Το σκουαλένιο είναι ένα φυσικό μόριο που παράγουν οι άνθρωποι και πολλοί άλλοι οργανισμοί. Οι άνθρωποι το απαιτούν ως πρώτη ύλη για βασικές ενώσεις όπως οι ορμόνες, και μπορεί να βρεθεί σε ορισμένα τρόφιμα, καλλυντικά και φαρμακευτικά προϊόντα. Εμπορικά, γενικά εξάγεται από συκώτια καρχαρία και άλλα ψάρια. Οι δίαιτες πλούσιες στην ένωση μπορεί επίσης να μειώσουν τη χοληστερόλη. Οι ανησυχίες ότι η συμπερίληψη της ουσίας στα εμβόλια είναι επικίνδυνη για την υγεία δεν υποστηρίζονται από τον Παγκόσμιο Οργανισμό Υγείας (ΠΟΥ) ή τον Οργανισμό Τροφίμων και Φαρμάκων των ΗΠΑ (FDA).
Τα ζώα, συμπεριλαμβανομένων των ανθρώπων, παράγουν την ουσία στο ήπαρ. Ταξιδεύει στην κυκλοφορία του αίματος και το σώμα το χρησιμοποιεί για να παράγει τις απαραίτητες ορμόνες και άλλες ενώσεις. Η χοληστερόλη είναι το ενδιάμεσο βήμα μεταξύ του σκουαλενίου και μορίων όπως τα οιστρογόνα, η κορτιζόλη, ακόμη και η βιταμίνη D.
Αυτό το συγκεκριμένο μόριο ξεπλένεται επίσης από το σώμα στα δακτυλικά μας αποτυπώματα. Τα συκώτια των ψαριών όπως οι καρχαρίες είναι πλούσια σε υλικό, και εδώ είναι όπου οι βιομηχανίες αναζητούν τις πηγές τους. Εκτός από τα συκώτια, υπάρχει και στα αυγά, το κρέας και τη μαγιά.
Τα φυτά παράγουν επίσης την ουσία. Για παράδειγμα, το ελαιόλαδο περιέχει 0.7% σκουαλένιο. Τα οφέλη για την υγεία που συνδέονται με την πλούσια σε ελαιόλαδο διατροφή των μεσογειακών χωρών μπορεί να οφείλονται σε αυτό το χαρακτηριστικό του λαδιού. Οι επιχειρήσεις υγιεινής διατροφής το πωλούν ως «έλαιο από συκώτι καρχαρία». Ορισμένα καλλυντικά περιέχουν το υλικό, όπως και ορισμένα φάρμακα.
Σύμφωνα με τον FDA, η συγκέντρωση του σκουαλενίου στο αίμα είναι γενικά στα 250 μέρη ανά δισεκατομμύριο (250 νανογραμμάρια ανά χιλιοστόλιτρο). Οι ανησυχίες ότι το σκουαλένιο στα εμβόλια δημιουργεί κινδύνους για την υγεία δεν τεκμηριώνονται από τον ΠΟΥ ή τον FDA, από το 2011. Ο ΠΟΥ λέει ότι ένα συγκεκριμένο εμβόλιο, το οποίο χορηγείται σε ευρωπαϊκές χώρες, παρέχει μια δόση 10 χιλιοστόγραμμα σκουαλενίου μαζί με το αντιγόνο και ότι αυτό το εμβόλιο δεν παρουσίασε σοβαρές παρενέργειες από τότε που πρωτοπαρήχθη το 1997.
Το υλικό χρησιμοποιείται σε ορισμένα εμβόλια για να βοηθήσει το ανοσοποιητικό σύστημα να αναγνωρίσει τον εμβολιασμό πιο αποτελεσματικά. Από μόνο του, δεν είναι αποτελεσματικό, αλλά όταν αναμιγνύεται σε γαλάκτωμα με άλλες ουσίες, είναι. Ένα θέμα που έχουν οι αγωνιστές εμβολίων με το σκουαλένιο είναι ότι οι στρατιώτες στους οποίους είχε γίνει ένεση με εμβόλιο άνθρακα και οι οποίοι στη συνέχεια ανέπτυξαν προβλήματα υγείας εμφάνισαν αντισώματα στην ουσία στο αίμα τους. Είναι πλέον γνωστό, ωστόσο, ότι όλοι έχουν αντισώματα κατά του σκουαλενίου, τα οποία αυξάνονται με την ηλικία, και ότι το εν λόγω εμβόλιο κατά του άνθρακα δεν περιείχε αρχικά καμία από την ουσία. Οι δοκιμές που έδειξαν χαμηλά επίπεδα σκουαλενίου στα εμβόλια μπορεί να έχουν μολυνθεί από εργαστηριακά γυάλινα σκεύη με δακτυλικά αποτυπώματα πάνω τους.