Οι ωκεανοί σχηματίζουν ένα τεράστιο θαλάσσιο περιβάλλον που καλύπτει πάνω από το 70 τοις εκατό της επιφάνειας της γης. Μέσα σε αυτό το τεράστιο σκηνικό, βρίσκεται ένα ευρύ φάσμα οικοτόπων, από πλημμυρικές κοινότητες κοντά στην ακτή έως βαθιές, κρύες ωκεάνιες τάφρους, που για πολύ καιρό θεωρούνταν ότι στερούνται ζωής. Παρόλο που δεν χωρίζονται σε βιομάδια όπως είναι τα ενδιαιτήματα της ξηράς, ο βιότοπος των ωκεανών χωρίζεται σε περιοχές και ενδιαιτήματα με βάση το βάθος του νερού και άλλα χαρακτηριστικά. Δύο μεγάλα τμήματα είναι τα παράκτια ενδιαιτήματα, που κυμαίνονται από την ακτογραμμή μέχρι την άκρη της υφαλοκρηπίδας και το ανοιχτό ωκεάνιο περιβάλλον, που περιλαμβάνει την περιοχή που εκτείνεται πέρα από την υφαλοκρηπίδα. Μέσα σε μια κατακόρυφη στήλη από νερά του ωκεανού, τα ενδιαιτήματα μπορούν να χωριστούν σε πελαγικούς και βυθόμενους βιότοπους κοντά στην επιφάνεια.
Αν και μερικοί από τους ίδιους παράγοντες επηρεάζουν τον ωκεάνιο βιότοπο που επηρεάζουν το χερσαίο περιβάλλον, πολλοί παράγοντες είναι μοναδικοί για το θαλάσσιο περιβάλλον. Η δράση των κυμάτων και οι παλίρροιες μπορούν να κάνουν το περιβάλλον κοντά στην ακτή ένα σκληρό περιβάλλον με πολύ διαφορετικές συνθήκες. Η αλατότητα κυμαίνεται από τους βιότοπους των εκβολών όπου το αλμυρό νερό της θάλασσας συνδυάζεται με το γλυκό νερό μέχρι την πιο σταθερή αλατότητα του ενδιαιτήματος των ανοιχτών ωκεανών. Τα ρεύματα επηρεάζουν τη θερμοκρασία και τη διαθεσιμότητα τροφής σε πολλά από τα υποβρύχια ενδιαιτήματα. Η ποσότητα φωτός που διεισδύει στο νερό καθορίζει εάν το φυτοπλαγκτόν και τα ωκεάνια φυτά μπορούν να επιβιώσουν και να αποτελέσουν τη βάση των διαφόρων τροφικών αλυσίδων.
Βυθικοί ή βενθικοί βιότοποι βρίσκονται στον πυθμένα των ωκεανών. Χωρίζονται σε ρηχά παράκτια βενθικά και βενθικά ενδιαιτήματα βαθιάς ωκεανού που βρίσκονται πέρα από την υφαλοκρηπίδα. Οι κοραλλιογενείς ύφαλοι είναι ένας βενθικός βιότοπος σε ρηχά, ζεστά νερά όπου διαπερνά άφθονο φως. Γνωστό για τη μεγάλη βιοποικιλότητά τους, αυτός ο βιότοπος των ωκεανών εξαρτάται από τις κοραλλιογενείς αποικίες που χτίζουν υφάλους. Μέσα στον ύφαλο, βρέθηκαν μικροπεριβάλλοντα που υποστηρίζουν ξεχωριστές κοινότητες στο μπροστινό μέρος του υφάλου, όπου η δράση κύματος είναι μεγαλύτερη και στις πιο ήρεμες περιοχές πίσω από τον ύφαλο.
Ένας πολύ διαφορετικός τύπος βενθικού οικοτόπου βρίσκεται στις αβυσσαλέες πεδιάδες του βαθύ βυθού του ωκεανού. Εδώ, κανένα φως δεν διεισδύει και φυτά δεν βρίσκονται. Οι οργανισμοί που ζουν σε αυτόν τον βιότοπο των ωκεανών είναι κατά κύριο λόγο τρώγοντες πετρίτων, που ζουν από την οργανική ύλη που επιπλέει στον πυθμένα της θάλασσας. Λίγο μελετημένη λόγω των δυσκολιών που εμπλέκονται, αυτή η βαθιά περιοχή πιστεύεται ότι είναι πλούσια σε βιοποικιλότητα. Η χημειοσύνθεση αποτελεί τη βάση της ζωής στα μοναδικά περιβάλλοντα που βρίσκονται κοντά σε ψυχρές διαρροές και υδροθερμικούς αεραγωγούς.
Δάση από φύκια και αγκυροβολημένα κελβάρια υπάρχουν σε παράκτιες ζώνες όπου αρκετό φως διαπερνά το νερό για να υποστηρίξει τη ζωή των φυτών. Αυτά τα ενδιαιτήματα βρίσκονται κυρίως σε πολικές και εύκρατες ζώνες. Πλούσιοι βιότοποι που υποστηρίζουν ποικίλες κοινότητες θαλάσσιων πλασμάτων, τα δάση των φύτρων παρέχουν ένα κατακόρυφο υποβρύχιο περιβάλλον. Αυτό κυμαίνεται από το θόλο στην επιφάνεια έως το βενθικό περιβάλλον στη βάση του δάσους των φύλλων, κάθε ζώνη υποστηρίζει μια μοναδική κοινότητα οργανισμών. Αυτός ο βιότοπος των ωκεανών έχει ερευνηθεί εκτενώς και είναι επίσης οικονομικά σημαντικός.