Η βάση του κρανίου χωρίζεται σε τρεις κρανιακούς τρύπους: οπίσθιο, μεσαίο και πρόσθιο. Ο οπίσθιος βόθρος, ή ο οπίσθιος κρανιακός βόθρος, είναι ο βαθύτερος και μεγαλύτερος και ορίζεται από το ινιακό οστό του κρανίου. Μέσα σε αυτόν τον τρύπα υπάρχουν δύο κρίσιμες περιοχές του εγκεφάλου: το στέλεχος του εγκεφάλου και η παρεγκεφαλίδα. Αυτές οι περιοχές του εγκεφάλου ελέγχουν το αυτόνομο νευρικό σύστημα, τον συντονισμό και την κίνηση. Τα κρανιακά νεύρα VII έως XII εξέρχονται από το κρανίο μέσω του οπίσθιου τρύπα, ενώνοντας τον νωτιαίο μυελό και συνδέοντας τον εγκέφαλο με το υπόλοιπο σώμα.
Βρέθηκε στον οπίσθιο βόθρο και το στέλεχος του εγκεφάλου. Αποτελείται από τον μεσαίο εγκέφαλο, τους πόνους και το μυελό. Το στέλεχος του εγκεφάλου περιέχει βασικά κρανιακά νεύρα συμπεριλαμβανομένου του νεύρου του προσώπου, του γλωσσοφαρυγγικού νεύρου, του κόλπου, του βοηθητικού νεύρου και του υπογλωσσικού νεύρου. Το στέλεχος του εγκεφάλου είναι υπεύθυνο για τις ζωτικές αυτόνομες λειτουργίες της αναπνοής, των καρδιακών παλμών, της αρτηριακής πίεσης, της πέψης, της εφίδρωσης και της σιελόρροιας. Η βλάβη στο κρανίο στην περιοχή μπορεί να οδηγήσει σε θάνατο ή μόνιμη αναπηρία.
Η παρεγκεφαλίδα είναι η περιοχή του εγκεφάλου που είναι υπεύθυνη για την κίνηση, την ισορροπία και τον συντονισμό. Μέσα στον οπίσθιο βόθρο, η παρεγκεφαλίδα χωρίζεται σε δύο ημισφαίρια που χωρίζονται από μια λεπτή περιοχή που ονομάζεται vermis. Μέσω του νωτιαίου μυελού, η παρεγκεφαλίδα λαμβάνει πληροφορίες από τους μυς και στέλνει πληροφορίες στους μυς. Αυτός ο αισθητήριος βρόχος παρέχει ιδιόκτητες και κιναισθητικές πληροφορίες – πληροφορίες που σχετίζονται με την κίνηση, την ισορροπία, τη θέση και τον πόνο. Αυτός ο εξαιρετικά ρυθμισμένος βρόχος ανατροφοδότησης επιτρέπει στους χορευτές και τους αθλητές να αναπτύξουν εκπληκτικό έλεγχο των μυών.
Ο νωτιαίος μυελός περνά μέσα από το foramen magnum, ένα κεντρικό άνοιγμα στον οπίσθιο βόθρο. Οι βαθιές αυλακώσεις σε αυτόν τον βόθρο περιέχουν επίσης τους εγκάρσιους κόλπους και τους σιγμοειδείς κόλπους. Αυτοί οι κόλποι είναι φλέβες που συλλέγουν αίμα από τον εγκέφαλο και του επιτρέπουν να ανακυκλοφορεί μέσω της καρδιάς.
Πολλές ασθένειες που επηρεάζουν τον εγκέφαλο μπορεί να εμφανιστούν στην περιοχή. Ο καρκίνος σε αυτήν την περιοχή είναι συχνά πρωτογενής και μπορεί να προκύψει από τον ίδιο τον εγκέφαλο, τα κρανιακά νεύρα, τις μήνιγγες ή το κρανίο. Αυτοί οι καρκινικοί όγκοι είναι πιο συνηθισμένοι στα παιδιά και αποτελούν την πλειοψηφία των παιδικών όγκων του εγκεφάλου. Οι όγκοι που αναπτύσσονται σε αυτήν την περιοχή μπορούν να εμποδίσουν τη ροή του νωτιαίου υγρού, προκαλώντας αυξημένη πίεση στον εγκέφαλο και το στέλεχος του εγκεφάλου. Οι λοιμώξεις στο κεφάλι και το λαιμό μπορούν να εξαπλωθούν και στον οπίσθιο βόθρο, και τα εγκεφαλικά επεισόδια ή οι αιμορραγίες δεν είναι σπάνιες στην παρεγκεφαλίδα ή στο στέλεχος του εγκεφάλου εξαιτίας των κυριότερων αιμοφόρων αγγείων που διέρχονται από αυτόν τον βόθρο.