γλωσσοφαρυγγική λειτουργία. Οι μεμονωμένες βλάβες του ένατου νεύρου είναι εξαιρετικά σπάνιες. Οι όγκοι στη διασταύρωση μεταξύ της παρεγκεφαλίδας και της γέφυρας στο εγκεφαλικό στέλεχος μπορούν να βλάψουν το όγδοο νεύρο, το οποίο μεσολαβεί στην ισορροπία και την ακοή, καθώς και στο ένατο νεύρο. Οι μάζες κοντά στο σφαγιτιδικό τρήμα μπορούν να συμπιέσουν το ένατο, δέκατο και ενδέκατο νεύρο. Η διφθερίτιδα μπορεί να προκαλέσει παράλυση του ένατου νεύρου. Οι κρίσεις απώλειας των αισθήσεων που σχετίζονται με την κατάποση, που ονομάζεται συγκοπή κατάποσης, είναι σπάνιες επιπλοκές των βλαβών του ένατου και του δέκατου νεύρου.
Οι ανωμαλίες του γλωσσοφαρυγγικού νεύρου προκαλούν δυσκολία στην κατάποση. Οι προσβεβλημένοι ασθενείς θα παρατηρήσουν μειωμένη γεύση στο οπίσθιο ένα τρίτο της γλώσσας και της υπερώας. Μπορεί να υπάρχει μειωμένη αίσθηση στην αφή ή πόνος στο οπίσθιο τμήμα της γλώσσας, του ουρανίσκου και του λαιμού. Το αντανακλαστικό φίμωσης απουσιάζει σε αυτές τις περιπτώσεις. Η δυσλειτουργία της παρωτίδας οδηγεί σε μειωμένη παραγωγή σάλιου και ξηροστομία.
Με περιόδους που διαρκούν από δευτερόλεπτα έως λεπτά, η γλωσσοφαρυγγική νευραλγία είναι μια κατάσταση κατά την οποία εμφανίζονται επαναλαμβανόμενες κρίσεις βασανιστικού πόνου στο αυτί, το λαιμό, τις αμυγδαλές και τη γλώσσα. Η αιτία της νευραλγίας είναι ο ερεθισμός του γλωσσοφαρυγγικού νεύρου λόγω πίεσης από κοντινά αιμοφόρα αγγεία, όγκους, αναπτύξεις ή μολύνσεις στη βάση του κρανίου, στο στόμα ή στο λαιμό. Οι δραστηριότητες που προκαλούν τις περιόδους πόνου περιλαμβάνουν την κατάποση, την ομιλία, το γέλιο, τον βήχα ή το μάσημα. Ο αργός καρδιακός παλμός και η λιποθυμία έχουν εμφανιστεί με έντονα επώδυνα επεισόδια. Όταν μια χειρουργική θεραπεία δεν είναι προφανής, τα φάρμακα κατά των επιληπτικών κρίσεων, όπως η γκαμπαπεντίνη, η φαινυτοΐνη και η καρβαμαζεπίνη, και ορισμένα αντικαταθλιπτικά, όπως η αμιτριπτυλίνη, είναι αποτελεσματικά στη διαχείριση των συμπτωμάτων.
Σε νευροχειρουργικές επεμβάσεις κοντά στη βάση του κρανίου, υπάρχει κίνδυνος τραυματισμών του κρανιακού νεύρου, συμπεριλαμβανομένου του γλωσσοφαρυγγικού νεύρου, ο οποίος μπορεί να αποφευχθεί με παρακολούθηση κατά τη διάρκεια του περιστατικού. Η ηλεκτρική διέγερση των νευρικών κορμών και οι ηλεκτρομυογραφικές καταγραφές διευκολύνουν την αναγνώριση των κρανιακών νεύρων πριν από την έναρξη της επέμβασης. Αυτές οι τεχνικές παρακολουθούν επίσης τα κρανιακά νεύρα κατά τη χειρουργική αφαίρεση όγκων που βρίσκονται στη βάση του κρανίου. Καθώς η αφαίρεση του όγκου προχωρά, ο χειρουργός μπορεί να βεβαιωθεί ότι δεν θα συμβεί χειρουργικό τραύμα στο νεύρο παρατηρώντας για αλλαγές σχετικά με το μέγεθος, το σχήμα και το περίγραμμα των αποκρίσεων.