Στις Ηνωμένες Πολιτείες, όπως και σε πολλά άλλα έθνη, υπάρχει μια σειρά κανόνων που διέπουν την επίδειξη και τη διάθεση της εθνικής σημαίας. Αυτοί οι κανόνες αναφέρονται ως πρωτόκολλο σημαίας. Αν και η παραβίαση αυτών των κανόνων δεν έχει νομικές επιπτώσεις, ελπίζουμε ότι θα ενθαρρύνουν τον σεβασμό της σημαίας. Περισσότερο από ένα κομμάτι ύφασμα, μια εθνική σημαία αντιπροσωπεύει το έθνος ως σύνολο και είναι ένα σημαντικό σύμβολο της εθνικής ταυτότητας. Το ακόλουθο πρωτόκολλο σημαίας ισχύει για την εμφάνιση της αμερικανικής σημαίας εντός των Ηνωμένων Πολιτειών. Άλλα έθνη έχουν τα δικά τους πρωτόκολλα που περιλαμβάνουν την επίδειξη της εθνικής τους σημαίας, μαζί με τις σημαίες άλλων εθνών.
Γενικά, οι κανόνες του πρωτοκόλλου σημαίας είναι πολύ απλοί και εύκολο να ακολουθηθούν. Στις περισσότερες περιπτώσεις, ο σεβασμός χειρισμός της σημαίας περιλαμβάνει μέτρα κοινής λογικής, όπως να μην της επιτρέπεται να αγγίξει το έδαφος. Αν δεν κυματίζει μια σημαία κοντά σε μαχητές γείτονες, οι μικρές παραβιάσεις είναι απίθανο να προκαλέσουν οργή, ειδικά καθώς η σημαία κυματίζει συχνά με ευγενή πρόθεση.
Σύμφωνα με το πρωτόκολλο της αμερικανικής σημαίας, μια αμερικανική σημαία δεν πρέπει ποτέ να επιτρέπεται να αγγίζει το έδαφος. Εάν η σημαία ακουμπήσει κατά λάθος το έδαφος, θα πρέπει να πλυθεί απαλά με σαπούνι και νερό. Όταν εμφανίζεται σε εξωτερικό χώρο, εάν η σημαία βρίσκεται στη μέση ενός δρόμου, θα πρέπει να αναρτηθεί με την ένωση ή το πεδίο των αστεριών, στραμμένο είτε προς τα βόρεια είτε προς τα ανατολικά, ανάλογα με τη χάραξη του δρόμου. Όταν εμφανίζεται από ένα κτίριο, η σημαία θα πρέπει να εμφανίζεται πρώτα ως ένωση.
Η αμερικανική σημαία δεν πρέπει ποτέ να κρέμεται χαμηλότερα από τη σημαία άλλου έθνους. Εάν η αμερικανική σημαία κυματίζει με άλλες εθνικές σημαίες, οι σημαίες θα πρέπει να κυματίζουν στο ίδιο ύψος και να έχουν το ίδιο μέγεθος. Εάν η αμερικανική σημαία εμφανίζεται με κρατικές ή άλλες σημαίες, θα πρέπει να κυματίζει ψηλότερα και θα πρέπει να υψώνεται πρώτη και να χαμηλώνει τελευταία. Εάν εμφανίζεται κατά τη διασταύρωση των ραβδιών με άλλη σημαία, το ραβδί από το οποίο αναρτάται η αμερικανική σημαία θα πρέπει να τοποθετείται πάνω από το άλλο ραβδί και η αμερικανική σημαία θα πρέπει να βρίσκεται στα αριστερά του θεατή.
Το πρωτόκολλο σημαίας υπαγορεύει επίσης ότι οι σημαίες δεν θα πρέπει να κυματίζουν τη νύχτα, εκτός εάν φωτίζονται σωστά, και ότι όταν η σημαία κυματίζει με μισό προσωπικό, πρέπει πρώτα να υψώνεται πλήρως και στη συνέχεια να χαμηλώνει στο μισό προσωπικό. Όταν κυματίζει ανάποδα, η σημαία είναι σύμβολο αγωνίας. Όταν εμφανίζεται πάνω από ένα φέρετρο, η σημαία πρέπει να είναι ντυμένη έτσι ώστε η ένωση να βρίσκεται στην επάνω αριστερή γωνία και δεν πρέπει να επιτρέπεται να αγγίζει το έδαφος ή να χαμηλώνει στον τάφο.
Η αμερικανική σημαία δεν πρέπει να γράφεται πάνω ή να αλλοιώνεται με άλλο τρόπο και δεν πρέπει να αφήνεται να κουρελιαστεί ή να λερωθεί. Για το λόγο αυτό, πολλές εταιρείες κατασκευάζουν παντός καιρού σημαίες που έχουν σχεδιαστεί για να αντέχουν σε κακές καιρικές συνθήκες. Εάν μια σημαία κυματίζει σε εξωτερικούς χώρους και εκτίθεται στο ηλιακό φως και τη βροχή, θα πρέπει να αγοράσετε μια σημαία παντός καιρού. Εάν μια σημαία καταστραφεί, θα πρέπει να απορριφθεί σωστά. Η σωστή μέθοδος απόρριψης μιας αμερικανικής σημαίας είναι η καύση με σεβασμό. Ορισμένοι οργανισμοί δημόσιας υπηρεσίας, όπως η Αμερικανική Λεγεώνα, οι Βετεράνοι Ξένων Πολέμων, οι Άλκες και οι Πρόσκοποι είναι πρόθυμοι να βοηθήσουν με τη σωστή διάθεση των σημαιών.